More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1988 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_1988  ABC transporter related  100 
 
 		 236 aa  481  1e-135  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.69422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3170  ABC transporter-related protein  68.22 
 
 		 236 aa  326  2.0000000000000001e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00314839  normal  0.639262 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2124  ABC transporter-like protein  65.25 
 
 		 236 aa  325  3e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.684433 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5131  ABC transporter related  62.71 
 
 		 236 aa  317  1e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.138859  normal  0.0107113 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4047  ABC transporter related  62.29 
 
 		 236 aa  308  4e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4606  ABC transporter related  63.14 
 
 		 235 aa  301  8.000000000000001e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0736  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  61.37 
 
 		 234 aa  294  8e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3826  ABC transporter related  60.76 
 
 		 237 aa  292  3e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4484  ABC transporter related  60.34 
 
 		 237 aa  291  5e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0632  ABC transporter related  56.3 
 
 		 242 aa  271  9e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0990  ABC transporter related  53.16 
 
 		 237 aa  265  5e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000228508 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0362  ABC transporter related  55.23 
 
 		 243 aa  264  7e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.960542  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4002  ABC transporter related  54.08 
 
 		 232 aa  264  8.999999999999999e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0795353  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4397  ABC transporter related  53.65 
 
 		 233 aa  263  2e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0179  ABC transporter related  54.08 
 
 		 233 aa  262  3e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.505105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2456  ABC transporter related  52.32 
 
 		 237 aa  260  1e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3639  ABC transporter related  53.22 
 
 		 233 aa  251  8.000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.400597  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0790  ABC transporter-related protein  54.27 
 
 		 239 aa  249  4e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.166269 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1208  ABC transporter related  52.36 
 
 		 233 aa  247  1e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.430361  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3272  hypothetical protein  53.22 
 
 		 230 aa  238  5e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4207  ABC transporter related  48.5 
 
 		 232 aa  238  5.999999999999999e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.391697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5099  ABC transporter related  47.46 
 
 		 229 aa  223  1e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.999414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0197  ABC transporter related  47.86 
 
 		 234 aa  222  4e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2306  ABC transporter related protein  44.44 
 
 		 236 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0858  ABC transporter related  48.1 
 
 		 230 aa  216  2e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.269038  normal  0.152569 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4658  ABC transporter related  47.46 
 
 		 236 aa  216  2e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387595  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2233  ABC transporter related  48.51 
 
 		 228 aa  215  4e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4367  ABC transporter related  47.03 
 
 		 236 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.583666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4748  ABC transporter related  45.11 
 
 		 237 aa  210  1e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.597836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2768  ABC transporter related  46.38 
 
 		 237 aa  210  2e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0458182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1903  ABC transporter related  46.38 
 
 		 244 aa  210  2e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.638808  normal  0.412761 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0732  ABC transporter related  45.49 
 
 		 240 aa  209  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3131  ABC transporter related  46.78 
 
 		 237 aa  209  3e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2989  ABC transporter related  45.49 
 
 		 246 aa  209  4e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.455823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1618  ABC transporter related  44.26 
 
 		 237 aa  206  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.458838 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1020  ABC transporter related  44.02 
 
 		 240 aa  205  4e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  42.8 
 
 		 236 aa  205  5e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6570  ABC transporter related  48.5 
 
 		 233 aa  204  7e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192562  normal  0.0138442 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4479  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  48.07 
 
 		 234 aa  204  7e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00225011  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3085  ABC transporter related  45.53 
 
 		 237 aa  204  1e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.639001  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2562  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  48.93 
 
 		 233 aa  204  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  42.37 
 
 		 236 aa  204  1e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1333  ABC transporter related  44.68 
 
 		 237 aa  203  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.529108  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0615  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.92 
 
 		 231 aa  202  5e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0050  ABC transporter related  44.21 
 
 		 232 aa  201  7e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.906419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0661  ABC transporter related  45.49 
 
 		 231 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0655  ABC transporter related  45.49 
 
 		 231 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.139364 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0081  ABC transporter related  43.35 
 
 		 237 aa  199  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  42.06 
 
 		 234 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0210  ABC transporter related  42.98 
 
