More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0939 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0939  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 247 aa  499  1e-140  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.224899  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3373  two component LuxR family transcriptional regulator  64.98 
 
 		 262 aa  301  6.000000000000001e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.492418  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4986  two component LuxR family transcriptional regulator  49.56 
 
 		 237 aa  206  4e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.170484  normal  0.313407 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4084  two component LuxR family transcriptional regulator  46.64 
 
 		 246 aa  181  9.000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3161  two component response regulator transcription regulator protein  46.49 
 
 		 231 aa  169  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0804  two component LuxR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 229 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0377  two component LuxR family transcriptional regulator  41.85 
 
 		 245 aa  152  5e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0612  two component LuxR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 231 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.105579 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1005  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.07 
 
 		 211 aa  129  3e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3199  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.61 
 
 		 262 aa  128  6e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3952  two component LuxR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 222 aa  125  6e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.173353 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0373  response regulator receiver  31.9 
 
 		 220 aa  125  6e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3515  two component LuxR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 214 aa  123  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.150532  hitchhiker  0.00248481 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3237  response regulator  33.33 
 
 		 219 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3380  two component LuxR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277634 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 223 aa  119  7e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3592  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.8 
 
 		 235 aa  117  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.356082  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5165  two component LuxR family transcriptional regulator  39.21 
 
 		 231 aa  118  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.162111 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2635  response regulator receiver  34.82 
 
 		 207 aa  115  6e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1740  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.48 
 
 		 228 aa  115  7.999999999999999e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0447  two component LuxR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.013193  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2543  two component LuxR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.149636  normal  0.0443917 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3102  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.02 
 
 		 222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.774177  normal  0.15342 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 228 aa  114  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2302  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.74 
 
 		 226 aa  113  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0191252  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1769  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.72 
 
 		 219 aa  113  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.221401  normal  0.0578747 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1772  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.93 
 
 		 262 aa  113  3e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1249  response regulator  32.1 
 
 		 245 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0947405  normal  0.0892263 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  31.36 
 
 		 234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1851  two component LuxR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.467917  normal  0.53175 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3628  two component LuxR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.350857 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  30.22 
 
 		 234 aa  109  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1633  two component LuxR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 254 aa  110  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03540  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  34.35 
 
 		 226 aa  110  3e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0973  two component LuxR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 216 aa  109  5e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.255067  normal  0.404517 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1071  two component LuxR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 209 aa  109  5e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3251  response regulator receiver protein  33.93 
 
 		 221 aa  108  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0793449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4735  two component LuxR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 209 aa  108  7.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.545478  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4160  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.48 
 
 		 215 aa  108  8.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0201669  normal  0.0925574 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3824  response regulator receiver  36.2 
 
 		 228 aa  108  9.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19700  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.2 
 
 		 209 aa  107  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1020  response regulator receiver  32.44 
 
 		 218 aa  107  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.648692  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.47 
 
 		 224 aa  108  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0938  two component LuxR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 242 aa  107  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1579  two component LuxR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 242 aa  107  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6057  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.29 
 
 		 217 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1734  two component LuxR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 257 aa  106  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.159279  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.7 
 
 		 253 aa  106  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3998  response regulator receiver protein  32.89 
 
 		 233 aa  106  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.363745  normal  0.263649 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3810  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.09 
 
 		 236 aa  107  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225059  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1684  response regulator receiver protein  30.09 
 
 		 207 aa  106  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0553  response regulator receiver protein  35.53 
 
 		 213 aa  105  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.82888  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2842  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.92 
 
 		 226 aa  105  5e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.622781  decreased coverage  0.00305681 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3040  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.22 
 
 		 224 aa  105  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0154763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4214  two component LuxR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 228 aa  105  7e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0601429  normal  0.0532868 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3120  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.4 
 
 		 218 aa  105  8e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.954631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4778  two component LuxR family transcriptional regulator  32 
 
 		 208 aa  105  9e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000269792  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2258  two component LuxR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 254 aa  105  9e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245701 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1346  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.02 
 
 		 236 aa  104  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.361751  hitchhiker  0.00000337078 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0549  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.67 
 
 		 220 aa  104  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3621  response regulatory protein  32.52 
 
 		 243 aa  104  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0192509  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6085  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.98 
 
 		 217 aa  104  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1051  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.48 
 
 		 211 aa  104  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0337978 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0160  two component LuxR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2359  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.91 
 
 		 247 aa  103  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0990205  decreased coverage  0.00133027 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0175  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.05 
 
 		 222 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1438  response regulator receiver  32.47 
 
 		 213 aa  103  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.494689  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1053  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.2 
 
 		 236 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.295708  normal  0.0294181 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38420  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  30.6 
 
 		 226 aa  103  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4258  two component LuxR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2804  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.14 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  33.05 
 
 		 227 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2579  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.48 
 
 		 213 aa  103  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0500394 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0023  two component LuxR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 221 aa  103  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.273145  hitchhiker  0.00000136124 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0919  two component LuxR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 214 aa  103  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6596  two component LuxR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 249 aa  103  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 237 aa  102  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 237 aa  102  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5018  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.94 
 
 		 209 aa  102  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5375  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.14 
 
 		 218 aa  102  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0262  two component LuxR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 217 aa  102  5e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.153662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 219 aa  102  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0513  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.04 
 
 		 209 aa  102  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.52986  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  31.14 
 
 		 242 aa  102  7e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3654  two component LuxR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 221 aa  102  7e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000210563  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 250 aa  102  8e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 303 aa  101  9e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0799  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.26 
 
 		 226 aa  101  9e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6211  response regulator receiver protein  30.51 
 
 		 239 aa  101  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.377169 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7812  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.52 
 
 		 227 aa  101  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0523  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.22 
 
 		 230 aa  101  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 238 aa  101  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0717  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.25 
 
 		 209 aa  101  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.854815  normal  0.189113 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0164  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.94 
 
 		 234 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0441129 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3331  response regulator receiver protein  32.74 
 
 		 227 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2145  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.48 
 
 		 220 aa  101  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0196231  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2656  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.02 
 
 		 226 aa  101  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1971  two component LuxR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 216 aa  101  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.356635  normal  0.773651 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2087  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.19 
 
 		 247 aa  101  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.73112  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>