203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2258 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2258  DNA polymerase LigD polymerase domain-containing subunit  100 
 
 		 332 aa  673    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.20495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6714  DNA primase small subunit  74.32 
 
 		 334 aa  524  1e-147  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0437742  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1571  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  63.69 
 
 		 330 aa  429  1e-119  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1543  DNA primase, small subunit  60.79 
 
 		 341 aa  418  1e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.881236  normal  0.307141 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1378  hypothetical protein  61.45 
 
 		 339 aa  414  9.999999999999999e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.200655  normal  0.549475 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1486  DNA polymerase LigD polymerase subunit  61.4 
 
 		 341 aa  417  9.999999999999999e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00018157 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1945  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  57.48 
 
 		 355 aa  387  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000971032  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1675  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  56.77 
 
 		 371 aa  385  1e-106  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0584  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  55.75 
 
 		 354 aa  380  1e-104  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0275907  hitchhiker  0.000216971 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13762  hypothetical protein  59.17 
 
 		 346 aa  380  1e-104  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.798941 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1274  DNA primase, small subunit  56.89 
 
 		 349 aa  370  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.558044  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0491  DNA primase small subunit  53.03 
 
 		 361 aa  366  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.209898  normal  0.702763 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5542  hypothetical protein  56.59 
 
 		 349 aa  368  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5283  DNA primase, small subunit  56.59 
 
 		 347 aa  362  6e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4915  hypothetical protein  56.59 
 
 		 347 aa  362  7.0000000000000005e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0135401  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5004  hypothetical protein  56.59 
 
 		 347 aa  362  7.0000000000000005e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.761919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5867  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  53.59 
 
 		 357 aa  361  1e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.890125  normal  0.143768 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0652  DNA primase small subunit  56.42 
 
 		 341 aa  357  1.9999999999999998e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.515323  normal  0.0515309 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3665  hypothetical protein  54.71 
 
 		 360 aa  353  2e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3833  DNA primase small subunit  53.31 
 
 		 380 aa  352  4e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0416  DNA primase small subunit  54.12 
 
 		 360 aa  350  1e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0821  DNA primase small subunit  52.51 
 
 		 360 aa  338  5.9999999999999996e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2236  DNA primase small subunit  52.16 
 
 		 323 aa  338  5.9999999999999996e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.848931  normal  0.182306 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2830  DNA primase small subunit  54.29 
 
 		 427 aa  338  8e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2095  DNA primase, small subunit  52.16 
 
 		 360 aa  337  1.9999999999999998e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.59622  normal  0.161983 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0584  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  53.25 
 
 		 329 aa  330  2e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1787  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  51.69 
 
 		 340 aa  330  2e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000694862 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0664  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  54.4 
 
 		 334 aa  327  2.0000000000000001e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.286197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2445  putative DNA ligase (ATP), C-terminal  53.07 
 
 		 326 aa  326  3e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.858354  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2946  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  52.96 
 
 		 314 aa  325  1e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3272  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  54.33 
 
 		 328 aa  324  1e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.161629  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2031  hypothetical protein  51.08 
 
 		 340 aa  321  9.000000000000001e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.232126  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4038  DNA primase small subunit  50.6 
 
 		 364 aa  312  4.999999999999999e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6628  DNA primase small subunit  50.15 
 
 		 358 aa  307  1.0000000000000001e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0103402  hitchhiker  0.0000202322 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3426  hypothetical protein  49.84 
 
 		 414 aa  302  4.0000000000000003e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.467651  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0342  DNA primase, small subunit  51.72 
 
 		 412 aa  303  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.938834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3206  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  50.88 
 
 		 414 aa  295  6e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0396  hypothetical protein  47.63 
 
 		 412 aa  295  1e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00684947  normal  0.451981 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4154  DNA primase small subunit  52.86 
 
 		 408 aa  293  2e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.348836  normal  0.978255 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5821  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  48.28 
 
 		 352 aa  286  2.9999999999999996e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.305654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15620  DNA polymerase LigD, polymerase domain  45.94 
 
 		 353 aa  284  1.0000000000000001e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.19081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10273  hypothetical protein  48.29 
 
 		 397 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0854972 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0360  hypothetical protein  46.89 
 
 		 434 aa  279  4e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0482134  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0370  hypothetical protein  46.89 
 
 		 434 aa  279  4e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0349  DNA primase, small subunit  47.14 
 
 		 434 aa  279  5e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2067  hypothetical protein  41.33 
 
 		 312 aa  216  5e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0552463 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2082  hypothetical protein  39.6 
 
 		 306 aa  206  3e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1124  hypothetical protein  33.92 
 
