247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2489 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2489  Aldose 1-epimerase  100 
 
 
308 aa  619  1e-176  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1225  Aldose 1-epimerase  54.36 
 
 
302 aa  313  1.9999999999999998e-84  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1278  Aldose 1-epimerase  52.84 
 
 
307 aa  296  2e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.265427  normal  0.286232 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0225  galactose mutarotase  43.23 
 
 
314 aa  235  8e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000500571  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0226  galactose mutarotase  40.98 
 
 
318 aa  226  3e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00706113  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12920  galactose mutarotase-like enzyme  41.69 
 
 
321 aa  207  1e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0901551  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2454  aldose 1-epimerase  43.33 
 
 
307 aa  207  2e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1836  Aldose 1-epimerase  41.75 
 
 
315 aa  204  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4435  Aldose 1-epimerase  41.1 
 
 
303 aa  201  9.999999999999999e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.340797 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8681  Aldose 1-epimerase  39.73 
 
 
303 aa  196  5.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626175  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2973  Aldose 1-epimerase  39.26 
 
 
303 aa  192  7e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000377273  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1019  Aldose 1-epimerase  37.37 
 
 
299 aa  191  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.584137  hitchhiker  0.000443551 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2997  Aldose 1-epimerase  39.39 
 
 
302 aa  191  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1674  aldose 1-epimerase  40.13 
 
 
325 aa  190  2e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.416242  hitchhiker  0.00123529 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2432  aldose 1-epimerase  38.83 
 
 
301 aa  187  3e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0573284  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3398  aldose 1-epimerase  39.19 
 
 
294 aa  187  3e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.226465  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3303  putative aldose-1-epimerase  37.76 
 
 
297 aa  185  6e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.575493 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2182  Aldose 1-epimerase  38.78 
 
 
299 aa  185  9e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000157648 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0514  aldose 1-epimerase  39.32 
 
 
327 aa  185  9e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.165305  decreased coverage  0.000622322 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0426  aldose 1-epimerase  39.32 
 
 
308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1267  Aldose 1-epimerase  38.1 
 
 
301 aa  182  8.000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.560353  hitchhiker  0.00115827 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1235  Aldose 1-epimerase  37.54 
 
 
319 aa  178  1e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000417318 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05040  galactose mutarotase-like enzyme  36.69 
 
 
323 aa  168  1e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.556037  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1163  aldose 1-epimerase  34.92 
 
 
323 aa  167  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.887027  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0523  Aldose 1-epimerase  40.34 
 
 
290 aa  167  2.9999999999999998e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0866  Aldose 1-epimerase  39.24 
 
 
306 aa  161  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104082  normal  0.0514904 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1522  Aldose 1-epimerase  36.79 
 
 
293 aa  160  2e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1083  putative aldose-1-epimerase  37.12 
 
 
305 aa  160  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.145719  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1897  aldose 1-epimerase  36.33 
 
 
290 aa  159  4e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5326  aldose-1-epimerase family protein  32.45 
 
 
300 aa  156  4e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.6155 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4402  aldose-1-epimerase family protein  32.12 
 
 
300 aa  156  4e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03764  predicted aldose-1-epimerase  32.12 
 
 
308 aa  153  4e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4107  Aldose 1-epimerase  32.12 
 
 
308 aa  153  4e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03713  hypothetical protein  32.12 
 
 
308 aa  153  4e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33650  galactose mutarotase-like enzyme  36.61 
 
 
318 aa  151  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4408  aldose-1-epimerase family protein  32.75 
 
 
280 aa  149  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4230  aldose-1-epimerase family protein  32.39 
 
 
280 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4297  aldose-1-epimerase family protein  31.16 
 
 
295 aa  146  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4343  aldose-1-epimerase family protein  31.16 
 
 
295 aa  146  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4252  aldose-1-epimerase family protein  31.16 
 
 
295 aa  146  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0044  Aldose 1-epimerase  34.31 
 
 
311 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4264  aldose-1-epimerase family protein  31.46 
 
 
299 aa  144  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0854  Aldose 1-epimerase  33.45 
 
 
300 aa  137  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0393175  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0726  Aldose 1-epimerase  31.23 
 
 
328 aa  111  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27460  galactose mutarotase-like enzyme  32.57 
 
 
334 aa  107  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3046  Aldose 1-epimerase  23.91 
 
 
345 aa  93.6  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.813423  normal  0.148483 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0559  Aldose 1-epimerase  25.17 
 
 
262 aa  89.4  7e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.480763  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5039  Aldose 1-epimerase  25.93 
 
