More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_03362 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_03362  lytic murein transglycosylase  100 
 
 		 272 aa  560  1.0000000000000001e-159  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2185  lytic transglycosylase catalytic  36.36 
 
 		 427 aa  122  4e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000212239  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0297  lytic transglycosylase, catalytic  36.36 
 
 		 385 aa  122  7e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.277763  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4045  murein transglycosylase C  40.12 
 
 		 358 aa  122  8e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.171156 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2724  lytic transglycosylase catalytic  39.66 
 
 		 519 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0477  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  40.12 
 
 		 340 aa  119  3.9999999999999996e-26  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0327755  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3409  murein transglycosylase C  39.53 
 
 		 374 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.168734  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3208  murein transglycosylase C  40.46 
 
 		 360 aa  118  9e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.711695  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2079  Lytic transglycosylase catalytic  38.51 
 
 		 359 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.929188  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0880  murein transglycosylase C  38.95 
 
 		 374 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0177  Lytic transglycosylase catalytic  37.43 
 
 		 429 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00119021 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3276  murein transglycosylase C  38.15 
 
 		 361 aa  113  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3352  murein transglycosylase C  38.15 
 
 		 361 aa  113  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.598657 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3286  murein transglycosylase C  38.15 
 
 		 361 aa  113  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.548913  normal  0.0418173 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3455  murein transglycosylase C  38.15 
 
 		 361 aa  113  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.941292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3360  murein transglycosylase C  38.15 
 
 		 361 aa  113  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.610682  normal  0.0857265 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3344  lytic transglycosylase catalytic  39.66 
 
 		 394 aa  113  4.0000000000000004e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.873835 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0818  murein transglycosylase C  36.42 
 
 		 362 aa  112  9e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.477613  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0153  murein transglycosylase C  36.42 
 
 		 358 aa  112  9e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000643925 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0817  murein transglycosylase C  36.42 
 
 		 358 aa  112  9e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3106  murein transglycosylase C  38.15 
 
 		 359 aa  112  9e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368993 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3028  murein transglycosylase C  38.6 
 
 		 360 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1786  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  37.19 
 
 		 388 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0048651  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3368  murein transglycosylase C  37.21 
 
 		 359 aa  111  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0187243 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02793  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  37.57 
 
 		 359 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.15683  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0732  Lytic transglycosylase catalytic  37.57 
 
 		 360 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3396  murein transglycosylase C  37.57 
 
 		 359 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4267  murein transglycosylase C  37.57 
 
 		 359 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.59829  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02756  hypothetical protein  37.57 
 
 		 359 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.128702  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0751  murein transglycosylase C  37.57 
 
 		 360 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0147512 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3124  murein transglycosylase C  37.57 
 
 		 359 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3309  murein transglycosylase C  37.57 
 
 		 359 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1669  murein transglycosylase C  37.43 
 
 		 363 aa  109  5e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0080  lytic transglycosylase, catalytic  38.69 
 
 		 377 aa  108  1e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1595  lytic transglycosylase, catalytic  37.65 
 
 		 378 aa  106  4e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03316  lytic murein transglycosylase  37.93 
 
 		 296 aa  105  7e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1446  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  37.21 
 
 		 373 aa  102  6e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002444  membrane-bound lytic murein transglycosylase C precursor  38.69 
 
 		 372 aa  102  7e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000187183  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4178  lytic transglycosylase catalytic  34.59 
 
 		 349 aa  102  9e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03593  lytic murein transglycosylase  37.14 
 
 		 376 aa  101  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0532  membrane-bound lytic murein transglycosylase C precursor  37.5 
 
 		 378 aa  100  3e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000712177  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0001  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  37.65 
 
 		 375 aa  98.6  9e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000403894  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1463  lytic transglycosylase, catalytic  34.83 
 
 		 413 aa  97.8  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3132  lytic transglycosylase catalytic  35.16 
 
 		 354 aa  97.8  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437573 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1955  membrane-bound lytic murein transglycosylase E  33.13 
 
 		 203 aa  95.9  7e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0826912  normal  0.211884 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01168  lytic murein endotransglycosylase E  33.13 
 
 		 203 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.349324  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2455  Lytic transglycosylase catalytic  33.13 
 
 		 203 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00170587  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2432  lytic transglycosylase catalytic  33.13 
 
 		 203 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.283102  normal  0.357576 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1680  membrane-bound lytic murein transglycosylase E  33.13 
 
 		 203 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00128124  normal  0.45988 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1351  membrane-bound lytic murein transglycosylase E  33.13 
 
 		 241 aa  94.7  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01178  hypothetical protein  33.13 
 
