More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2417 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_2417  adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 
1207 aa  2486    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.239282 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3275  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  38.7 
 
 
1094 aa  344  5e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.393091 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3993  adenylate/guanylate cyclase  37.5 
 
 
1209 aa  306  1.0000000000000001e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.787867  normal  0.246996 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3999  adenylate/guanylate cyclase  59.81 
 
 
351 aa  256  2.0000000000000002e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1562  adenylate/guanylate cyclase  53.07 
 
 
435 aa  243  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.165048 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2807  putative PAS/PAC sensor protein  46.24 
 
 
730 aa  233  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.135813 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6414  adenylate cyclase  52.16 
 
 
395 aa  230  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0293466  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11641  membrane-anchored adenylyl cyclase cya  48.61 
 
 
443 aa  227  1e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.512599 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1901  adenylate/guanylate cyclase  52.68 
 
 
381 aa  225  4e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500403  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0605  adenylate/guanylate cyclase  55.98 
 
 
355 aa  223  9.999999999999999e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.657653  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2805  putative PAS/PAC sensor protein  32.35 
 
 
658 aa  221  8.999999999999998e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.126133 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3576  putative adenylate/guanylate cyclase  48.13 
 
 
396 aa  217  9e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0204141 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1571  adenylate/guanylate cyclase  48.62 
 
 
426 aa  215  4.9999999999999996e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000352613  hitchhiker  0.00000380859 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3041  adenylate cyclase  46.67 
 
 
439 aa  213  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.14332  normal  0.182676 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2092  adenylate/guanylate cyclase  50.7 
 
 
395 aa  213  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.498255  normal  0.305178 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3762  putative adenylate/guanylate cyclase  45.74 
 
 
520 aa  212  3e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.978534  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1561  adenylate/guanylate cyclase  49.54 
 
 
417 aa  211  5e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.637281 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3084  adenylate cyclase  46.19 
 
 
439 aa  211  9e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0535498  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3025  adenylate/guanylate cyclase  46.19 
 
 
439 aa  211  9e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3414  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  48.31 
 
 
431 aa  210  1e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.138432  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2803  adenylate/guanylate cyclase  44.39 
 
 
531 aa  192  4e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2839  putative adenylate/guanylate cyclase  48.29 
 
 
421 aa  191  8e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.344898  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2382  adenylate/guanylate cyclase  43.26 
 
 
407 aa  190  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2477  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.32 
 
 
1439 aa  189  2e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131363  normal  0.44536 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0533  adenylate/guanylate cyclase  41.12 
 
 
422 aa  181  5.999999999999999e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.549362  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2379  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.97 
 
 
1509 aa  172  3e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3541  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  57.45 
 
 
655 aa  162  4e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0156  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  37.14 
 
 
1075 aa  159  2e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000640114  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2804  putative PAS/PAC sensor protein  33.97 
 
 
711 aa  159  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0770283 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0093  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.68 
 
 
856 aa  155  5e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3137  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  42.29 
 
 
855 aa  152  4e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.045119  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0675  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  50.7 
 
 
925 aa  152  5e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0641  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.93 
 
 
1648 aa  151  7e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.31 
 
 
1363 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0810  putative PAS/PAC sensor protein  51.33 
 
 
840 aa  148  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.643579  normal  0.828908 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48354  predicted protein  36.82 
 
 
868 aa  147  1e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.951648  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0678  ammonium transporter  38.86 
 
 
1322 aa  146  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760367  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1335  putative PAS/PAC sensor protein  27.84 
 
 
1113 aa  145  5e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48375  predicted protein  40.1 
 
 
1169 aa  144  9.999999999999999e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1035  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  50.71 
 
 
1262 aa  144  9.999999999999999e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48678  predicted protein  39.79 
 
 
806 aa  142  3e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.26048  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2841  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  47.52 
 
 
714 aa  141  6e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.310526 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0808  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.06 
 
 
929 aa  141  8.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2671  putative PAS/PAC sensor protein  40 
 
