109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1927 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1927  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 187 aa  386  1e-106  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.381478  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2045  MarR family transcriptional regulator  44.51 
 
 		 190 aa  143  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4567  transcriptional regulator  44.19 
 
 		 186 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.424038  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52070  transcriptional regulator  44.19 
 
 		 186 aa  131  5e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0119857 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2690  MarR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 188 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1503  MarR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 189 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.481743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1088  MarR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 199 aa  121  5e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4905  putative transcriptional regulator  39.77 
 
 		 184 aa  120  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0228  MarR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 192 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.209959 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3772  MarR family transcriptional regulator  37.57 
 
 		 181 aa  110  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.064447  normal  0.0771773 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4209  MarR family transcriptional regulator  39.88 
 
 		 189 aa  108  4.0000000000000004e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0466209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0658  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 191 aa  105  3e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0565  MarR family transcriptional regulator  37.64 
 
 		 189 aa  103  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4139  MarR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1921  MarR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4421  transcriptional regulator, MarR family  31.55 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.636596  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5361  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000465127  normal  0.0688552 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3441  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000000933202  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4926  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000606834  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_003296  RS05199  transcription regulator protein  27.41 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000000214035  normal  0.0753058 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0765  MarR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 161 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00380869  hitchhiker  0.0000756657 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2862  transcriptional regulator, MarR family  34.03 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.182461 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4875  MarR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 148 aa  52.8  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00000623298  hitchhiker  0.0000000014051 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5106  transcriptional regulator, MarR family  27.38 
 
 		 206 aa  51.2  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.248862  normal  0.417373 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2233  transcriptional regulatory protein  32.95 
 
 		 151 aa  50.8  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4358  MarR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 148 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000202613  unclonable  0.00000493526 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3105  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 180 aa  50.4  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.358207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1762  transcriptional regulator, MarR family  25.67 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2911  transcriptional regulator, MarR family  27.61 
 
 		 218 aa  49.7  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.233066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2109  MarR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 145 aa  48.1  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4184  transcriptional regulator, MarR family  30.53 
 
 		 174 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0749  transcriptional regulator, MarR family  45 
 
 		 181 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2675  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 150 aa  47  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 138 aa  47  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2446  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 146 aa  47  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0178  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 158 aa  46.2  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1949  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 		 166 aa  46.2  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0991  transcriptional regulator, MarR family  28.06 
 
 		 166 aa  46.2  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5709  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 176 aa  45.8  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.054314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4209  transcriptional regulator, MarR family  31.96 
 
 		 187 aa  45.4  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2777  transcriptional regulator, MarR family  29.79 
 
 		 183 aa  45.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.975869 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1847  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 178 aa  45.4  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.603807  normal  0.333569 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4021  transcriptional regulator, MarR family  31.52 
 
 		 166 aa  45.4  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000632832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3251  MarR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 212 aa  45.1  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.281041 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 147 aa  45.1  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3344  MarR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 270 aa  43.9  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2156  MarR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 149 aa  44.3  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.309687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0003  MarR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 212 aa  44.3  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0838682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3565  MarR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 165 aa  43.9  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0070  MarR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 212 aa  44.3  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1858  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 196 aa  43.9  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.642234  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  29.92 
 
 		 146 aa  44.3  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0136  transcriptional regulator, MarR family  35.37 
 
 		 153 aa  43.9  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0213  MarR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 270 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0330  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 141 aa  43.5  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2985  MarR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0529502  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0070  MarR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4012  MarR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 200 aa  43.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.911422  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4084  MarR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 200 aa  43.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.574763  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2496  MarR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 165 aa  43.1  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.20382 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3216  MarR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 174 aa  43.5  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0422342 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0088  MarR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.519459 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3063  MarR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 214 aa  43.5  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.565179  normal  0.590776 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3929  transcriptional regulator, MarR family  31.17 
 
 		 212 aa  43.5  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000837661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1460  transcriptional regulator, MarR family  30.1 
 
 		 174 aa  43.5  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000303133 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0465  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 201 aa  43.5  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.203979  normal  0.101553 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1589  transcriptional regulator, MarR family  33.8 
 
 		 153 aa  43.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1859  MarR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 183 aa  42.7  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000190016  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 173 aa  43.1  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2264  transcriptional regulator, MarR family  34.55 
 
 		 158 aa  42.7  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.201704  normal  0.338142 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2581  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 167 aa  42.4  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.562153 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3392  MarR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 270 aa  42.4  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1624  MarR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 270 aa  42.4  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2977  MarR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 270 aa  42.4  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5811  transcriptional regulator, MarR family  31.52 
 
 		 150 aa  42.4  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.212082  normal  0.294475 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01480  transcriptional regulator  35.94 
 
 		 169 aa  42.4  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2351  regulatory protein, MarR  25.2 
 
 		 166 aa  42  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.375584  normal  0.032917 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5112  MarR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 155 aa  42  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522104  normal  0.0529869 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0818  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 147 aa  41.6  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2918  MarR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 213 aa  42  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3934  MarR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 151 aa  41.6  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.530394  decreased coverage  0.00586866 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 143 aa  41.6  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 143 aa  42  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13520  transcriptional regulator  27.37 
 
 		 163 aa  42  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219319  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1313  regulatory protein MarR  28.85 
 
 		 165 aa  42  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0619  MarR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 160 aa  41.6  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.267818  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2352  MarR family regulatory protein  37.25 
 
 		 160 aa  41.6  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0848  MarR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 160 aa  41.6  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1140  MarR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 160 aa  41.6  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1055  MarR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 160 aa  41.6  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435281  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1813  MarR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 160 aa  41.6  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.213004  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4242  MarR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 172 aa  41.6  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.594533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6482  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 172 aa  41.6  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.618469  normal  0.143744 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  31.96 
 
 		 154 aa  41.6  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0049  MarR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 167 aa  41.6  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157141  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0767  transcriptional regulator, MarR family  34.57 
 
 		 150 aa  41.2  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3267  transcriptional regulator, MarR family  25.71 
 
 		 207 aa  41.2  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3511  transcriptional regulator, MarR family  29.37 
 
 		 161 aa  41.6  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.982804  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5466  MarR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 167 aa  41.2  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.17419 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2454  transcriptional regulator, MarR family  26.96 
 
 		 168 aa  41.2  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>