More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0985 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0716  helicase domain-containing protein  46.16 
 
 		 819 aa  645    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000339602 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0985  helicase domain-containing protein  100 
 
 		 813 aa  1644    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.033377  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1805  helicase domain-containing protein  29.18 
 
 		 1013 aa  179  2e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0202  helicase domain protein  28.57 
 
 		 1170 aa  157  9e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0567319 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  27.26 
 
 		 1172 aa  150  8e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  27.5 
 
 		 1169 aa  150  9e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  29.25 
 
 		 952 aa  150  9e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1096  helicase domain-containing protein  30.05 
 
 		 964 aa  150  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2144  helicase domain protein  28.28 
 
 		 1160 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.270016  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2099  helicase domain protein  27.61 
 
 		 1194 aa  149  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  27.5 
 
 		 1169 aa  146  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  32.02 
 
 		 919 aa  146  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0273  helicase domain-containing protein  31.02 
 
 		 919 aa  142  3e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2671  helicase domain protein  29.09 
 
 		 949 aa  140  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.672635 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3376  helicase domain-containing protein  25.58 
 
 		 877 aa  139  3.0000000000000003e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1846  helicase domain-containing protein  26.93 
 
 		 1170 aa  136  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1234  helicase domain protein  27.1 
 
 		 1170 aa  135  3.9999999999999996e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0795356  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  25.69 
 
 		 1170 aa  135  3.9999999999999996e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0826  helicase domain-containing protein  27.45 
 
 		 1136 aa  134  5e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3187  helicase domain protein  26.09 
 
 		 969 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1660  helicase/SNF2 family domain protein  27.82 
 
 		 805 aa  132  3e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1609  helicase domain-containing protein  26.14 
 
 		 1129 aa  132  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1345  helicase domain protein  28.26 
 
 		 953 aa  132  3e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0680  helicase domain-containing protein  26.85 
 
 		 1167 aa  130  7.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.272356 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0637  helicase domain protein  27.56 
 
 		 1168 aa  130  9.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2959  helicase domain-containing protein  26.33 
 
 		 937 aa  130  9.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.789708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  28.41 
 
 		 933 aa  130  1.0000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7832  helicase domain protein  28.03 
 
 		 941 aa  129  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0387  helicase domain protein  26.47 
 
 		 584 aa  129  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1596  helicase domain-containing protein  26.2 
 
 		 1137 aa  129  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3005  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  25.86 
 
 		 1212 aa  129  3e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0017  helicase/SNF2 family domain protein  29.31 
 
 		 801 aa  129  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0353  helicase-like  27.29 
 
 		 933 aa  129  3e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2016  helicase domain-containing protein  27 
 
 		 948 aa  128  3e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0196  helicase domain-containing protein  26.44 
 
 		 1167 aa  128  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.037499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1086  helicase-like  27.21 
 
 		 829 aa  128  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35220  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  27.6 
 
 		 960 aa  127  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.608461 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  25.3 
 
 		 988 aa  127  1e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2988  helicase domain-containing protein  26.62 
 
 		 1167 aa  126  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249556  normal  0.0303963 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1236  helicase domain-containing protein  27.49 
 
 		 940 aa  126  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.546222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2539  helicase domain-containing protein  28.94 
 
 		 969 aa  125  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000371025  decreased coverage  0.000313651 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1301  helicase domain protein  25.19 
 
 		 1062 aa  126  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.483393  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5359  helicase domain protein  25.51 
 
 		 1049 aa  126  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  28.41 
 
 		 966 aa  125  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03240  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  28.08 
 
 		 1028 aa  124  8e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  27.56 
 
 		 941 aa  124  8e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  27.56 
 
 		 941 aa  124  8e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3846  helicase domain-containing protein  26.26 
 
 		 1058 aa  123  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.064852 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1019  helicase domain protein  26.07 
 
 		 1160 aa  124  9.999999999999999e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180274  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2362  SNF2-related protein  28.01 
 
 		 555 aa  123  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2756  helicase domain protein  26.79 
 
