162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0351 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0351  CRISPR-associated helicase Cas3  100 
 
 		 651 aa  1286    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0262148  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1125  CRISPR-associated helicase Cas3  32.17 
 
 		 880 aa  248  2e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00422902  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3002  CRISPR-associated helicase Cas3  28.35 
 
 		 794 aa  197  5.000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.201013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1805  hypothetical protein  27.85 
 
 		 794 aa  191  2.9999999999999997e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0396  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  31.37 
 
 		 792 aa  191  2.9999999999999997e-47  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.514257  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0663  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  30.69 
 
 		 738 aa  182  1e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.98376  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1476  metal dependent phosphohydrolase  29.04 
 
 		 728 aa  165  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0102234  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4335  CRISPR-associated helicase Cas3  26.05 
 
 		 904 aa  163  9e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0995159  decreased coverage  0.00193959 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1290  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29 
 
 		 724 aa  162  2e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0826  CRISPR-associated helicase Cas3  25.34 
 
 		 753 aa  160  1e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.650204  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1422  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  27.94 
 
 		 733 aa  159  2e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0408027  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1002  metal dependent phosphohydrolase  26.43 
 
 		 731 aa  157  5.0000000000000005e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3204  CRISPR-associated helicase Cas3  29.71 
 
 		 800 aa  157  7e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0657  CRISPR-associated helicase Cas3  25.04 
 
 		 732 aa  157  8e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.354251  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1879  CRISPR-associated helicase Cas3  26.75 
 
 		 730 aa  156  1e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4288  CRISPR-associated helicase Cas3  28.15 
 
 		 836 aa  154  7e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3519  metal dependent phosphohydrolase  24.17 
 
 		 829 aa  153  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.102828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1010  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  25.81 
 
 		 824 aa  152  2e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3901  CRISPR-associated helicase Cas3  24.86 
 
 		 825 aa  151  3e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1161  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.86 
 
 		 794 aa  149  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3651  CRISPR-associated helicase Cas3  25.86 
 
 		 801 aa  147  5e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3970  metal dependent phosphohydrolase  24.15 
 
 		 792 aa  145  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2978  metal dependent phosphohydrolase  25.09 
 
 		 745 aa  145  3e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0233  CRISPR-associated helicase Cas3  29.1 
 
 		 765 aa  144  5e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.995838  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1941  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  24.91 
 
 		 744 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.557598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0828  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  24.04 
 
 		 752 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3341  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  22.73 
 
 		 751 aa  140  4.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.127091  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1436  CRISPR-associated helicase Cas3  25.99 
 
 		 667 aa  140  7.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0621  CRISPR-associated helicase Cas3  27.34 
 
 		 784 aa  139  2e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1657  CRISPR-associated helicase Cas3  26.65 
 
 		 739 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1295  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  28.24 
 
 		 692 aa  138  4e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1064  metal dependent phosphohydrolase  24.13 
 
 		 722 aa  138  4e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.121674 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1971  CRISPR-associated helicase Cas3  23.59 
 
 		 740 aa  138  4e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0601  metal dependent phosphohydrolase  25.09 
 
 		 745 aa  137  5e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.186068 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3582  CRISPR-associated helicase Cas3  22.7 
 
 		 759 aa  137  7.000000000000001e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0498  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  28.48 
 
 		 724 aa  136  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0539  CRISPR-associated helicase Cas3  24.38 
 
 		 783 aa  136  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1979  metal dependent phosphohydrolase  25.32 
 
 		 732 aa  136  9.999999999999999e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000184282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0267  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  24.27 
 
 		 821 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02701  crispr-associated helicase Cas3 domain protein  24.23 
 
 		 722 aa  134  5e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0428162  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0940  CRISPR-associated helicase Cas3  27.83 
 
 		 800 aa  134  6e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2323  CRISPR-associated helicase Cas3  30.2 
 
 		 778 aa  134  6.999999999999999e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0308  CRISPR-associated helicase Cas3  26.6 
 
 		 777 aa  131  3e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3385  CRISPR-associated protein Cas5  21.46 
 
 		 1084 aa  132  3e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.335684  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31630  CRISPR-associated helicase Cas3  24 
 
 		 661 aa  130  6e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0850  hypothetical protein  28.54 
 
 		 834 aa  130  7.000000000000001e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0475  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  25.32 
 
 		 717 aa  130  8.000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1186  CRISPR-associated helicase Cas3  29.54 
 
 		 776 aa  130  9.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2518  helicases-like protein  24.09 
 
 		 781 aa  129  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3933  CRISPR-associated helicase Cas3  23.34 
 
 		 805 aa  128  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0975  CRISPR-associated helicase Cas3  26.61 
 
 		 821 aa  128  3e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1070  CRISPR-associated helicase Cas3  28.6 
 
