More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4027 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4027  histidine kinase  100 
 
 		 471 aa  946    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0361881  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0999  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  44.16 
 
 		 486 aa  334  2e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000325597 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4376  histidine kinase  43.07 
 
 		 593 aa  179  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.904194  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1150  signal transduction histidine kinase-like protein  30.33 
 
 		 609 aa  176  8e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2881  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  29.59 
 
 		 632 aa  170  7e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.365727 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2456  composite two-component regulatory (sensor kinase and response regulator hybrid) transcription regulator protein  34.92 
 
 		 638 aa  169  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2724  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.03 
 
 		 631 aa  168  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2571  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  40.23 
 
 		 634 aa  168  2e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0964097 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2335  histidine kinase  31.03 
 
 		 610 aa  168  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.249479  normal  0.165398 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6120  histidine kinase  38.38 
 
 		 606 aa  166  5.9999999999999996e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198202  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2688  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.82 
 
 		 589 aa  166  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2743  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  34.97 
 
 		 611 aa  162  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0106  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.97 
 
 		 657 aa  162  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.816197  normal  0.0449615 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0265  sensor histidine kinase  35.37 
 
 		 697 aa  160  6e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1570  Signal transduction histidine kinase-like  35.21 
 
 		 666 aa  159  7e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.733845  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2664  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.7 
 
 		 655 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.215528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2172  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.7 
 
 		 645 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1300  histidine kinase  40.17 
 
 		 468 aa  155  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0380592 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0563  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.7 
 
 		 591 aa  155  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.08 
 
 		 635 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4849  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.77 
 
 		 655 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0479308  normal  0.0448623 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2935  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.17 
 
 		 817 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3978  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.6 
 
 		 1152 aa  153  5.9999999999999996e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.508831  normal  0.169335 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3519  histidine kinase  39.73 
 
 		 448 aa  153  7e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0922492  normal  0.751112 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4705  sensor histidine kinase CorS  34.58 
 
 		 491 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.226442  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0252  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.9 
 
 		 1174 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.854881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4096  histidine kinase  36.18 
 
 		 604 aa  152  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000005496 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0554  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.77 
 
 		 675 aa  151  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.71067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02752  two-component system sensor protein  36.51 
 
 		 1150 aa  151  2e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3169  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  37.55 
 
 		 1445 aa  150  3e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1814  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.55 
 
 		 662 aa  150  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.23625 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2676  histidine kinase  36 
 
 		 676 aa  149  8e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00458174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0165  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.73 
 
 		 1168 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.53132  normal  0.851256 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2880  signal transduction histidine kinase  36.6 
 
 		 733 aa  147  3e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2829  membrane associated response regulator, histidine kinase  33.33 
 
 		 1148 aa  147  3e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1526  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.6 
 
 		 733 aa  147  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0396333  normal  0.047905 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2038  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.12 
 
 		 653 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0992  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.36 
 
 		 662 aa  147  6e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2627  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.2 
 
 		 1116 aa  146  7.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.594612  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0224  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.82 
 
 		 1167 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.96 
 
 		 733 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2683  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.43 
 
 		 567 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.259535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6022  putative two-component hybrid sensor histidine kinase and response regulator  36.8 
 
 		 596 aa  145  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.277911  normal  0.668143 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5115  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.11 
 
 		 609 aa  145  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0345398 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0898  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.18 
 
 		 1172 aa  144  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.149338  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3356  histidine kinase  40.87 
 
 		 633 aa  144  3e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1985  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.52 
 
 		 1138 aa  143  5e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1930  histidine kinase  35.09 
 
 		 476 aa  143  6e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.592963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5840  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.07 
 
 		 621 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.481716  hitchhiker  0.00124548 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0523  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.37 
 
 		 1145 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46370  putative two-component sensor  36.95 
 
 		 540 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.304755  hitchhiker  0.00684988 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4348  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.21 
 
 		 561 aa  142  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.619101 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02398  sensor histidine kinase  36.8 
 
 		 881 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3255  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.26 
 
 		 1177 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0680649  normal  0.187811 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2352  histidine kinase  37.07 
 
 		 441 aa  142  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4855  putative two-component hybrid histidine kinase, periplasmic sensor  36.16 
 
 		 591 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.268249  normal  0.362022 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0898  sensor histidine kinase/response regulator  35.22 
 
 		 537 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.535257  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2058  histidine kinase  37.21 
 
 		 499 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0510  histidine kinase  33.84 
 
 		 629 aa  140  4.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.302748  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0316  sensor histidine kinase/response regulator  36.61 
 
 		 1174 aa  140  6e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2593  hybrid histidine kinase  35.79 
 
 		 477 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1251  histidine kinase  35.79 
 
 		 477 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0537245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3951  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.55 
 
 		 540 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.252359  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3253  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.07 
 
 		 545 aa  138  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.175641 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0837  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.88 
 
 		 1168 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.303418 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5189  Signal transduction histidine kinase  37.21 
 
 		 539 aa  139  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.590136  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2522  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.54 
 
 		 1146 aa  138  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042371 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002203  sensor histidine kinase  30.8 
 
 		 1055 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0921  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.04 
 
 		 1169 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.306622  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2922  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.55 
 
 		 883 aa  137  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301068 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0262  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.07 
 
 		 545 aa  137  4e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.446369  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3301  putative two-component sensor  36.64 
 
 		 577 aa  137  5e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15238  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0869  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.19 
 
 		 1316 aa  137  5e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0225926  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3319  putative two-component sensor  37.5 
 
 		 868 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1292  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.12 
 
 		 1159 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0372313  normal  0.867611 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0028  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.71 
 
 		 884 aa  137  6.0000000000000005e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.465168  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0010  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.71 
 
 		 884 aa  137  6.0000000000000005e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00164  sensor histidine kinase  32.35 
 
 		 1177 aa  136  7.000000000000001e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21700  putative two-component sensor  35.68 
 
 		 1159 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1850  putative two-component sensor  35.68 
 
 		 1159 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.460329  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02280  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  32.94 
 
 		 509 aa  136  8e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2695  sensor histidine kinase  35.15 
 
 		 1147 aa  136  9e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2246  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.47 
 
 		 854 aa  136  9e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00766594  normal  0.0928411 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0291  sensor histidine kinase  37.07 
 
 		 545 aa  135  9.999999999999999e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7668  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.94 
 
 		 571 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1871  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.48 
 
 		 856 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.02 
 
 		 1159 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948496  normal  0.574545 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1882  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  32.48 
 
 		 854 aa  135  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2742  sensor histidine kinase/response regulator  31.21 
 
 		 1145 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2361  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.29 
 
 		 1146 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248753 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2433  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.29 
 
 		 1146 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0799381 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4823  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.42 
 
 		 1169 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2348  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.67 
 
 		 1145 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3590  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.11 
 
 		 594 aa  134  3.9999999999999996e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.18931 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3079  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.68 
 
 		 556 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0274  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.07 
 
 		 1169 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.41273  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0340  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.75 
 
 		 816 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0860  putative two-component hybrid sensor histidine kinase and response regulator  33.85 
 
 		 1169 aa  133  6e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0827695 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1470  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.05 
 
 		 1140 aa  133  6e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1534  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.69 
 
 		 1140 aa  133  6.999999999999999e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.254728  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>