270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2106 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_2106  methyltransferase type 12  100 
 
 
436 aa  879    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3443  methyltransferase type 12  66.28 
 
 
436 aa  573  1.0000000000000001e-162  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0605302 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3396  methyltransferase type 12  67.58 
 
 
439 aa  539  9.999999999999999e-153  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5381  methyltransferase type 11  55.4 
 
 
438 aa  413  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.554977 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4081  methyltransferase type 12  29.38 
 
 
456 aa  137  4e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000110716 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  27.64 
 
 
561 aa  137  4e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  27.64 
 
 
561 aa  136  9e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2825  Methyltransferase type 12  28.64 
 
 
436 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0529  Methyltransferase type 11  29.4 
 
 
444 aa  126  8.000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0030  methyltransferase type 12  34.52 
 
 
324 aa  125  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0157  methyltransferase type 12  35.96 
 
 
338 aa  123  5e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0701135  normal  0.868895 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3430  Methyltransferase type 12  34.62 
 
 
329 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.723258  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1472  methyltransferase type 12  33.66 
 
 
308 aa  112  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  24.23 
 
 
577 aa  111  3e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  24.51 
 
 
577 aa  110  7.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1075  methyltransferase type 12  32.24 
 
 
303 aa  108  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0226  Methyltransferase type 12  31.23 
 
 
311 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3235  methyltransferase type 12  34.62 
 
 
331 aa  108  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.341201 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0197  Methyltransferase type 12  32.57 
 
 
310 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0872  Methyltransferase type 11  32.35 
 
 
311 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0115679  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0749  tetratricopeptide TPR_2  36.02 
 
 
308 aa  104  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.385476 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0800  hypothetical protein  28.52 
 
 
308 aa  103  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215996  normal  0.0187888 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0591  methyltransferase  31.09 
 
 
326 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1539  Methyltransferase type 12  33.17 
 
 
312 aa  101  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3559  Methyltransferase type 12  32.91 
 
 
331 aa  99.8  8e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3256  normal  0.483567 
 
 
-
 
NC_004310  BR1063  hypothetical protein  32.43 
 
 
276 aa  99.4  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.051758  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1028  hypothetical protein  31.98 
 
 
255 aa  97.8  4e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2147  methyltransferase type 12  31.36 
 
 
276 aa  95.5  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2061  Methyltransferase type 12  35.32 
 
 
272 aa  95.1  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.878422  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3693  methyltransferase type 11  35.9 
 
 
315 aa  94  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0630  methyltransferase type 12  35.86 
 
 
330 aa  93.2  8e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0132659 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2294  Methyltransferase type 12  34.04 
 
 
272 aa  89.7  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0489  methyltransferase type 12  29.46 
 
 
447 aa  85.9  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2059  hypothetical protein  33.33 
 
 
241 aa  85.1  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1594  methyltransferase type 12  34.36 
 
 
274 aa  82.4  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.501419  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43435  predicted protein  26.77 
 
 
456 aa  74.3  0.000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1472  methyltransferase type 12  22.52 
 
 
417 aa  72  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.773067  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07904  conserved hypothetical protein  32.41 
 
 
325 aa  67  0.0000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.414403  normal  0.323526 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0543  hypothetical protein  27.98 
 
 
354 aa  65.9  0.000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.395054  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2499  methyltransferase type 12  32.41 
 
 
203 aa  64.7  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.301518 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1368  methyltransferase type 12  31.29 
 
 
210 aa  64.3  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0198  TPR domain-containing protein  23.87 
 
 
358 aa  62.8  0.00000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.890473  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0024  TPR repeat-containing protein  24.74 
 
 
356 aa  62.4  0.00000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003041  hypothetical protein  28.27 
 
 
210 aa  63.2  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61720  hypothetical protein  28.65 
 
 
590 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.541036  decreased coverage  0.00206868 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0284  methyltransferase type 11  34.27 
 
 
209 aa  60.5  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  25.85 
 
 
1979 aa  59.3  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0035  putative biotin synthesis protein BioC  28.15 
 
