107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3048 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3048  hypothetical protein  100 
 
 		 291 aa  575  1.0000000000000001e-163  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3277  hypothetical protein  68.17 
 
 		 294 aa  355  5e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0541366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2420  putative MxaS-like protein  58.08 
 
 		 289 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.58376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3802  putative MxaS-like protein  59.12 
 
 		 296 aa  330  2e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4032  putative MxaS-like protein  60.48 
 
 		 287 aa  325  6e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.131735  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1895  hypothetical protein  42.11 
 
 		 284 aa  192  5e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.143541 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0784  hypothetical protein  39.01 
 
 		 280 aa  177  2e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.294536  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1896  hypothetical protein  37.1 
 
 		 286 aa  167  2e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.552621 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1526  hypothetical protein  39.24 
 
 		 279 aa  160  3e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0688  hypothetical protein  32.51 
 
 		 287 aa  152  5e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.475275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2039  hypothetical protein  37.41 
 
 		 287 aa  151  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4145  hypothetical protein  37.32 
 
 		 289 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.46623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4205  hypothetical protein  38.38 
 
 		 284 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.594693  normal  0.305277 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4627  hypothetical protein  37.14 
 
 		 289 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0516119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4513  hypothetical protein  37.5 
 
 		 289 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0425654  normal  0.901974 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0476  hypothetical protein  35.56 
 
 		 282 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8035  hypothetical protein  37.63 
 
 		 283 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1824  hypothetical protein  32.86 
 
 		 290 aa  113  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.942349 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1912  hypothetical protein  33.68 
 
 		 291 aa  105  7e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1420  hypothetical protein  32.61 
 
 		 302 aa  76.6  0.0000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1242  protein of unknown function DUF58  29.51 
 
 		 329 aa  70.9  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0298  hypothetical protein  31.78 
 
 		 306 aa  70.1  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  30.42 
 
 		 295 aa  69.3  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  29.92 
 
 		 296 aa  68.9  0.00000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  28.78 
 
 		 290 aa  67  0.0000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1661  hypothetical protein  28.3 
 
 		 323 aa  67  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  34.41 
 
 		 292 aa  66.6  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3057  hypothetical protein  30.62 
 
 		 316 aa  65.5  0.0000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4904  hypothetical protein  32.32 
 
 		 302 aa  64.7  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.259886  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6105  hypothetical protein  26.55 
 
 		 287 aa  62.8  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.907552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  24.47 
 
 		 296 aa  62.4  0.000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1746  ATPase  30.7 
 
 		 328 aa  62.4  0.000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2998  hypothetical protein  26.76 
 
 		 284 aa  60.8  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0475607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  25.34 
 
 		 287 aa  60.5  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  25.74 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  29.1 
 
 		 310 aa  60.5  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  28.34 
 
 		 290 aa  58.5  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0803  hypothetical protein  21.12 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  31.18 
 
 		 294 aa  58.9  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  25.84 
 
 		 295 aa  58.2  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  26.32 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  24.53 
 
 		 288 aa  57.8  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  30.91 
 
 		 294 aa  57.4  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  25.86 
 
 		 286 aa  56.6  0.0000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  25.35 
 
 		 287 aa  56.2  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  25.73 
 
 		 303 aa  55.5  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0206  protein of unknown function DUF58  28.31 
 
 		 291 aa  55.5  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0043  hypothetical protein  22.46 
 
 		 288 aa  55.5  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3892  hypothetical protein  27.54 
 
 		 363 aa  54.7  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.991516  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3246  hypothetical protein  27.64 
 
 		 328 aa  54.7  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2120  hypothetical protein  27.67 
 
 		 300 aa  53.9  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.526996  normal  0.0698278 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  29.91 
 
 		 292 aa  53.9  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02703  hypothetical protein  27.44 
 
 		 324 aa  53.9  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.594173  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  25.35 
 
 		 328 aa  53.5  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  27.78 
 
 		 340 aa  53.5  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3262  von Willebrand factor type A  27.54 
 
 		 306 aa  52.8  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.171648  normal  0.0120421 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2136  hypothetical protein  29.03 
 
 		 320 aa  52.8  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412717  decreased coverage  0.00332979 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1246  hypothetical protein  30.39 
 
 		 338 aa  52.4  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.537762 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2783  hypothetical protein  26.92 
 
 		 317 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  29.13 
 
 		 340 aa  51.6  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  28.17 
 
 		 302 aa  51.6  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  25.57 
 
 		 287 aa  52  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0461  hypothetical protein  28.51 
 
 		 287 aa  51.2  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  30.33 
 
 		 309 aa  51.6  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1062  hypothetical protein  28.51 
 
 		 309 aa  51.6  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2763  hypothetical protein  26.92 
 
 		 317 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.618762  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1595  protein of unknown function DUF58  26.92 
 
 		 317 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.949251  hitchhiker  0.000000583648 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3844  hypothetical protein  27.94 
 
 		 295 aa  50.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182191  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1364  hypothetical protein  28.21 
 
 		 288 aa  51.6  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.366076  normal  0.445195 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3234  protein of unknown function DUF58  31.84 
 
 		 309 aa  50.4  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  27.97 
 
 		 295 aa  50.4  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2454  hypothetical protein  27.68 
 
 		 315 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2499  hypothetical protein  27.68 
 
 		 315 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.588721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2491  hypothetical protein  27.68 
 
 		 315 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0213363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2462  hypothetical protein  26.92 
 
 		 317 aa  50.1  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  27.83 
 
 		 297 aa  50.1  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1626  hypothetical protein  28.06 
 
 		 309 aa  49.7  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115856 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2170  hypothetical protein  31.22 
 
 		 318 aa  49.3  0.00008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  29.95 
 
 		 296 aa  49.3  0.00008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  26.05 
 
 		 291 aa  49.3  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2916  hypothetical protein  27.57 
 
 		 303 aa  48.9  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  31.1 
 
 		 296 aa  48.5  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0526  hypothetical protein  23.27 
 
 		 319 aa  48.9  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0075  hypothetical protein  24.45 
 
 		 304 aa  48.1  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.193793  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2813  hypothetical protein  22.91 
 
 		 322 aa  48.1  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1737  hypothetical protein  26.41 
 
 		 306 aa  47.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2858  hypothetical protein  26.44 
 
 		 317 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.187319  hitchhiker  0.00367272 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1677  hypothetical protein  30.53 
 
 		 323 aa  47.4  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.929905  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0547  protein of unknown function DUF58  29.35 
 
 		 310 aa  47  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3160  hypothetical protein  22.74 
 
 		 351 aa  47  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.632244  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2770  hypothetical protein  27.57 
 
 		 303 aa  47  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1974  hypothetical protein  27.03 
 
 		 307 aa  47  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1796  hypothetical protein  31.47 
 
 		 311 aa  45.8  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208724  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5140  protein of unknown function DUF58  26.92 
 
 		 312 aa  45.8  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2750  hypothetical protein  27.57 
 
 		 302 aa  45.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316622 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3029  hypothetical protein  28.57 
 
 		 309 aa  45.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  0.142449 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  28.89 
 
 		 310 aa  44.7  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22370  hypothetical protein  28.33 
 
 		 317 aa  44.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0420947  normal  0.470335 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2299  hypothetical protein  27.82 
 
 		 331 aa  44.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0560687  hitchhiker  0.00265878 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0185  protein of unknown function DUF58  28.5 
 
 		 357 aa  45.1  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>