 		 203 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.322572  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1338  membrane-bound lytic murein transglycosylase E  33.13 
 
 		 241 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.243882  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1295  membrane-bound lytic murein transglycosylase E  33.13 
 
 		 241 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0532934  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2359  lytic transglycosylase, catalytic  31.52 
 
 		 203 aa  88.2  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2135  lytic transglycosylase catalytic  32.1 
 
 		 233 aa  87.8  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.525775 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1021  Lytic transglycosylase catalytic  37.43 
 
 		 197 aa  83.6  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1439  Lytic transglycosylase catalytic  32.31 
 
 		 187 aa  84  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2154  lytic transglycosylase, catalytic  31.76 
 
 		 201 aa  82.4  0.000000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0579447  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0633  lytic transglycosylase catalytic  32.23 
 
 		 649 aa  80.9  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.716649  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1706  transglycosylase slt family protein  30.36 
 
 		 212 aa  80.9  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.190325  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1888  Lytic transglycosylase catalytic  30.91 
 
 		 195 aa  80.9  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1816  lytic transglycosylase catalytic  30.36 
 
 		 220 aa  80.9  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2629  transglycosylase slt family protein  30.36 
 
 		 212 aa  80.9  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00160181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0716  soluble lytic murein transglycosylase precursor  36.49 
 
 		 649 aa  80.1  0.00000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2827  Lytic transglycosylase catalytic  32.12 
 
 		 263 aa  77  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4098  lytic transglycosylase, catalytic  32.78 
 
 		 590 aa  74.7  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3413  Lytic transglycosylase catalytic  34.46 
 
 		 661 aa  75.1  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439727  normal  0.575026 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2520  lytic transglycosylase, catalytic  31.47 
 
 		 280 aa  74.7  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.22403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1769  lytic transglycosylase, catalytic  32.94 
 
 		 189 aa  74.7  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1595  lytic transglycosylase, catalytic  36.71 
 
 		 190 aa  74.7  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2473  Lytic transglycosylase catalytic  33.12 
 
 		 199 aa  74.3  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.84832e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0200  lytic transglycosylase, catalytic  32.26 
 
 		 637 aa  74.7  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1300  Lytic transglycosylase catalytic  30.54 
 
 		 218 aa  73.2  0.000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0023245  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  33.12 
 
 		 196 aa  73.6  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0884  lytic transglycosylase, catalytic  30.59 
 
 		 188 aa  73.2  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.10912  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02649  soluble lytic murein transglycosylase  34.2 
 
 		 647 aa  73.2  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.787033  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0924  lytic transglycosylase, catalytic  33.94 
 
 		 663 aa  72.8  0.000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2689  Lytic transglycosylase catalytic  30 
 
 		 752 aa  72  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2357  lytic transglycosylase, catalytic  33.53 
 
 		 260 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500098  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2419  Lytic transglycosylase catalytic  34.62 
 
 		 193 aa  71.6  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0123719 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2131  soluble lytic transglycosylase  29.07 
 
 		 690 aa  71.6  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  31.49 
 
 		 258 aa  71.2  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1953  lytic transglycosylase, catalytic  30.11 
 
 		 203 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000518233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2486  lytic transglycosylase, catalytic  31.18 
 
 		 198 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000427479  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4220  Lytic transglycosylase catalytic  31.63 
 
 		 735 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.11012 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0517  lytic transglycosylase, catalytic  33.52 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1328  Lytic transglycosylase catalytic  28.42 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000594554  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1407  lytic transglycosylase, catalytic  34.84 
 
 		 179 aa  70.1  0.00000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.282461  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  38.94 
 
 		 603 aa  69.3  0.00000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1960  secreted protein  29.89 
 
 		 181 aa  69.3  0.00000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1953  lytic transglycosylase catalytic  33.77 
 
 		 756 aa  69.3  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2248  Slt family transglycosylase  29.89 
 
 		 181 aa  68.9  0.00000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.469686  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2165  lytic transglycosylase catalytic  31.41 
 
 		 499 aa  68.6  0.00000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0275906 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0977  putative transglycosylase signal peptide protein  28.84 
 
 		 285 aa  68.6  0.00000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.121304  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0944  lytic transglycosylase, catalytic  35.71 
 
 		 260 aa  68.9  0.00000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1378  lytic transglycosylase, catalytic  34.23 
 
 		 661 aa  68.9  0.00000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.842597  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2291  putative transglycosylase protein  26.6 
 
 		 198 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.128594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  35.25 
 
 		 282 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  31.18 
 
 		 204 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0717  lytic transglycosylase catalytic  30.06 
 
 		 616 aa  68.6  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>