113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2529 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_2529  Carbohydrate-binding family 9  100 
 
 
1141 aa  2295    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2109  Carbohydrate-binding family 9  48.68 
 
 
1276 aa  268  4e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000203571  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0914  hypothetical protein  39.01 
 
 
1086 aa  136  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.202389  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1096  hypothetical protein  28.37 
 
 
602 aa  125  6e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00809293 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3938  hypothetical protein  28.41 
 
 
604 aa  121  7.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0408  hypothetical protein  28.45 
 
 
891 aa  115  5e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193386  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1040  hypothetical protein  25.74 
 
 
614 aa  112  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.367897  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3039  hypothetical protein  28.88 
 
 
803 aa  110  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0719131  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2630  hypothetical protein  28.66 
 
 
801 aa  102  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2001  hypothetical protein  26.24 
 
 
596 aa  102  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.021099  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4299  hypothetical protein  27.48 
 
 
662 aa  98.6  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0717  glycosyl hydrolase 53 protein  25 
 
 
534 aa  96.3  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3764  hypothetical protein  26.2 
 
 
605 aa  95.5  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3853  hypothetical protein  26.45 
 
 
564 aa  94  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4325  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.5 
 
 
1343 aa  92  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.107286 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6730  hypothetical protein  24.94 
 
 
554 aa  91.7  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1344  hypothetical protein  24.14 
 
 
873 aa  88.6  6e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.173048  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0843  hypothetical protein  25.75 
 
 
562 aa  87.4  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4606  hypothetical protein  26.39 
 
 
584 aa  86.3  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000237555  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0374  Carbohydrate-binding family 9  31.78 
 
 
253 aa  80.9  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0863  endo-1,4-beta-xylanase  30.81 
 
 
1059 aa  80.1  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0885  endo-1,4-beta-xylanase  31.28 
 
 
1059 aa  80.5  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.389282  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1091  hypothetical protein  22.96 
 
 
472 aa  80.5  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1549  endo-1,4-beta-xylanase  31.37 
 
 
1020 aa  78.2  0.0000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0176143  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6399  glycoside hydrolase family 5  24.92 
 
 
415 aa  77  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.337804 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3535  hypothetical protein  23.89 
 
 
596 aa  75.5  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4282  Beta-xylosidase-like protein  23.77 
 
 
444 aa  74.3  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.296007  hitchhiker  0.00752766 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1240  bifunctional xylanase/esterase; CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein and carbohydrate esterase family 4 protein  35.93 
 
 
1748 aa  73.6  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.267391  normal  0.341436 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3712  hypothetical protein  23.92 
 
 
597 aa  73.6  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0239921  hitchhiker  0.00429012 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3875  hypothetical protein  23.27 
 
 
659 aa  73.2  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0533  hypothetical protein  23.88 
 
 
481 aa  71.6  0.00000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0333949  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0810  hypothetical protein  22.99 
 
 
658 aa  69.7  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4164  hypothetical protein  25.37 
 
 
450 aa  68.6  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4202  hypothetical protein  25.37 
 
 
450 aa  68.6  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.603749 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1063  glycoside hydrolase family 5  27.95 
 
 
398 aa  68.6  0.0000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3314  hypothetical protein  25.37 
 
 
450 aa  68.6  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138488  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3268  Beta-xylosidase-like protein  24.41 
 
 
444 aa  67.4  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.309548  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1200  hypothetical protein  22.43 
 
 
640 aa  67.8  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000043038  normal  0.447188 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3040  hypothetical protein  23.65 
 
 
372 aa  67  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000024541 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2320  glycoside hydrolase family 10  27.7 
 
 
1050 aa  66.6  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1715  Endo-1,4-beta-xylanase  25.74 
 
 
1037 aa  65.9  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000895355  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2394  hypothetical protein  23.66 
 
 
600 aa  65.1  0.000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.010377  normal  0.174901 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2319  glycoside hydrolase family 10  30.16 
 
 
1495 aa  63.2  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3384  hypothetical protein  22.02 
 
 
408 aa  62.4  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0857  hypothetical protein  22.88 
 
 
425 aa  62.4  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.240803  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2654  hypothetical protein  21.83 
 
 
550 aa  62.4  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1238  beta-xylosidase/endoglucanase  27.75 
 
 
1275 aa  62  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3727  b-glycosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein  30.43 
 
 
1223 aa  62  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0598979  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3536  hypothetical protein  22.86 
 
 
601 aa  61.6  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.517876  normal  0.767209 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3314  hypothetical protein  23.67 
 