 		 303 aa  194  1e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0598  hypothetical protein  37.93 
 
 		 314 aa  189  4e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.479165  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0998  DNA ligase D  34.71 
 
 		 861 aa  189  5e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2837  ATP-dependent DNA ligase  32.11 
 
 		 896 aa  188  1e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1986  DNA primase, small subunit  35.29 
 
 		 303 aa  183  3e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.328453  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0939  DNA ligase D  38.06 
 
 		 847 aa  179  4e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03410  DNA polymerase LigD polymerase domain protein  30.36 
 
 		 313 aa  179  5.999999999999999e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6404  DNA ligase D  30.99 
 
 		 646 aa  178  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0822092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3303  ATP dependent DNA ligase  32.86 
 
 		 855 aa  175  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.300283  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0139  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  32.75 
 
 		 306 aa  172  9e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3085  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  31.14 
 
 		 299 aa  171  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.884253 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0365  DNA ligase D  32.86 
 
 		 902 aa  170  4e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.215692 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1670  DNA primase-like  37.19 
 
 		 527 aa  168  2e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.447053  hitchhiker  0.00316977 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3982  DNA ligase D  36.55 
 
 		 837 aa  166  5e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.242041 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0201  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  34.31 
 
 		 778 aa  166  6.9999999999999995e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.173659  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0128  DNA ligase D  33.11 
 
 		 871 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0109  DNA ligase D  32.77 
 
 		 872 aa  163  3e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0363186 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1337  ATP dependent DNA ligase  36.88 
 
 		 868 aa  163  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.402102 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3248  DNA polymerase LigD polymerase subunit  35.42 
 
 		 328 aa  162  9e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5249  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  35.36 
 
 		 292 aa  161  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.398866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2679  ATP-dependent DNA ligase  36.12 
 
 		 868 aa  160  4e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0258  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  37.87 
 
 		 292 aa  159  7e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.863775  normal  0.0831069 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1218  ATP dependent DNA ligase  35.74 
 
 		 846 aa  158  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.257773 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4716  DNA ligase D  32.74 
 
 		 815 aa  157  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.795355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1702  DNA ligase D  31.43 
 
 		 877 aa  157  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170827  hitchhiker  0.00786599 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4308  DNA polymerase LigD polymerase subunit  30.58 
 
 		 306 aa  156  5.0000000000000005e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1301  hypothetical protein  34.85 
 
 		 301 aa  155  7e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34930  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  35.52 
 
 		 303 aa  155  8e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564701  normal  0.292075 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0817  DNA ligase D, 3'-phosphoesterase domain protein  35.09 
 
 		 522 aa  154  2e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.138014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2631  DNA ligase D  35.74 
 
 		 865 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2863  DNA primase-like  29.37 
 
 		 352 aa  154  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.355668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7647  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  35.08 
 
 		 544 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5282  DNA ligase D  33.46 
 
 		 658 aa  152  7e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.889453 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1207  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  36.12 
 
 		 302 aa  152  8e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.560779  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2856  DNA primase-like  34.29 
 
 		 455 aa  152  8.999999999999999e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.101034  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1729  DNA ligase D  34.54 
 
 		 813 aa  151  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0256122  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1695  ATP dependent DNA ligase  34.27 
 
 		 843 aa  150  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.616199  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4352  ATP-dependent DNA ligase  33.21 
 
 		 758 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4438  ATP-dependent DNA ligase  33.21 
 
 		 758 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0862477 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1858  DNA ligase D  32.58 
 
 		 940 aa  149  5e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.170046  normal  0.216644 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4039  DNA polymerase LigD polymerase subunit  38.72 
 
 		 319 aa  149  7e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.437287  normal  0.0570226 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1020  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  35.69 
 
 		 313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00719502  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1150  ATP dependent DNA ligase  35.77 
 
 		 845 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0011  ATP-dependent DNA ligase  32.24 
 
 		 864 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0339968 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4732  ATP-dependent DNA ligase  33.21 
 
 		 758 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.333349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0832  DNA ligase D  34.59 
 
 		 656 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2135  DNA ligase D  31.68 
 
 		 815 aa  146  5e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1828  ATP-dependent DNA ligase  31.47 
 
 		 766 aa  146  6e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36910  ATP-dependent DNA ligase  32.71 
 
 		 840 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0564843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4424  ATP-dependent DNA ligase  31.44 
 
 		 825 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0379748  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0962  hypothetical protein  34.15 
 
 		 313 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.612546  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3663  DNA primase, small subunit  37.36 
 
 		 339 aa  144  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.735103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2519  ATP-dependent DNA ligase  33.73 
 
 		 939 aa  143  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>