 
249 aa  58.5  0.0000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.194452  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02845  hypothetical protein  26.7 
 
 
219 aa  58.2  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  27.23 
 
 
729 aa  58.2  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5316  hypothetical protein  28.11 
 
 
575 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.348635  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1107  TPR domain protein  27.68 
 
 
575 aa  57.4  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0048  TPR domain-containing protein  27.33 
 
 
356 aa  57  0.0000007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.24301  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0588  TPR repeat-containing protein  30.99 
 
 
613 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.498138  decreased coverage  0.00128079 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0947  TPR repeat-containing protein  27.12 
 
 
556 aa  56.6  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0318  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 
613 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0135252  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0646  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.5 
 
 
253 aa  56.2  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4301  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.08 
 
 
363 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.124533 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1058  TPR repeat-containing protein  30.06 
 
 
575 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364915  normal  0.506531 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0384  TPR repeat-containing protein  29.38 
 
 
592 aa  55.5  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.315529  normal  0.0233306 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4130  hypothetical protein  30.28 
 
 
613 aa  55.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.533551  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4239  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.08 
 
 
363 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.07 
 
 
632 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4642  TPR repeat-containing protein  21.54 
 
 
249 aa  54.3  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4458  TPR repeat-containing protein  28.98 
 
 
573 aa  54.3  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1392  methyltransferase type 11  31.82 
 
 
204 aa  53.9  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6129  TPR repeat-containing protein  29.71 
 
 
607 aa  52.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00611296  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2854  hypothetical protein  31.58 
 
 
585 aa  53.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0681  tetratricopeptide TPR_2  29.45 
 
 
562 aa  53.1  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1002  Methyltransferase type 11  28.67 
 
 
226 aa  52.4  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  22.75 
 
 
1486 aa  53.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1127  TPR domain-containing protein  25.81 
 
 
725 aa  52.4  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3163  TPR domain protein  27.57 
 
 
700 aa  52  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3025  TPR repeat-containing protein  29.94 
 
 
185 aa  52  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0516  TPR repeat-containing protein  30 
 
 
607 aa  52  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199101  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  23.3 
 
 
810 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0586  hypothetical protein  25.68 
 
 
573 aa  52.4  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0342  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.22 
 
 
582 aa  52  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.351016 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.83 
 
 
689 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2572  TPR repeat-containing protein  26.2 
 
 
288 aa  52  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2413  TPR repeat-containing protein  28.89 
 
 
593 aa  51.6  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2251  hypothetical protein  25.71 
 
 
284 aa  51.2  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1601  hypothetical protein  29.88 
 
 
209 aa  51.2  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02216  methyltransferase  29.32 
 
 
249 aa  51.2  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0256  methyltransferase type 11  29.88 
 
 
209 aa  51.2  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2762  TPR domain protein  24.54 
 
 
603 aa  51.6  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2382  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.39 
 
 
553 aa  51.6  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.407653 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0402  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.23 
 
 
239 aa  51.2  0.00004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.272999  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0487  TPR repeat-containing protein  30.08 
 
 
566 aa  51.2  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  24.12 
 
 
275 aa  51.2  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  26.5 
 
 
243 aa  50.8  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  24.21 
 
 
623 aa  50.4  0.00006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2279  hypothetical protein  25.71 
 
 
284 aa  50.1  0.00007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2213  sulfotransferase  30.13 
 
 
656 aa  50.4  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4750  hypothetical protein  27.12 
 
 
574 aa  50.1  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.447535  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0769  TPR repeat-containing protein  28.41 
 
 
573 aa  50.1  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  23.36 
 
 
878 aa  50.1  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03996  conserved hypothetical protein  33.88 
 
 
221 aa  49.7  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0273649  normal  0.194457 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0757  Methyltransferase type 11  32.85 
 
 
209 aa  49.7  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000851252  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1285  hypothetical protein  21.85 
 
 
262 aa  49.3  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0843441  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>