 
608 aa  140  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4041  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  49.28 
 
 
619 aa  140  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3243  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.52 
 
 
784 aa  140  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3445  putative PAS/PAC sensor protein  39.41 
 
 
608 aa  139  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.18 
 
 
1069 aa  138  6.0000000000000005e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36270  predicted protein  37.5 
 
 
1987 aa  136  1.9999999999999998e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4132  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.51 
 
 
619 aa  136  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50428  predicted protein  35.42 
 
 
816 aa  134  9e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  23.81 
 
 
3706 aa  134  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12462  cyclase  32.18 
 
 
730 aa  131  6e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48350  predicted protein  35.42 
 
 
1773 aa  131  8.000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0719027  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47709  predicted protein  34.38 
 
 
1196 aa  131  8.000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1528  adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 
350 aa  131  8.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4666  putative PAS/PAC sensor protein  40.62 
 
 
608 aa  131  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.169254  normal  0.69923 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38549  predicted protein  37.17 
 
 
1128 aa  131  9.000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2865  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.98 
 
 
853 aa  130  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0225  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  30.1 
 
 
695 aa  129  3e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.590775  normal  0.132241 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  35.64 
 
 
572 aa  128  5e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50497  predicted protein  34.72 
 
 
1165 aa  129  5e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2570  putative PAS/PAC sensor protein  31.19 
 
 
967 aa  126  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3536  putative PAS/PAC sensor protein  31.19 
 
 
967 aa  126  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0211  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  38.5 
 
 
1076 aa  125  3e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0293553 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49555  predicted protein  32.49 
 
 
1198 aa  125  5e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.69 
 
 
1369 aa  125  5e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.12 
 
 
859 aa  125  7e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000388966 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2304  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.48 
 
 
870 aa  123  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2783  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  31.25 
 
 
1101 aa  121  6e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2460  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.97 
 
 
797 aa  121  7.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  36.41 
 
 
665 aa  121  9e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0215  adenylate/guanylate cyclase  33.17 
 
 
351 aa  120  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.354021  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1149  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.21 
 
 
833 aa  119  3e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.355741  normal  0.205094 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  21.75 
 
 
1390 aa  119  3.9999999999999997e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1041  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.54 
 
 
1121 aa  119  3.9999999999999997e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.700011  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3384  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.55 
 
 
898 aa  119  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1142  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.37 
 
 
631 aa  118  7.999999999999999e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43826  predicted protein  33.52 
 
 
1003 aa  117  1.0000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.911661  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1628  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.05 
 
 
1070 aa  117  1.0000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0777  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.16 
 
 
1019 aa  116  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0117  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF and PAS/PAC sensor  25.8 
 
 
2361 aa  116  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2177  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.59 
 
 
885 aa  116  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1744  Signal transduction histidine kinase  36.17 
 
 
893 aa  115  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.410742  normal  0.243263 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0981  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.4 
 
 
1791 aa  115  5e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.37 
 
 
1516 aa  114  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3741  putative PAS/PAC sensor protein  24.45 
 
 
1268 aa  114  9e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3109  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.03 
 
 
901 aa  114  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.143082 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1908  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain  33.94 
 
 
518 aa  114  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136997  normal  0.266082 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1409  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.77 
 
 
778 aa  114  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3600  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.12 
 
 
900 aa  114  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.182555  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2771  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.32 
 
 
1557 aa  114  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  25.45 
 
 
1676 aa  113  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1419  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.51 
 
 
831 aa  112  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1638  putative adenylate/guanylate cyclase  35.82 
 
 
515 aa  112  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.739692  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  24.34 
 
 
771 aa  112  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2253  adenylate cyclase  36.63 
 
 
518 aa  111  9.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0171825 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0211  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  26.32 
 
 
638 aa  110  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0281  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.85 
 
 
688 aa  110  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.113851 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1075  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.15 
 
 
829 aa  109  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.46099e-33 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>