More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0613 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0613  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 222 aa  435  1e-121  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0797434 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1745  TPR repeat-containing protein  37.96 
 
 		 402 aa  71.6  0.000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 927 aa  69.7  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.67 
 
 		 689 aa  65.9  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0017  tetratricopeptide TPR_3  32.61 
 
 		 407 aa  65.9  0.0000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.38 
 
 		 810 aa  65.1  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  32.81 
 
 		 265 aa  64.3  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2231  TPR repeat-containing protein  35.54 
 
 		 265 aa  64.3  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000660918  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  42.17 
 
 		 878 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  37.78 
 
 		 622 aa  63.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  32.61 
 
 		 374 aa  63.2  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  29.06 
 
 		 366 aa  62.4  0.000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.2 
 
 		 265 aa  61.6  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  39.39 
 
 		 523 aa  61.6  0.000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  28.67 
 
 		 1979 aa  61.2  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  27.91 
 
 		 267 aa  61.2  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  35.4 
 
 		 560 aa  60.5  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0588  TPR repeat-containing protein  31.94 
 
 		 613 aa  60.5  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  32.81 
 
 		 4079 aa  60.5  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  42.71 
 
 		 754 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  35.79 
 
 		 764 aa  60.1  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  32.65 
 
 		 3560 aa  59.7  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  42.71 
 
 		 754 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  41.46 
 
 		 626 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0774  tetratricopeptide TPR_2  29.53 
 
 		 519 aa  59.3  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.169881  normal  0.452711 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  27.2 
 
 		 265 aa  59.7  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  40.74 
 
 		 543 aa  59.3  0.00000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.33 
 
 		 1056 aa  59.3  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  35.14 
 
 		 1694 aa  58.9  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  39.36 
 
 		 614 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  39.36 
 
 		 614 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  39.36 
 
 		 614 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  27.91 
 
 		 1486 aa  58.5  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  39.36 
 
 		 626 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  39.36 
 
 		 626 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  27.09 
 
 		 280 aa  58.5  0.00000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  39.36 
 
 		 614 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  42.47 
 
 		 632 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1344  TPR repeat-containing protein  27.93 
 
 		 471 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641665  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  39.36 
 
 		 614 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  44.3 
 
 		 789 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.88 
 
 		 1056 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  37.35 
 
 		 3145 aa  57.8  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  32 
 
 		 732 aa  57  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  36.59 
 
 		 620 aa  57  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2447  TPR repeat-containing protein  50 
 
 		 318 aa  56.2  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  36.14 
 
 		 887 aa  56.2  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  29.01 
 
 		 883 aa  55.8  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2755  TPR repeat-containing protein  38.46 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  40.62 
 
 		 718 aa  55.8  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  35.37 
 
 		 620 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0812  tetratricopeptide TPR_2  32.14 
 
 		 452 aa  55.5  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.159009  normal  0.340374 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2318  TPR repeat-containing protein  30.36 
 
 		 245 aa  55.5  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2899  TPR repeat-containing protein  39.76 
 
 		 269 aa  55.5  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3865  TPR repeat protein  40.51 
 
 		 503 aa  55.8  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.12 
 
 		 988 aa  55.5  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  31.86 
 
 		 266 aa  55.1  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  28.38 
 
 		 462 aa  55.1  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  34.82 
 
 		 623 aa  55.1  0.0000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5110  TPR repeat-containing protein  34.65 
 
 		 288 aa  54.3  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  36.14 
 
 		 750 aa  54.3  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  37.97 
 
 		 909 aa  54.7  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3065  TPR repeat-containing protein  27.93 
 
 		 734 aa  54.3  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0065343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  37.97 
 
 		 816 aa  54.3  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1755  TPR repeat-containing protein  32.74 
 
 		 265 aa  54.7  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000044478  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  36.56 
 
 		 639 aa  54.3  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1350  TPR repeat-containing protein  38.62 
 
 		 766 aa  54.3  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0099  TPR repeat-containing protein  27.68 
 
 		 243 aa  54.7  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  36.59 
 
 		 615 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  31.86 
 
 		 564 aa  54.7  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11240  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.43 
 
 		 247 aa  54.7  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.617467  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  38.64 
 
 		 681 aa  53.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2196  sulfotransferase  33.04 
 
 		 648 aa  53.9  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  29.61 
 
 		 397 aa  53.9  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2261  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 251 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000463811 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.14 
 
 		 1022 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  29.82 
 
 		 573 aa  54.3  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  29.49 
 
 		 562 aa  53.9  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0709  TPR repeat-containing protein  31.5 
 
 		 465 aa  53.1  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2953  TPR repeat-containing protein  38.55 
 
 		 270 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.162734 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  36.71 
 
 		 436 aa  53.1  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  30.15 
 
 		 1192 aa  53.1  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  28.85 
 
 		 1094 aa  53.1  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3165  TPR repeat-containing protein  38.55 
 
 		 270 aa  53.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  29.57 
 
 		 577 aa  52.8  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  34.23 
 
 		 1764 aa  52.8  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  21.88 
 
 		 832 aa  52.8  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  25.38 
 
 		 314 aa  52.8  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  43.48 
 
 		 824 aa  52.8  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2065  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.36 
 
 		 465 aa  52.8  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.145613  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  31.48 
 
 		 875 aa  52.4  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.56 
 
 		 249 aa  52.4  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1062  TPR repeat-containing protein  38.55 
 
 		 503 aa  52.4  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0498001 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.56 
 
 		 249 aa  52.4  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000145051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  28.18 
 
 		 1138 aa  52.4  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  31.34 
 
 		 725 aa  52.4  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.15 
 
 		 237 aa  52.4  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  28.83 
 
 		 1276 aa  52.4  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  31.82 
 
 		 730 aa  52  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1796  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.53 
 
 		 465 aa  52.4  0.000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.769841  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>