 		 237 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0083  ABC transporter related  44.21 
 
 		 233 aa  198  5e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3462  ABC transporter related  47.03 
 
 		 235 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6571  ABC transporter related  45.92 
 
 		 233 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177691  normal  0.0408481 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1795  ABC transporter related  42.19 
 
 		 240 aa  196  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5724  ABC transporter related  45.92 
 
 		 233 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1161  ABC transporter related  41.77 
 
 		 240 aa  196  3e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17309  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6088  ABC transporter related  45.92 
 
 		 233 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6215  ABC transporter related  41.63 
 
 		 250 aa  195  5.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1230  ABC transporter-related protein  46.15 
 
 		 238 aa  194  8.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0606758  normal  0.0611511 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5703  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.19 
 
 		 238 aa  194  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.507716 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4904  ABC transporter related  47.03 
 
 		 237 aa  193  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3827  ABC transporter related  47.03 
 
 		 237 aa  193  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3649  ABC transporter-related protein  42.55 
 
 		 237 aa  192  3e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4818  ABC transporter related  43.53 
 
 		 243 aa  192  3e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.23625 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3208  ABC transporter related  42.49 
 
 		 231 aa  192  4e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8051  ABC transporter related  45.06 
 
 		 244 aa  192  5e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.215177  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4448  ABC transporter related  45.06 
 
 		 244 aa  192  5e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186426  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2954  ABC transporter related  43.35 
 
 		 239 aa  191  6e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.124902 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0358  ABC transporter related  38.4 
 
 		 242 aa  190  1e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3423  ABC transporter related  42.06 
 
 		 237 aa  189  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0936  ABC transporter related  41.88 
 
 		 234 aa  189  2e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000438141  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3518  ABC transporter related  40.08 
 
 		 240 aa  189  2.9999999999999997e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0966406  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  41.63 
 
 		 234 aa  189  4e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3245  ABC transporter related  45.06 
 
 		 246 aa  188  5e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0694781  normal  0.303257 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3305  ABC transporter related  41.88 
 
 		 822 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2891  ABC transporter related protein  41.88 
 
 		 240 aa  188  5.999999999999999e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1126  putative amino acid ATP-binding ABC transporter protein  39.74 
 
 		 237 aa  188  7e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577077  normal  0.0994747 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2330  ABC transporter related  43.4 
 
 		 248 aa  188  8e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.109731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0761  ABC transporter related  44.83 
 
 		 237 aa  187  9e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3756  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  43.83 
 
 		 248 aa  187  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4486  ABC transporter related  41.7 
 
 		 260 aa  187  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.064197  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2954  ABC transporter related  41.7 
 
 		 254 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2518  ABC transporter related  43.35 
 
 		 248 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.778502  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  41.63 
 
 		 235 aa  186  3e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3007  ABC transporter-related protein  41.84 
 
 		 258 aa  186  3e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0515162  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2808  ABC transporter related  41.03 
 
 		 232 aa  186  3e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491763  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0225  ABC transporter related  39.32 
 
 		 237 aa  186  3e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.633175  normal  0.041415 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0609  ABC transporter related  40.51 
 
 		 240 aa  186  3e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.773218 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3793  ABC transporter related  40.85 
 
 		 238 aa  186  4e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  42.98 
 
 		 238 aa  186  4e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4754  ABC transporter-related protein  44.87 
 
 		 234 aa  186  4e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  41.03 
 
 		 236 aa  186  4e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5991  branched chain amino acid ABC tranpsorter ATP-binding protein  40.77 
 
 		 233 aa  185  5e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.110822 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3166  ABC transporter related  42.92 
 
 		 248 aa  185  5e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.633767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4555  ABC transporter related  41.35 
 
 		 238 aa  185  6e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3709  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  39.42 
 
 		 244 aa  184  7e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.561977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2313  ABC transporter related  41.56 
 
 		 236 aa  184  7e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3056  ABC transporter related  40.68 
 
 		 239 aa  184  8e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0387789  hitchhiker  0.000278383 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4056  ABC transporter related  40.93 
 
 		 240 aa  184  9e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  41.81 
 
 		 234 aa  184  9e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>