More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01875 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01875  hypothetical protein  100 
 
 		 343 aa  711    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003811  membrane-fusion protein  79.59 
 
 		 343 aa  592  1e-168  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1280  putative multidrug resistance protein  67.54 
 
 		 343 aa  481  1e-135  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1351  putative multidrug resistance protein precursor  58.82 
 
 		 357 aa  403  1e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4143  RND family efflux transporter MFP subunit  47.83 
 
 		 343 aa  301  1e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.478516 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2871  RND family efflux transporter MFP subunit  37.62 
 
 		 357 aa  204  2e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05965  hypothetical protein  33.33 
 
 		 357 aa  200  3e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0673  multidrug resistance protein  37.46 
 
 		 354 aa  194  1e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000228  membrane-fusion protein  32.95 
 
 		 357 aa  189  5.999999999999999e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3664  RND family efflux transporter MFP subunit  34.34 
 
 		 370 aa  187  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1511  secretion protein HlyD  32.46 
 
 		 357 aa  186  5e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4314  RND family efflux transporter MFP subunit  35.39 
 
 		 360 aa  186  7e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00180968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1730  RND family efflux transporter MFP subunit  32.57 
 
 		 368 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.674972  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3992  RND efflux system membrane fusion protein  32.31 
 
 		 366 aa  181  1e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1435  RND family efflux transporter MFP subunit  34.08 
 
 		 359 aa  180  4e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3712  RND family efflux transporter MFP subunit  35.24 
 
 		 367 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.975013  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0668  RND family efflux transporter MFP subunit  34.17 
 
 		 360 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3695  RND family efflux transporter MFP subunit  33.72 
 
 		 360 aa  177  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.101272  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0630  RND family efflux transporter MFP subunit  34.36 
 
 		 364 aa  177  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0664  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.2 
 
 		 360 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0641  RND family efflux transporter MFP subunit  34.2 
 
 		 360 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1418  RND family efflux transporter MFP subunit  30.81 
 
 		 384 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.267918  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0056  secretion protein HlyD  32.12 
 
 		 354 aa  172  7.999999999999999e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3513  RND family efflux transporter MFP subunit  30.45 
 
 		 360 aa  169  7e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0849  RND family efflux transporter MFP subunit  30.45 
 
 		 360 aa  169  7e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.880012  normal  0.445386 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3643  RND family efflux transporter MFP subunit  30.45 
 
 		 360 aa  169  7e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3571  RND family efflux transporter MFP subunit  32.17 
 
 		 360 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.239658  normal  0.276589 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0697  RND family efflux transporter MFP subunit  33.72 
 
 		 359 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1279  HlyD family secretion protein  31.91 
 
 		 359 aa  162  6e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3401  RND family efflux transporter MFP subunit  32.93 
 
 		 360 aa  159  5e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.392528  hitchhiker  0.00103818 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0551  RND family efflux transporter MFP subunit  32.73 
 
 		 360 aa  159  9e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.139954 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0671  secretion protein HlyD  30.79 
 
 		 432 aa  159  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4144  RND family efflux transporter MFP subunit  33.55 
 
 		 365 aa  157  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.473768 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1916  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.79 
 
 		 388 aa  156  5.0000000000000005e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.631291  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003810  linker protein putative  31.67 
 
 		 365 aa  155  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0674  periplasmic linker protein  30.7 
 
 		 358 aa  154  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1352  organic solvent efflux pump precursor (periplasmic linker protein component)  31.55 
 
 		 359 aa  153  4e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.896212  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0467  RND family efflux transporter MFP subunit  30.43 
 
 		 360 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.949455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01876  hypothetical protein  30.34 
 
 		 359 aa  148  1.0000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02529  putative multidrug resistance protein (substrate binding lipoprotein)  27.99 
 
 		 403 aa  146  6e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2562  RND family efflux transporter MFP subunit  28.37 
 
 		 389 aa  142  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.718255  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0034  secretion protein, HlyD family  29.62 
 
 		 369 aa  140  4.999999999999999e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1354  HlyD family secretion protein  30.17 
 
 		 364 aa  138  1e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000336467  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2567  RND family efflux transporter MFP subunit  27.38 
 
 		 331 aa  137  3.0000000000000003e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.17029 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3848  RND family efflux transporter MFP subunit  30.88 
 
 		 361 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.918542  normal  0.711455 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3002  membrane-fusion protein, component of multidrug efflux system  29.26 
 
 		 367 aa  130  3e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1715  acriflavin resistance periplasmic protein  28.53 
 
 		 357 aa  123  5e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000921401  normal  0.0591325 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0235  RND efflux membrane fusion protein precursor  30.17 
 