 
312 aa  87.8  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1930  Aldose 1-epimerase  30 
 
 
316 aa  86.7  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.263285  normal  0.479856 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1127  aldose 1-epimerase  26.48 
 
 
269 aa  86.7  5e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0176464  normal  0.584187 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0950  Aldose 1-epimerase  28.83 
 
 
311 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0322782 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4338  hypothetical protein  29.25 
 
 
310 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0383  Aldose 1-epimerase  29.13 
 
 
302 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0656  aldose-1-epimerase  23.92 
 
 
314 aa  79.7  0.00000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.629793  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0149  Aldose 1-epimerase  29.84 
 
 
336 aa  79  0.00000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0125238 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1015  Aldose 1-epimerase  28.17 
 
 
311 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2178  Aldose 1-epimerase  28.21 
 
 
329 aa  76.6  0.0000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1458  aldose 1-epimerase  27.05 
 
 
263 aa  73.9  0.000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0696  Aldose 1-epimerase  26.86 
 
 
306 aa  73.6  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00129327 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2372  aldose 1-epimerase  30.04 
 
 
309 aa  72  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6330  aldose 1-epimerase  31.64 
 
 
362 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2660  aldose 1-epimerase  21.68 
 
 
306 aa  70.5  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0844306  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4134  aldose 1-epimerase  25.98 
 
 
295 aa  70.1  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4362  aldose 1-epimerase family protein  25.98 
 
 
295 aa  70.1  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0324  Aldose 1-epimerase  25.5 
 
 
299 aa  69.3  0.00000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.296431 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0628  aldose 1-epimerase  31.72 
 
 
282 aa  68.6  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.48408  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4109  aldose 1-epimerase family protein  25.49 
 
 
295 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0163943  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2583  Aldose 1-epimerase  31.18 
 
 
294 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1585  Aldose 1-epimerase  25.91 
 
 
305 aa  67.8  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.92898  normal  0.309256 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6030  aldose 1-epimerase  31.25 
 
 
362 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808799  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2993  Aldose 1-epimerase  30.65 
 
 
294 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.778062  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0702  Aldose 1-epimerase  26.34 
 
 
318 aa  67.4  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4205  aldose 1-epimerase  31.52 
 
 
362 aa  67  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613008  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0655  aldose 1-epimerase  30.04 
 
 
356 aa  66.2  0.0000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0630  aldose 1-epimerase  30.04 
 
 
356 aa  66.2  0.0000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0270  galactose mutarotase related enzyme  28.45 
 
 
291 aa  65.9  0.0000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.117354  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2241  Aldose 1-epimerase  22.54 
 
 
291 aa  65.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.61015 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2624  aldose 1-epimerase  26.88 
 
 
371 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0912  aldose 1-epimerase  32.21 
 
 
295 aa  65.5  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2344  aldose 1-epimerase  30.04 
 
 
363 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.145267 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1083  hypothetical protein  32.86 
 
 
323 aa  63.9  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000316766  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2754  hypothetical protein  35.24 
 
 
296 aa  63.5  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.494847  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0142  aldose 1-epimerase  32.38 
 
 
353 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0279  putative aldose 1-epimerase  27.59 
 
 
291 aa  63.5  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.869642  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0625  aldose 1-epimerase  32.38 
 
 
353 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417593  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3760  Aldose 1-epimerase  23 
 
 
290 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00879497  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1503  Aldose 1-epimerase  31.22 
 
 
317 aa  63.5  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.72169 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0593  aldose 1-epimerase  32.38 
 
 
353 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.112152 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3707  Aldose 1-epimerase  23 
 
 
290 aa  63.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4277  aldose 1-epimerase  23.83 
 
 
289 aa  63.2  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.436668 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6635  Aldose 1-epimerase  28.83 
 
 
361 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.779767  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4072  Aldose 1-epimerase  31.25 
 
 
360 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2798  aldose 1-epimerase  33.16 
 
 
321 aa  61.2  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0550  aldose 1-epimerase  31.43 
 
 
353 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0177374  normal  0.655719 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0526  aldose 1-epimerase  31.43 
 
 
353 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1024  galactose mutarotase-like protein  22.35 
 
 
298 aa  61.2  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.353327  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0173  galactose mutarotase-like protein  29.01 
 
 
294 aa  61.2  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000630537  hitchhiker  0.00000000000000230696 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4184  Aldose 1-epimerase  31.25 
 
 
360 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5831  aldose 1-epimerase  32.08 
 
 
293 aa  61.2  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0718685  normal  0.204267 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1210  aldose 1-epimerase  29.94 
 
 
347 aa  61.6  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00282737  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>