More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3279 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3279  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  100 
 
 
534 aa  1075    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000208595  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1984  Trypsin-like protein serine protease typically periplasmic containing C-terminal PDZ domain-like protein  51.46 
 
 
572 aa  465  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0467  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.41 
 
 
497 aa  246  6e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2023  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.19 
 
 
537 aa  146  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0936  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.01 
 
 
464 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4052  hypothetical protein  28.21 
 
 
419 aa  98.6  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0134377 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2395  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  26.05 
 
 
556 aa  73.9  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4323  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.59 
 
 
405 aa  63.9  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  28.57 
 
 
461 aa  63.2  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2470  protease Do  33.08 
 
 
506 aa  60.8  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.769337  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2849  serine protease, DO/DeqQ family  33.08 
 
 
506 aa  60.8  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.489599  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1186  HtrA2 peptidase  36.3 
 
 
597 aa  60.5  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.934322  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0606  protease Do  37.96 
 
 
523 aa  60.5  0.00000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0210206 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  34.65 
 
 
483 aa  60.1  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  34.65 
 
 
483 aa  60.1  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3690  HtrA2 peptidase  34.96 
 
 
396 aa  59.7  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.104241  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  34.65 
 
 
483 aa  60.1  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  31.5 
 
 
464 aa  58.9  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2673  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.41 
 
 
379 aa  58.5  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.314842 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1135  protease Do  36.73 
 
 
535 aa  58.5  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0073  2-alkenal reductase  33.64 
 
 
459 aa  58.2  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0754695 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0073  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.41 
 
 
474 aa  57.8  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2530  hypothetical protein  22.84 
 
 
542 aa  57.8  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.67728 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1952  protease Do  40.95 
 
 
473 aa  57.4  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.151255  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0559  PDZ/DHR/GLGF domain protein  35.77 
 
 
487 aa  57.4  0.0000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  30.83 
 
 
464 aa  57  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  31.5 
 
 
458 aa  57  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2956  protease Do  35.71 
 
 
472 aa  57  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000460419  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1207  serine protease  36.27 
 
 
474 aa  57  0.0000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.653201  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1170  serine protease  36.27 
 
 
474 aa  57  0.0000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.143543  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  35.71 
 
 
484 aa  57  0.0000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1776  2-alkenal reductase  38.05 
 
 
411 aa  57  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.753058 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  34.31 
 
 
462 aa  56.2  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  33.64 
 
 
487 aa  56.2  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1052  serine protease  33.6 
 
 
471 aa  56.6  0.000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.72618  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  40 
 
 
479 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  33.06 
 
 
475 aa  56.2  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  31.5 
 
 
457 aa  56.2  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  40 
 
 
492 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2877  2-alkenal reductase  38.05 
 
 
402 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1880  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.31 
 
 
386 aa  55.8  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0947444  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0885  PDZ/DHR/GLGF  37.21 
 
 
375 aa  55.8  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  40 
 
 
477 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2079  HtrA2 peptidase  33.59 
 
 
420 aa  55.5  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.376096  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5776  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  31.2 
 
 
507 aa  55.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.843261 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3219  HtrA2 peptidase  38.05 
 
 
402 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228684  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1646  serine protease, DO/DeqQ family  34.69 
 
 
494 aa  55.1  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.17535  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1346  protease Do  34.69 
 
 
494 aa  55.1  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.62004  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0037  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.67 
 
 
307 aa  55.1  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1243  2-alkenal reductase  27.27 
 
 
397 aa  55.5  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.904095  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0079  2-alkenal reductase  31.48 
 
 
474 aa  55.1  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0091  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.48 
 
 
474 aa  55.1  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000577253  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1175  2-alkenal reductase  26.89 
 
 
397 aa  55.1  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.561238  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1594  protease Do  38.46 
 
 
520 aa  55.1  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1343  protease Do  36.73 
 
 
481 aa  55.5  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.139056  normal  0.641282 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1982  protease Do  35.29 
 
 
476 aa  54.7  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.358947  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0833  protease DO  35.64 
 
 
497 aa  54.3  0.000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0653734  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3911  protease Do  25 
 
 
485 aa  54.7  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  27.78 
 
 
476 aa  54.7  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0845  peptidase S1  32.8 
 
 
471 aa  54.3  0.000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1365  peptidase S1C, Do  38.46 
 
 
482 aa  54.3  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0859447  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0916  HtrA2 peptidase  30.3 
 
 
383 aa  54.3  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13730  HtrA serine protease  36.63 
 
 
473 aa  54.3  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1628  peptidase S1C, Do  37.76 
 
 
478 aa  54.7  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  36.63 
 
 
474 aa  54.3  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  30.83 
 
 
485 aa  53.9  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  26.44 
 
 
482 aa  53.9  0.000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2013  protease Do  33.6 
 
 
524 aa  53.9  0.000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316391  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0424  2-alkenal reductase  30.15 
 
 
444 aa  53.9  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.943038  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2993  protease Do  36.27 
 
 
476 aa  53.9  0.000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.700896 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1208  protease Do  34.69 
 
 
475 aa  53.5  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2259  protease Do  33.66 
 
 
492 aa  53.5  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.661037  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1015  hypothetical protein  29.92 
 
 
541 aa  53.5  0.000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0620  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.64 
 
 
674 aa  53.5  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5236  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  28.68 
 
 
466 aa  53.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2386  protease Do  39.22 
 
 
491 aa  53.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1859  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.65 
 
 
544 aa  53.5  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.308507  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3776  PDZ/DHR/GLGF  32.19 
 
 
483 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2658  protease signal peptide protein  35.35 
 
 
502 aa  53.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1115  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.57 
 
 
334 aa  53.5  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1441  peptidase S1C, Do  31.67 
 
 
523 aa  53.1  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0871  protease Do  32.74 
 
 
500 aa  53.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5274  protease Do  38.32 
 
 
501 aa  53.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  39.05 
 
 
477 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0197  HtrA2 peptidase  30.13 
 
 
369 aa  53.1  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4416  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.67 
 
 
410 aa  53.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.464298  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0274  protease Do  36.54 
 
 
509 aa  53.1  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.408213 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4394  serine protease  29.82 
 
 
254 aa  52  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4221  serine protease, MucD  39.05 
 
 
479 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560498  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1117  protease Do  33.67 
 
 
491 aa  52  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0590546  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3955  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  39.05 
 
 
481 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0637  protease Do  31.25 
 
 
517 aa  52.8  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.136267  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5068  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.58 
 
 
416 aa  52.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.705563  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1999  protease Do  33.33 
 
 
506 aa  52.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0697759  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0355  serine protease  33.33 
 
 
493 aa  52.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0986  HtrA2 peptidase  29.41 
 
 
382 aa  52.4  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00462206 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0641  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.58 
 
 
381 aa  52.4  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  31.58 
 
 
476 aa  52.4  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  32.65 
 
 
481 aa  52.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1087  protease Do  38.32 
 
 
477 aa  52.4  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.386741  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>