 
500 aa  61.2  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.542041  normal  0.275186 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2041  polyfunctional acetylxylan esterase/b-xylosidase/a-L-arabinofuranosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 43 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  29.18 
 
 
1585 aa  60.8  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  28.76 
 
 
1002 aa  60.1  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2044  beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase- like protein  29.18 
 
 
1474 aa  60.1  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3713  hypothetical protein  22.6 
 
 
601 aa  60.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.80691  normal  0.0122449 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2477  hypothetical protein  21.65 
 
 
763 aa  60.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2393  hypothetical protein  22.32 
 
 
446 aa  60.1  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.497343  normal  0.092476 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2042  CHU large protein, xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 5 protein  29.18 
 
 
1217 aa  59.7  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2043  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 10 protein  29.18 
 
 
1247 aa  59.7  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2379  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 11 protein  32.14 
 
 
1160 aa  59.7  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000600941  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3383  hypothetical protein  22.42 
 
 
586 aa  59.7  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0654007  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0790  hypothetical protein  23.53 
 
 
460 aa  58.9  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5546  hypothetical protein  21.84 
 
 
448 aa  58.5  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2152  hypothetical protein  24.44 
 
 
392 aa  57.4  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3344  hypothetical protein  23.6 
 
 
453 aa  57  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3991  hypothetical protein  23.39 
 
 
447 aa  56.6  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0970937  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0356  hypothetical protein  23.05 
 
 
369 aa  55.5  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000129825  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35670  putative glycosyl hydrolase  23.73 
 
 
442 aa  55.1  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000648928 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1593  hypothetical protein  24.14 
 
 
326 aa  55.1  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559192  normal  0.0900317 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1101  endo-1,4-beta-xylanase  32.64 
 
 
1018 aa  55.1  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520079  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3885  hypothetical protein  22.86 
 
 
508 aa  55.1  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.576035  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3306  glycoside hydrolase family protein  23.2 
 
 
437 aa  54.3  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00744164  normal  0.534122 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3882  hypothetical protein  22.32 
 
 
436 aa  54.7  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0281101 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2759  glycoside hydrolase family protein  21.43 
 
 
437 aa  53.9  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3534  glycosyl hydrolase, family 5 PslG  27.23 
 
 
437 aa  53.5  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.648854  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3004  putative glycosyl hydrolase  23.96 
 
 
442 aa  53.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.088022  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5604  hypothetical protein  21.13 
 
 
772 aa  53.5  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.152191  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0086  hypothetical protein  25.67 
 
 
442 aa  52.8  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1086  hypothetical protein  25.67 
 
 
442 aa  52.8  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0820  hypothetical protein  21.41 
 
 
761 aa  52.8  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1246  hypothetical protein  25.67 
 
 
442 aa  52.8  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1526  hypothetical protein  25.67 
 
 
442 aa  52.8  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2839  Beta-xylosidase  25.67 
 
 
442 aa  52.4  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2688  putative cellulase  25.67 
 
 
442 aa  52.4  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0102  hypothetical protein  25.67 
 
 
442 aa  52.8  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4500  hypothetical protein  22.81 
 
 
748 aa  52.8  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.764548  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2598  hypothetical protein  25.2 
 
 
340 aa  52  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0262823  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0395  hypothetical protein  23.72 
 
 
450 aa  51.2  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4979  Carbohydrate-binding family 9  29.23 
 
 
1418 aa  51.2  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.502529  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3520  hypothetical protein  24.76 
 
 
380 aa  50.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3870  hypothetical protein  22.22 
 
 
743 aa  47.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.345923  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2894  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.63 
 
 
501 aa  47.4  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0121186  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0231  endo-1,4-beta-xylanase  26.29 
 
 
1041 aa  47.8  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540515  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0815  hypothetical protein  20.77 
 
 
760 aa  47.8  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5268  glycoside hydrolase family 39  38.24 
 
 
561 aa  47.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1539  glycoside hydrolase family 39  46.15 
 
 
578 aa  47.8  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.262725 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2610  hypothetical protein  23.22 
 
 
558 aa  46.6  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0114  glycoside hydrolase family 39  45.31 
 
 
544 aa  47  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.747279  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3404  hypothetical protein  25.26 
 
 
457 aa  47  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.386077  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0331  hypothetical protein  22.75 
 
 
476 aa  47.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.638038  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3256  O-antigen polymerase  20.07 
 
 
1025 aa  47  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.711295  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>