 		 584 aa  123  1.9999999999999998e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2916  SNF2-related protein  27.02 
 
 		 560 aa  122  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5493  helicase-like protein  28.13 
 
 		 1069 aa  122  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.0695829 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5893  helicase domain-containing protein  28.13 
 
 		 1069 aa  122  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4894  helicase family protein  26.5 
 
 		 952 aa  121  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1920  helicase domain protein  26.72 
 
 		 971 aa  120  9e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4359  putative helicase  25.74 
 
 		 560 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4132  helicase  25.74 
 
 		 560 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3972  SNF2 family helicase  25.74 
 
 		 560 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3982  SNF2 family helicase  25.74 
 
 		 560 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4450  helicase  25.74 
 
 		 560 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.982586  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  24.91 
 
 		 1116 aa  120  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4083  non-specific serine/threonine protein kinase  25.74 
 
 		 560 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4248  putative helicase  25.74 
 
 		 560 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1314  helicase domain-containing protein  26.59 
 
 		 982 aa  120  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0213  SNF2-related protein  26.2 
 
 		 554 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3680  SNF2-related:helicase, C-terminal  24.43 
 
 		 1045 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  28.19 
 
 		 969 aa  118  3e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4828  helicase family protein  26.74 
 
 		 952 aa  119  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5808  helicase family protein  26.74 
 
 		 952 aa  119  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2648  helicase domain protein  26.44 
 
 		 950 aa  118  3.9999999999999997e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1355  helicase domain-containing protein  25.36 
 
 		 954 aa  118  3.9999999999999997e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0063  Type III restriction enzyme, res subunit  26.73 
 
 		 962 aa  118  5e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2726  helicase domain protein  26.14 
 
 		 1057 aa  117  6.9999999999999995e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.48932 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3885  helicase domain-containing protein  26.61 
 
 		 952 aa  117  7.999999999999999e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.929535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2198  helicase domain-containing protein  24.72 
 
 		 1046 aa  117  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.33194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1177  helicase domain-containing protein  24.81 
 
 		 1031 aa  116  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.304258  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4306  helicase, putative  25.53 
 
 		 560 aa  116  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4340  putative helicase  25.32 
 
 		 560 aa  116  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.486196  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3989  helicase domain-containing protein  26.34 
 
 		 1145 aa  116  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.164502 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0900  putative helicase  25.53 
 
 		 560 aa  115  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2324  helicase domain protein  27.22 
 
 		 1095 aa  113  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08850  helicase domain protein  26.32 
 
 		 467 aa  113  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000230967  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4276  helicase-like  26.03 
 
 		 1138 aa  113  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2545  helicase domain protein  26.62 
 
 		 1038 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0721063  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0352  helicase domain protein  26.34 
 
 		 937 aa  111  5e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0640  helicase-like  27.43 
 
 		 972 aa  110  8.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.060382 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1416  helicase domain protein  26.33 
 
 		 945 aa  110  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5420  helicase domain-containing protein  26.92 
 
 		 1046 aa  110  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0259  helicase domain-containing protein  27.03 
 
 		 578 aa  109  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4171  helicase domain-containing protein  27.33 
 
 		 947 aa  109  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3743  helicase domain protein  25.5 
 
 		 973 aa  108  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0811  helicase-like protein  25.9 
 
 		 1201 aa  108  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0827  helicase domain-containing protein  25.9 
 
 		 1201 aa  108  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1801  SNF2-related protein  27.03 
 
 		 572 aa  107  6e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0724538  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1301  helicase domain-containing protein  25.83 
 
 		 958 aa  107  9e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2591  helicase domain protein  24.6 
 
 		 957 aa  106  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000604323 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0233  Type III restriction enzyme, res subunit  25.98 
 
 		 900 aa  106  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179652  decreased coverage  0.00064314 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0251  helicase  26.29 
 
 		 541 aa  105  4e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.432976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4128  helicase domain protein  31.8 
 
 		 1131 aa  104  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33452  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>