More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1927 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_1530  extracellular solute-binding protein family 5  60.52 
 
 		 656 aa  830    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1805  extracellular solute-binding protein family 5  61.74 
 
 		 659 aa  867    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2110  extracellular solute-binding protein  47.4 
 
 		 735 aa  677    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.233193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2113  extracellular solute-binding protein family 5  59.65 
 
 		 729 aa  880    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0745668  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2424  extracellular solute-binding protein  50.67 
 
 		 728 aa  686    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.935396 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3050  extracellular solute-binding protein  47.72 
 
 		 757 aa  667    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0190244  normal  0.13375 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1927  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 735 aa  1523    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.310271  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2808  extracellular solute-binding protein  48.26 
 
 		 727 aa  684    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0309  extracellular solute-binding protein family 5  60.16 
 
 		 765 aa  939    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1687  extracellular solute-binding protein  34.6 
 
 		 664 aa  313  7.999999999999999e-84  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.789812  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1703  extracellular solute-binding protein family 5  32.91 
 
 		 638 aa  299  1e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0293  extracellular solute-binding protein family 5  32.28 
 
 		 640 aa  299  1e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.835457  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0622  extracellular solute-binding protein  32.77 
 
 		 658 aa  295  2e-78  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.16709  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0608  extracellular solute-binding protein  32.77 
 
 		 658 aa  295  2e-78  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0360846  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1677  extracellular solute-binding protein  32.19 
 
 		 655 aa  291  2e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00224475  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0510  extracellular solute-binding protein  32.18 
 
 		 655 aa  275  3e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00108617  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0868  extracellular solute-binding protein  31.19 
 
 		 657 aa  273  8.000000000000001e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0500  extracellular solute-binding protein  29.27 
 
 		 643 aa  272  1e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.464453  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0890  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 657 aa  264  4e-69  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5555  extracellular solute-binding protein  30.36 
 
 		 642 aa  239  2e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.140103  normal  0.0740019 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5255  extracellular solute-binding protein family 5  30.6 
 
 		 651 aa  236  1.0000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.313455  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5178  extracellular solute-binding protein family 5  29.73 
 
 		 645 aa  233  9e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.758105  normal  0.361664 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5447  extracellular solute-binding protein family 5  29.81 
 
 		 645 aa  231  5e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390622 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5515  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  33.4 
 
 		 633 aa  226  1e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0171495  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2454  extracellular solute-binding protein  29.59 
 
 		 682 aa  225  2e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.39331 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7124  extracellular solute-binding protein family 5  27.99 
 
 		 635 aa  223  9e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.104115  normal  0.2013 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5971  extracellular solute-binding protein family 5  27.27 
 
 		 635 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.989436  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3373  extracellular solute-binding protein family 5  29.94 
 
 		 641 aa  211  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0279191  normal  0.223354 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5700  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  28.36 
 
 		 638 aa  207  4e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0714934  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7228  extracellular solute-binding protein family 5  27.97 
 
 		 664 aa  201  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0309461  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3683  extracellular solute-binding protein  27.46 
 
 		 639 aa  201  3.9999999999999996e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.378617  normal  0.495229 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4593  extracellular solute-binding protein  28.28 
 
 		 633 aa  193  9e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.996188 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3931  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  26.06 
 
 		 626 aa  190  7e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6476  extracellular solute-binding protein  30.19 
 
 		 643 aa  190  8e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.864629 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2830  extracellular solute-binding protein  26.87 
 
 		 655 aa  182  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108136  normal  0.289716 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4483  twin-arginine translocation pathway signal  27.68 
 
 		 686 aa  181  4e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14300  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  24.28 
 
 		 671 aa  178  3e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.860083 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0595  extracellular solute-binding protein family 5  29.04 
 
 		 645 aa  166  1.0000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3160  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  26.75 
 
 		 679 aa  165  3e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0639  extracellular solute-binding protein family 5  28.36 
 
 		 580 aa  147  6e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000307469  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4140  extracellular solute-binding protein  28.11 
 
 		 693 aa  140  7e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0860796  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6877  extracellular solute-binding protein family 5  28.32 
 
 		 695 aa  131  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0668794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5907  extracellular solute-binding protein family 5  28.29 
 
 		 696 aa  130  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2592  extracellular solute-binding protein family 5  28.6 
 
 		 573 aa  129  3e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2595  extracellular solute-binding protein family 5  26.83 
 
 		 589 aa  127  5e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.118312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0366  extracellular solute-binding protein family 5  28.28 
 
 		 607 aa  126  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0359  extracellular solute-binding protein family 5  28.02 
 
 		 607 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4719  extracellular solute-binding protein  28.69 
 
 		 591 aa  126  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.42042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1660  extracellular solute-binding protein family 5  26.82 
 