 		 772 aa  127  5e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.894632  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1021  CRISPR-associated HD domain-containing protein  26 
 
 		 721 aa  125  2e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0641  CRISPR-associated helicase Cas3  25.61 
 
 		 804 aa  124  6e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.674824  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2661  CRISPR-associated helicase Cas3  25.79 
 
 		 807 aa  124  6e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0239  metal dependent phosphohydrolase  22.76 
 
 		 772 aa  122  9.999999999999999e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15220  CRISPR-associated helicase Cas3  31.87 
 
 		 822 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.280278  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1489  metal dependent phosphohydrolase  25.27 
 
 		 1078 aa  120  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0565561 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0768  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  28.21 
 
 		 820 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1626  metal dependent phosphohydrolase  24.36 
 
 		 782 aa  116  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.869451  normal  0.728835 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1084  CRISPR-associated helicase Cas3  25.84 
 
 		 763 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2836  putative helicase  22.25 
 
 		 856 aa  107  9e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0901  CRISPR-associated helicase Cas3  25.04 
 
 		 737 aa  106  1e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.656814  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1813  metal dependent phosphohydrolase  25.41 
 
 		 729 aa  103  7e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.496732  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2428  CRISPR-associated helicase Cas3  25.42 
 
 		 858 aa  96.7  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2299  CRISPR-associated helicase Cas3  25.22 
 
 		 750 aa  96.3  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3020  CRISPR-associated helicase Cas3  22.28 
 
 		 899 aa  94  9e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00270264  normal  0.0711602 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0309  hypothetical protein  27.3 
 
 		 741 aa  93.6  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0192284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1290  CRISPR-associated helicase Cas3  26.89 
 
 		 795 aa  92  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1451  putative helicase  24.66 
 
 		 864 aa  90.5  8e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1729  CRISPR-associated helicase Cas3  25.72 
 
 		 917 aa  90.5  9e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2005  CRISPR-associated helicase Cas3  24.55 
 
 		 726 aa  90.5  9e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1228  CRISPR-associated helicase Cas3  20.92 
 
 		 905 aa  90.1  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000382234  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2186  CRISPR-associated HD domain protein  25.15 
 
 		 729 aa  89.4  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0671  CRISPR-associated helicase Cas3  26.06 
 
 		 729 aa  89.4  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0444  CRISPR-associated helicase Cas3  27.78 
 
 		 750 aa  89.4  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2024  CRISPR-associated helicase Cas3  23.49 
 
 		 741 aa  84.3  0.000000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1868  CRISPR-associated helicase Cas3  22.43 
 
 		 783 aa  82.8  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5079  CRISPR-associated helicase Cas3  22.4 
 
 		 804 aa  81.6  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0794  helicase-like protein  23.6 
 
 		 747 aa  80.5  0.00000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.850322  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0935  metal dependent phosphohydrolase  23.78 
 
 		 1027 aa  80.1  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6018  CRISPR-associated helicase Cas3  25.31 
 
 		 762 aa  80.1  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0478884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3301  CRISPR-associated helicase Cas3  23.88 
 
 		 779 aa  80.1  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.733843 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0125  CRISPR-associated helicase Cas3  26.67 
 
 		 775 aa  79.3  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0922  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  27.68 
 
 		 736 aa  78.6  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.013511  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1601  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  19.8 
 
 		 970 aa  78.6  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0436721  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2808  CRISPR-associated helicase Cas3, Anaes-subtype  33.87 
 
 		 933 aa  78.2  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0917  CRISPR-associated helicase Cas3  25.52 
 
 		 744 aa  77.8  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000123408 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0569  metal dependent phosphohydrolase  23.14 
 
 		 781 aa  76.3  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.495857 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17130  CRISPR-associated helicase Cas3  19.11 
 
 		 919 aa  75.5  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.390014 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4478  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  24.86 
 
 		 967 aa  74.7  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1228  CRISPR-associated helicase Cas3  29.22 
 
 		 764 aa  74.3  0.000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1354  CRISPR-associated helicase Cas3  26.47 
 
 		 566 aa  73.9  0.000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.245938  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1001  CRISPR-associated helicase Cas3  22.68 
 
 		 801 aa  73.6  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17170  CRISPR-associated helicase Cas3, core  23.36 
 
 		 901 aa  73.6  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.908442  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0593  CRISPR-associated helicase Cas3  22.36 
 
 		 921 aa  72  0.00000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.834864  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1608  CRISPR-associated helicase Cas3  21.01 
 
 		 912 aa  70.5  0.00000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.152444  normal  0.436385 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2670  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  21.84 
 
 		 837 aa  68.2  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1268  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  26.51 
 
 		 488 aa  67.8  0.0000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0968245 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1384  hypothetical protein  21.58 
 
 		 883 aa  67.4  0.0000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>