More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0246 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0246  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 189 aa  389  1e-107  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.330264  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3241  TetR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 221 aa  73.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2316  transcriptional regulator, TetR family  27.01 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.166278  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3212  TetR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 223 aa  58.2  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.59703  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1745  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0399082  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1953  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.957288  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23110  transcriptional regulator  26.74 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0687  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 261 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.794796  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1606  TetR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 225 aa  53.9  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.912424  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3574  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 187 aa  53.9  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1777  regulatory protein, TetR  30.48 
 
 		 202 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.26768  normal  0.308935 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1656  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 196 aa  53.1  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0515046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4111  regulatory protein, TetR  32.56 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.856223  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0670  transcriptional regulator, TetR family  31.96 
 
 		 227 aa  53.1  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.591564 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 206 aa  52.8  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3698  transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0820  TetR family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 219 aa  52.4  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0110693  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1963  transcriptional regulator, TetR family  28.85 
 
 		 201 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000168283 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1788  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 195 aa  52.4  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000202922  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1927  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 195 aa  52.4  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00399738  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1799  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 206 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.539023  normal  0.822653 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3641  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 206 aa  52  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0507549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 189 aa  52  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1833  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 206 aa  52  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.226385 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 234 aa  51.6  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2610  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 234 aa  51.6  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0057  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  40 
 
 		 211 aa  51.2  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2443  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  40 
 
 		 211 aa  51.2  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0314  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 211 aa  51.2  0.000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0679  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 211 aa  51.6  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1471  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 219 aa  51.2  0.000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0609  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  40 
 
 		 211 aa  51.2  0.000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3620  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 203 aa  51.2  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0857  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  40 
 
 		 211 aa  51.2  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1017  repressor protein  40 
 
 		 211 aa  51.2  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 212 aa  51.2  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0852  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  40 
 
 		 211 aa  51.2  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4295  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2530  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 213 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.704068 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2644  putative transcriptional regulator, TetR family  37.74 
 
 		 205 aa  50.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3297  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 98 aa  50.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.368335  normal  0.535572 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5941  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  26.03 
 
 		 200 aa  50.8  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11567  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 225 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3860  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 203 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.526451  normal  0.667209 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 206 aa  50.4  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2657  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 213 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2639  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 213 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1574  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00597987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2613  transcriptional regulator, TetR family  34.94 
 
 		 212 aa  49.7  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.443179 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1600  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0652187  normal  0.362821 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2481  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1393  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 234 aa  50.1  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.733503 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3361  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 238 aa  49.7  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.752589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2561  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 203 aa  49.7  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2551  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 206 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48532  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2576  TetR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 233 aa  49.7  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2643  TetR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 233 aa  49.7  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0928  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 461 aa  50.4  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000384359  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 324 aa  49.7  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 125 aa  49.3  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1665  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 221 aa  49.7  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.271808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6485  regulatory protein, TetR  34.94 
 
 		 278 aa  49.3  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0537  putative transcriptional regulator  40 
 
 		 206 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.664064  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2767  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 214 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0855812  normal  0.684751 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05660  putative transcriptional regulator  40 
 
 		 206 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  35.06 
 
 		 200 aa  49.3  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 241 aa  48.5  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2482  transcriptional regulator, TetR family  24.54 
 
 		 196 aa  48.5  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2653  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 186 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 184 aa  48.5  0.00006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2834  transcriptional regulator, TetR family  30.14 
 
 		 233 aa  48.5  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.170846  normal  0.770206 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0282  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 201 aa  48.5  0.00006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.356366  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 234 aa  48.5  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1052  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 215 aa  48.5  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1837  transcriptional regulator EefR  29.58 
 
 		 188 aa  48.5  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000033131 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2624  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 186 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.184874  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1926  transcriptional regulator EefR  29.58 
 
 		 188 aa  48.5  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0902915  hitchhiker  0.0000000455593 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2668  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 186 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.323955  normal  0.884032 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  25.34 
 
 		 224 aa  48.5  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1521  TetR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 233 aa  48.1  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0319  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 206 aa  48.1  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1512  TetR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 233 aa  48.1  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0155  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 222 aa  48.1  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1548  TetR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 233 aa  48.1  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2751  TetR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 232 aa  48.1  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25680  transcriptional regulator  28.23 
 
 		 203 aa  48.1  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12528  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 215 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0275989 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 		 243 aa  47.8  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2441  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 217 aa  47.8  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.429129  normal  0.59735 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0982  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 194 aa  47.8  0.00009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2601  regulatory protein, TetR  25.34 
 
 		 224 aa  47.8  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3008  transcriptional regulator, TetR family  24.6 
 
 		 215 aa  47.8  0.00009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8662  transcriptional regulator, TetR family  40.58 
 
 		 207 aa  47.8  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1965  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 210 aa  47.4  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.885807  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 193 aa  47.8  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1633  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 210 aa  47.4  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.124131  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>