 		 356 aa  123  6e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2115  RND family efflux transporter MFP subunit  25.53 
 
 		 358 aa  121  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.243289  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0915  secretion protein, putative  28.37 
 
 		 368 aa  120  3e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1660  RND family efflux transporter MFP subunit  27.73 
 
 		 369 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000227  periplasmic linker protein  28.61 
 
 		 353 aa  119  7e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2715  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.28 
 
 		 366 aa  119  9e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.37732  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2426  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30 
 
 		 365 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.54628  hitchhiker  0.0000000883837 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0793  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.35 
 
 		 390 aa  117  3e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1660  RND family efflux transporter MFP subunit  27.32 
 
 		 361 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01960  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  28.94 
 
 		 356 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1613  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.78 
 
 		 469 aa  114  3e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000654  putative efflux protein  27.51 
 
 		 360 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5035  HlyD family secretion protein  27.02 
 
 		 396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1452  RND family efflux transporter MFP subunit  28.41 
 
 		 369 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0187105  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3923  multidrug efflux system protein  30.77 
 
 		 387 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1462  RND family efflux transporter MFP subunit  28.77 
 
 		 418 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1510  secretion protein HlyD  25.99 
 
 		 357 aa  110  3e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6340  secretion protein HlyD  26.94 
 
 		 369 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1739  RND family efflux transporter MFP subunit  26.94 
 
 		 369 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.357806  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1372  secretion protein HlyD  29.34 
 
 		 405 aa  109  6e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.203736  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1125  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.99 
 
 		 417 aa  108  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0255605  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3214  putative efflux protein  27.79 
 
 		 367 aa  108  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1079  secretion protein HlyD  28.98 
 
 		 366 aa  108  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1752  RND family efflux transporter MFP subunit  26.46 
 
 		 369 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2293  RND family efflux transporter MFP subunit  25.63 
 
 		 371 aa  106  5e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2103  RND family efflux transporter MFP subunit  27.57 
 
 		 403 aa  106  7e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0796794  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1206  RND family efflux transporter MFP subunit  28.99 
 
 		 385 aa  105  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.427148 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3495  RND family efflux transporter MFP subunit  27.76 
 
 		 365 aa  104  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1520  RND family efflux transporter MFP subunit  26.39 
 
 		 370 aa  103  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.289277 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2574  RND family efflux transporter MFP subunit  29.11 
 
 		 416 aa  103  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0205378 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0630  secretion protein HlyD  28.26 
 
 		 357 aa  103  4e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0232449  normal  0.116732 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0954  RND family efflux transporter MFP subunit  27.24 
 
 		 371 aa  103  5e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2295  RND family efflux transporter MFP subunit  27.24 
 
 		 371 aa  103  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2162  RND family efflux transporter MFP subunit  27.24 
 
 		 371 aa  103  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0739  RND family efflux transporter MFP subunit  26.04 
 
 		 371 aa  103  5e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.580961  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2532  secretion protein HlyD  27.22 
 
 		 359 aa  102  7e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19676  normal  0.860631 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3506  RND family efflux transporter MFP subunit  28.49 
 
 		 364 aa  102  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.164445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2778  RND family efflux transporter MFP subunit  27.13 
 
 		 359 aa  102  7e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.223876 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1201  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.78 
 
 		 369 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000118856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1636  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.16 
 
 		 383 aa  102  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.372421  normal  0.934491 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1968  multidrug efflux pump, membrane fusion protein CzcB subfamily  26.27 
 
 		 394 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0347448 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1559  RND efflux system, membrane fusion protein CmeA  26.15 
 
 		 365 aa  101  2e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3170  RND family efflux transporter MFP subunit  26.78 
 
 		 369 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000721535  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1122  RND family efflux transporter MFP subunit  27.53 
 
 		 366 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3238  RND family efflux transporter MFP subunit  25.55 
 
 		 368 aa  100  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2292  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.61 
 
 		 383 aa  100  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.516168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004022  membrane-fusion protein  26.84 
 
 		 369 aa  100  4e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000160707  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1943  secretion protein HlyD  26.26 
 
 		 523 aa  100  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.354822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2229  RND family efflux transporter MFP subunit  28.66 
 
 		 405 aa  100  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3169  RND family efflux transporter MFP subunit  26.78 
 
 		 369 aa  100  5e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000222351  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3313  RND family efflux transporter MFP subunit  26.5 
 
 		 369 aa  100  5e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000984298  normal  0.15916 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0975  RND family efflux transporter MFP subunit  27.27 
 
 		 382 aa  100  5e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0109715 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1982  RND family efflux transporter MFP subunit  25.07 
 
 		 360 aa  100  5e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000542821  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>