212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13083 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_13083  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 		 202 aa  396  1e-109  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2006  regulatory protein TetR  37.72 
 
 		 196 aa  91.7  8e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31710  hypothetical protein  38.41 
 
 		 189 aa  88.6  6e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.547253  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0140  transcriptional regulator, TetR family  41.29 
 
 		 192 aa  87.4  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1337  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 182 aa  80.5  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7862  transcriptional regulator, TetR family  34.95 
 
 		 240 aa  80.9  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1672  transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 184 aa  79.3  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38620  hypothetical protein  36.93 
 
 		 186 aa  78.2  0.00000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4264  transcriptional regulator, TetR family  46.22 
 
 		 189 aa  77  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0999  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 178 aa  75.1  0.0000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2796  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 178 aa  75.1  0.0000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.117516  normal  0.243308 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0908  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 178 aa  75.1  0.0000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0778822  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0918  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 178 aa  75.1  0.0000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2499  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 178 aa  75.1  0.0000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00813  predicted DNA-binding transcriptional regulator  27.78 
 
 		 178 aa  74.7  0.0000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.270779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2796  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 178 aa  74.7  0.0000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.398531  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00830  hypothetical protein  27.78 
 
 		 178 aa  74.7  0.0000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.295036  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5101  transcriptional regulator, TetR family  34.57 
 
 		 188 aa  74.7  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.375326  normal  0.313411 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0873  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 178 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0973  TetR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 206 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0941  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 206 aa  73.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1021  transcriptional regulator, TetR family  26.46 
 
 		 206 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.163661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1002  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 186 aa  73.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.51169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0905  transcriptional regulator, TetR family  27.03 
 
 		 206 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1451  transcriptional regulator, TetR family  33.11 
 
 		 428 aa  72.8  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 185 aa  72  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19020  transcriptional regulator, TetR family  32.57 
 
 		 197 aa  71.2  0.000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1768  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 181 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0908345  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1502  transcriptional regulator, TetR family  49.28 
 
 		 241 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1312  regulatory protein, TetR  49.28 
 
 		 241 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406176 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1840  transcriptional regulator, TetR family  30.82 
 
 		 415 aa  67  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4304  transcriptional regulator, TetR family  33.54 
 
 		 187 aa  66.6  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.498529  normal  0.0930958 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39380  TetR family regulatory protein  38.76 
 
 		 237 aa  65.5  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127312  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16550  TetR family transcriptional regulator  45.12 
 
 		 237 aa  65.1  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22570  hypothetical protein  30 
 
 		 193 aa  63.9  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.487793  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1439  putative transcriptional regulator  46.34 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1681  TetR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 225 aa  63.9  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.296499  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3369  TetR family transcriptional regulator  45.68 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.15346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18410  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 181 aa  61.6  0.000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.238417 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6891  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3582  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 187 aa  61.2  0.000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4038  TetR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 166 aa  60.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.796052  normal  0.0190621 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1497  TetR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.11015  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0096  transcriptional regulator, TetR family  40.16 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4569  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.591722  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4657  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.287751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4952  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.150878 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2383  TetR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360847 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4120  TetR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4225  TetR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1720  TetR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000768968 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1102  TetR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2858  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.211856  hitchhiker  0.00171809 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07900  hypothetical protein  38.84 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.591065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1061  TetR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.464557  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1763  TetR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5148  TetR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1138  TetR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 248 aa  58.9  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1610  TetR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2126  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1944  TetR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 429 aa  57  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3979  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 203 aa  53.9  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9052  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 193 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1507  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1824  TetR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 203 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882089  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1871  TetR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 203 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1805  TetR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 203 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.386636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0382  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 242 aa  52.8  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.894324  normal  0.190078 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2560  transcriptional regulator, TetR family  33.01 
 
 		 225 aa  52  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391327  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3202  transcriptional regulator, TetR family  34.75 
 
 		 193 aa  52  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2894  transcriptional regulator, TetR family  36.54 
 
 		 218 aa  51.2  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07310  hypothetical protein  47.69 
 
 		 247 aa  50.8  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.608576  normal  0.0646934 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2617  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 207 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.923721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3212  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 213 aa  50.1  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0532  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 207 aa  50.1  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0875801  normal  0.0277044 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2285  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 213 aa  49.3  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3484  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 207 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.186874 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0916  transcriptional regulator BetI  30.81 
 
 		 202 aa  48.9  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0327012  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1074  transcriptional regulator BetI  29.65 
 
 		 195 aa  48.9  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000226822  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4477  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 208 aa  48.9  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.47529  normal  0.773196 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38050  hypothetical protein  31.37 
 
 		 214 aa  48.5  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0375  transcriptional regulator BetI  30.81 
 
 		 202 aa  48.5  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00292447  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0466  transcriptional regulator BetI  30.81 
 
 		 202 aa  48.5  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0181  transcriptional regulator BetI  30.81 
 
 		 195 aa  48.5  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1923  transcriptional regulator BetI  30.81 
 
 		 195 aa  48.5  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00275068  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1835  transcriptional regulator BetI  30.81 
 
 		 195 aa  48.5  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1426  transcriptional regulator BetI  30.81 
 
 		 195 aa  48.5  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.80296  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5928  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 215 aa  48.1  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5798  transcriptional regulator, TetR family  33.04 
 
 		 188 aa  48.1  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.03173  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0106  transcriptional regulator, TetR family  32.94 
 
 		 242 aa  47.4  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.180704  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3555  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 221 aa  47.8  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2060  TetR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 191 aa  47.8  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  30.89 
 
 		 220 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3308  transcriptional regulator BetI  29.14 
 
 		 196 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3421  transcriptional regulator, TetR family  26.55 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  31.62 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0389  hypothetical protein  27.84 
 
 		 214 aa  47  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1283  regulatory protein TetR  32.81 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  31.62 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1866  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 212 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26917  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>