 		 589 aa  124  6e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.299882  normal  0.183706 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1663  extracellular solute-binding protein family 5  27.09 
 
 		 578 aa  123  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0397427  normal  0.183706 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5120  ABC transporter substrate binding protein (alpha-galactoside)  28.06 
 
 		 695 aa  122  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0244807  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2510  extracellular solute-binding protein  26.88 
 
 		 584 aa  122  3e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.543923  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1832  extracellular solute-binding protein family 5  27.16 
 
 		 587 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.315611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1169  oligopeptide-binding protein of oligopeptide ABC transporter  25.51 
 
 		 587 aa  117  1.0000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.317639  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1172  family 1 extracellular solute-binding protein  29.01 
 
 		 594 aa  116  1.0000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1649  extracellular solute-binding protein family 5  28.61 
 
 		 584 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1810  extracellular solute-binding protein  25.61 
 
 		 595 aa  112  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1182  extracellular solute-binding protein family 5  25.69 
 
 		 581 aa  112  3e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1386  extracellular solute-binding protein  26.84 
 
 		 578 aa  109  2e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.37673  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1344  extracellular solute-binding protein  25.21 
 
 		 638 aa  109  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.439366 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1143  extracellular solute-binding protein family 5  26.23 
 
 		 577 aa  108  3e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0057674  normal  0.283725 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2583  putative ABC transporter, substrate binding subunit  29.6 
 
 		 524 aa  106  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0432339 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0563  extracellular solute-binding protein  27.91 
 
 		 536 aa  104  6e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0406443  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2761  extracellular solute-binding protein  26.41 
 
 		 544 aa  104  6e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7558  putative dipeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  28.79 
 
 		 515 aa  102  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0390  extracellular solute-binding protein  28.74 
 
 		 579 aa  99.4  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1564  extracellular solute-binding protein  27.7 
 
 		 578 aa  99.4  2e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00697686  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  25.55 
 
 		 544 aa  99.4  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0406  extracellular solute-binding protein  28.95 
 
 		 579 aa  99  3e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1326  extracellular solute-binding protein  29.41 
 
 		 587 aa  99  3e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000186412  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0671  extracellular solute-binding protein  29.41 
 
 		 534 aa  98.6  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3843  extracellular solute-binding protein family 5  25 
 
 		 530 aa  97.8  6e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0512301  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1651  extracellular solute-binding protein  29.01 
 
 		 516 aa  97.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1367  extracellular solute-binding protein family 5  23.99 
 
 		 577 aa  96.7  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0090511  hitchhiker  0.000580883 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  26.68 
 
 		 544 aa  96.7  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  25.63 
 
 		 540 aa  95.5  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0146  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.17 
 
 		 539 aa  95.9  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  23.4 
 
 		 524 aa  94.7  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1815  extracellular solute-binding protein family 5  28.1 
 
 		 535 aa  94.7  6e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.847688  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  28.5 
 
 		 544 aa  94  8e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1565  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  24.01 
 
 		 534 aa  93.6  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2585  putative ABC transporter, substrate binding subunit  24.76 
 
 		 520 aa  93.2  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598963 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4831  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  27.35 
 
 		 527 aa  92.8  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.153883  normal  0.947205 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0210  extracellular solute-binding protein  23.35 
 
 		 512 aa  91.3  6e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0873116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5370  extracellular solute-binding protein family 5  25.95 
 
 		 629 aa  90.5  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.358498 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0140  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23.36 
 
 		 534 aa  90.5  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259377  normal  0.633025 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2749  extracellular solute-binding protein family 5  24.64 
 
 		 645 aa  89.4  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.655087  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1807  extracellular solute-binding protein family 5  26.22 
 
 		 528 aa  89.7  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0426  extracellular solute-binding protein  26.09 
 
 		 522 aa  89.4  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.133353  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5235  extracellular solute-binding protein family 5  25.5 
 
 		 522 aa  88.2  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  23.96 
 
 		 508 aa  87.8  7e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3566  dipeptide/oligopeptide-binding protein  25.81 
 
 		 562 aa  87  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.672958  normal  0.0864129 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0542  extracellular solute-binding protein family 5  24.38 
 
 		 537 aa  87  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.578152 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1507  extracellular solute-binding protein family 5  28.21 
 
 		 516 aa  86.3  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.221484  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0699  extracellular solute-binding protein family 5  25.79 
 
 		 590 aa  86.7  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7214  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  26.45 
 
 		 532 aa  85.9  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5138  putative periplasmic peptide-binding protein ABC transporter  26.78 
 
 		 495 aa  85.5  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0462348 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2547  extracellular solute-binding protein  24.17 
 
 		 534 aa  84.7  0.000000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2397  extracellular solute-binding protein  22.8 
 
 		 597 aa  84.3  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0332  extracellular solute-binding protein  25.78 
 
 		 523 aa  84.3  0.000000000000008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>