More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2672 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2672  TPR domain-containing protein  100 
 
 		 446 aa  918    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.306988  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0267  tetratricopeptide repeat domain protein  25.88 
 
 		 460 aa  129  8.000000000000001e-29  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0328071  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1125  TPR domain-containing protein  24.27 
 
 		 457 aa  124  4e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2761  TPR repeat-containing protein  21.43 
 
 		 468 aa  84  0.000000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.594013  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  27.75 
 
 		 887 aa  77.4  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  25.32 
 
 		 267 aa  76.6  0.0000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 1276 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  26.2 
 
 		 1737 aa  68.6  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.71 
 
 		 586 aa  67.8  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2231  TPR repeat-containing protein  24.68 
 
 		 265 aa  66.2  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000660918  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 		 711 aa  65.9  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  28.51 
 
 		 329 aa  64.7  0.000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  34.69 
 
 		 730 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1578  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.48 
 
 		 602 aa  64.3  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000346283  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  22.1 
 
 		 562 aa  63.5  0.000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2198  TPR repeat-containing protein  28.15 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  25.28 
 
 		 266 aa  62.8  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  25.48 
 
 		 1979 aa  62.8  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  26.23 
 
 		 465 aa  62.8  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  30.41 
 
 		 614 aa  62  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1184  TPR domain-containing protein  29.38 
 
 		 222 aa  61.6  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  30.41 
 
 		 626 aa  62  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  30.41 
 
 		 614 aa  62  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  30.41 
 
 		 626 aa  62  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  30.41 
 
 		 614 aa  62  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2347  hypothetical protein  25.31 
 
 		 583 aa  62  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  0.172568 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  30.41 
 
 		 614 aa  62  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  30.72 
 
 		 1127 aa  62  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.22 
 
 		 265 aa  61.2  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  30.97 
 
 		 639 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  24.59 
 
 		 486 aa  61.2  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.06 
 
 		 1056 aa  60.1  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1518  TPR repeat-containing protein  23.66 
 
 		 375 aa  60.1  0.00000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1711  TPR repeat-containing protein  30.95 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1677  TPR repeat-containing protein  30.95 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4357  tetratricopeptide TPR_2  23.64 
 
 		 593 aa  60.1  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0312227  normal  0.0147446 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  22.83 
 
 		 265 aa  59.3  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  22.32 
 
 		 927 aa  59.3  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  26.57 
 
 		 409 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.71 
 
 		 237 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2431  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.32 
 
 		 190 aa  58.5  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.232516  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2091  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.12 
 
 		 212 aa  58.9  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0995  tetratricopeptide TPR_2  27.6 
 
 		 614 aa  58.5  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129848  normal  0.103443 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  29.03 
 
 		 620 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1786  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 190 aa  58.5  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0173384 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  25.86 
 
 		 864 aa  58.5  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  22.13 
 
 		 265 aa  58.5  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  28.77 
 
 		 626 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0942  hypothetical protein  21.43 
 
 		 619 aa  57.4  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 543 aa  57.8  0.0000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.81 
 
 		 632 aa  57.4  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1085  TPR repeat-containing protein  23.49 
 
 		 592 aa  57.4  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.48 
 
 		 810 aa  57.4  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  27.22 
 
 		 615 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0551  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.54 
 
 		 1001 aa  57  0.0000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.874554  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  29.68 
 
 		 637 aa  57  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.32 
 
 		 784 aa  56.6  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5618  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  28.68 
 
 		 739 aa  56.6  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.645263 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  26.17 
 
 		 1297 aa  56.6  0.0000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  29.84 
 
 		 311 aa  56.2  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 568 aa  56.2  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0485  tetratricopeptide TPR_2  24.49 
 
 		 566 aa  56.2  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5110  TPR repeat-containing protein  24.29 
 
 		 288 aa  56.2  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1212  tetratricopeptide TPR_2  22.89 
 
 		 592 aa  56.6  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0115  glycosyl transferase family protein  25.96 
 
 		 892 aa  55.8  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.411081  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  27.04 
 
 		 761 aa  56.2  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0522  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.12 
 
 		 610 aa  56.2  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.133163  normal  0.433558 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0795  putative PAS/PAC sensor protein  38.81 
 
 		 458 aa  55.1  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0670898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0631  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 200 aa  55.8  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  23.91 
 
 		 1252 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  25.97 
 
 		 564 aa  55.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  32.98 
 
 		 739 aa  55.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  27.46 
 
 		 605 aa  55.1  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  23.48 
 
 		 1252 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  28.8 
 
 		 602 aa  54.7  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  25.87 
 
 		 733 aa  54.7  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2562  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.47 
 
 		 364 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4603  TPR repeat-containing protein  28.66 
 
 		 722 aa  54.7  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.32 
 
 		 818 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2023  TPR domain-containing protein  23.22 
 
 		 369 aa  54.3  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000313787  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  28.91 
 
 		 397 aa  54.3  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3102  TPR repeat-containing protein  24.73 
 
 		 313 aa  54.3  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000142669  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0856  sugar transporter superfamily protein  28.05 
 
 		 198 aa  54.3  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2087  TPR repeat-containing protein  25.78 
 
 		 201 aa  54.7  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000840047  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.99 
 
 		 758 aa  54.3  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  26.7 
 
 		 1694 aa  54.3  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1720  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 187 aa  53.9  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  25.83 
 
 		 4079 aa  54.3  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  27.1 
 
 		 620 aa  54.3  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  24.02 
 
 		 808 aa  53.9  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  27.98 
 
 		 661 aa  53.9  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0520  TPR repeat-containing protein  24.84 
 
 		 621 aa  53.5  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1957  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.52 
 
 		 375 aa  53.9  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0823  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.1 
 
 		 296 aa  53.5  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0401477 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0582  TPR repeat-containing protein  23.12 
 
 		 263 aa  53.5  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0446  TPR repeat-containing protein  26.61 
 
 		 377 aa  53.5  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.021695 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1318  TPR repeat-containing protein  26.63 
 
 		 534 aa  53.5  0.000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000693072  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1154  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 511 aa  53.5  0.000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  24.05 
 
 		 366 aa  53.1  0.000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  23.55 
 
 		 3301 aa  53.1  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>