187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2991 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2991  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
271 aa  540  1e-153  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1384  polysaccharide deacetylase  44.7 
 
 
279 aa  216  4e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0165  polysaccharide deacetylase  38.89 
 
 
227 aa  162  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  27.12 
 
 
324 aa  81.6  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  26.42 
 
 
373 aa  77.8  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0341  polysaccharide deacetylase  30.77 
 
 
335 aa  76.3  0.0000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  25.5 
 
 
417 aa  75.5  0.000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0065  polysaccharide deacetylase  30.41 
 
 
365 aa  73.9  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00184975  hitchhiker  0.0058603 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  27.14 
 
 
320 aa  72.8  0.000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2833  polysaccharide deacetylase  38.52 
 
 
227 aa  70.9  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.163356  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1187  polysaccharide deacetylase  26.98 
 
 
292 aa  70.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  25.65 
 
 
387 aa  69.7  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2769  polysaccharide deacetylase  28.74 
 
 
273 aa  70.1  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.322155 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0255  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
199 aa  66.6  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0110  polysaccharide deacetylase  26.06 
 
 
344 aa  66.2  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000182672  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  29.23 
 
 
267 aa  65.9  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1306  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  26.42 
 
 
271 aa  65.5  0.0000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0113  polysaccharide deacetylase  29.47 
 
 
503 aa  64.3  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00270  deacetylase, putative  29.5 
 
 
253 aa  64.3  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11117  glycosyl hydrolase  27.14 
 
 
291 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.886951 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  23.32 
 
 
221 aa  64.3  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  31.01 
 
 
299 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2787  polysaccharide deacetylase  30.53 
 
 
404 aa  63.2  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3218  polysaccharide deacetylase  31.58 
 
 
465 aa  63.2  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.578565  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1074  polysaccharide deacetylase  24.53 
 
 
320 aa  62.8  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0121745  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4011  polysaccharide deacetylase  29.29 
 
 
360 aa  62.8  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243359  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2684  polysaccharide deacetylase  28.83 
 
 
294 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.569149 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0662  xylanase/chitin deacetylase-like protein  29.73 
 
 
468 aa  62  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  25.49 
 
 
204 aa  61.6  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0410  Delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  22.92 
 
 
260 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0475  polysaccharide deacetylase  26.18 
 
 
336 aa  61.6  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0117021  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  31.58 
 
 
542 aa  61.2  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  27.23 
 
 
264 aa  60.8  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2967  polysaccharide deacetylase  26.14 
 
 
285 aa  60.8  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000931063  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1016  polysaccharide deacetylase  26.04 
 
 
294 aa  60.8  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07950  polysaccharide deacetylase  24.38 
 
 
263 aa  61.2  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0404  Delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  21.43 
 
 
260 aa  60.5  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0244  glycoside hydrolase family 11  30.73 
 
 
692 aa  59.7  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0540  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  21.43 
 
 
260 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0217877  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0411  polysaccharide deacetylase  21.43 
 
 
260 aa  59.3  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0402  polysaccharide deacetylase  21.43 
 
 
260 aa  59.3  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0398  polysaccharide deacetylase  21.43 
 
 
260 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4834  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  21.43 
 
 
260 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.150382  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0245  glycoside hydrolase family 10  30.17 
 
 
1001 aa  59.3  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0424  polysaccharide deacetylase  21.43 
 
 
260 aa  59.3  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0470  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  21.43 
 
 
260 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3669  polysaccharide deacetylase  24.64 
 
 
250 aa  59.3  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0489  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  21.76 
 
 
260 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0304  polysaccharide deacetylase  28.77 
 
 
287 aa  59.3  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0920  polysaccharide deacetylase family protein  28.5 
 
 
270 aa  58.2  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1621  xylanase/chitin deacetylase  26.17 
 
 
488 aa  58.5  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2517  polysaccharide deacetylase  26.27 
 
 
258 aa  58.5  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.197208  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3179  polysaccharide deacetylase  24.39 
 
 
295 aa  58.5  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0540  polysaccharide deacetylase, putative  20.92 
 
 
260 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  25.99 
 
 
1120 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0951  polysaccharide deacetylase  29.95 
 
 
409 aa  57.4  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0651013  normal  0.44667 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1004  polysaccharide deacetylase  24.86 
 
 
338 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.794794  normal  0.121632 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3069  polysaccharide deacetylase  26.46 
 
 
465 aa  57.8  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1579  polysaccharide deacetylase  30 
 
 
262 aa  57.4  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0426  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  23.71 
 
 
267 aa  57  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2866  polysaccharide deacetylase  27.67 
 
 
382 aa  57  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01800  chitin deacetylase, putative  35.85 
 
 
470 aa  56.6  0.0000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.61842  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0316  polysaccharide deacetylase  29.05 
 
 
287 aa  56.6  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0777924  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  30.16 
 
 
251 aa  57  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6658  xylanase/chitin deacetylase-like protein  28.11 
 
 
287 aa  56.2  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111973  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0801  polysaccharide deacetylase  26.56 
 
 
537 aa  56.2  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147243  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0797  polysaccharide deacetylase  30.15 
 
 
301 aa  55.8  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0108437  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0557  polysaccharide deacetylase  22.34 
 
 
256 aa  55.5  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1963  polysaccharide deacetylase  27.07 
 
 
263 aa  55.5  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  25.85 
 
 
372 aa  55.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  24 
 
 
279 aa  54.3  0.000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2055  sporulation protein, polysaccharide deacetylase family  27.86 
 
 
327 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3983  polysaccharide deacetylase  27.6 
 
 
284 aa  54.7  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2673  polysaccharide deacetylase  25.67 
 
 
413 aa  54.3  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0653115  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3360  polysaccharide deacetylase  36.75 
 
 
202 aa  54.7  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0110446 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  27.27 
 
 
321 aa  53.5  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0571  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 
309 aa  53.5  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  25.13 
 
 
405 aa  53.5  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3558  xylanase/chitin deacetylase-like protein  34.27 
 
 
321 aa  53.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00485145  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1162  sporulation protein, polysaccharide deacetylase family  28.36 
 
 
321 aa  53.5  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00597989  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1987  polysaccharide deacetylase  31.71 
 
 
256 aa  53.5  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1057  polysaccharide deacetylase  28.21 
 
 
241 aa  52.8  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00359721  hitchhiker  0.000209945 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2817  polysaccharide deacetylase  27.17 
 
 
300 aa  53.1  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4651  polysaccharide deacetylase  27.41 
 
 
247 aa  53.1  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2251  polysaccharide deacetylase  21.88 
 
 
291 aa  52.8  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284926  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1932  polysaccharide deacetylase  26.02 
 
 
522 aa  52.8  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.461546  normal  0.430114 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09380  Putative uncharacterized protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AQQ0]  27.68 
 
 
237 aa  52.8  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.124183 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4749  polysaccharide deacetylase  24.14 
 
 
240 aa  51.6  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1373  polysaccharide deacetylase  27.93 
 
 
267 aa  51.6  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00379023 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0935  polysaccharide deacetylase  25.76 
 
 
281 aa  52  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0476216  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1655  polysaccharide deacetylase  25.49 
 
 
244 aa  50.8  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  21.13 
 
 
261 aa  50.8  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3817  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  25.76 
 
 
344 aa  50.8  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0327337  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4917  polysaccharide deacetylase  26.54 
 
 
212 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01852  Chitin deacetylasePutative uncharacterized protein (EC 3.5.1.41); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BC78]  31.71 
 
 
249 aa  50.8  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  34.17 
 
 
1099 aa  50.4  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1565  polysaccharide deacetylase  28.33 
 
 
345 aa  50.4  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.869415  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2151  polysaccharide deacetylase  27.35 
 
 
294 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.342073  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2765  polysaccharide deacetylase  27.35 
 
 
294 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.468013  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0567  polysaccharide deacetylase  22.64 
 
 
258 aa  50.4  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0123603  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>