More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1487 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1487  30S ribosomal protein S4  100 
 
 		 202 aa  410  1e-113  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0787  30S ribosomal protein S4  83.66 
 
 		 202 aa  355  1.9999999999999998e-97  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0281678 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04081  30S ribosomal protein S4  80.69 
 
 		 202 aa  351  5e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21161  30S ribosomal protein S4  80.2 
 
 		 202 aa  345  4e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04611  30S ribosomal protein S4  79.21 
 
 		 202 aa  341  2.9999999999999997e-93  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1744  30S ribosomal protein S4  79.21 
 
 		 202 aa  341  4e-93  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1590  30S ribosomal protein S4  79.21 
 
 		 202 aa  341  5e-93  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4303  30S ribosomal protein S4  81.09 
 
 		 202 aa  336  9.999999999999999e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000344205  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3730  30S ribosomal protein S4  80.1 
 
 		 202 aa  336  9.999999999999999e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.53592  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0324  30S ribosomal protein S4  79.6 
 
 		 202 aa  336  1.9999999999999998e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000000226614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4356  30S ribosomal protein S4  78.61 
 
 		 202 aa  330  7.000000000000001e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4418  30S ribosomal protein S4  78.61 
 
 		 202 aa  330  7.000000000000001e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000122066  normal  0.206155 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2554  30S ribosomal protein S4  78.61 
 
 		 202 aa  329  1e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0405  30S ribosomal protein S4  77.72 
 
 		 202 aa  318  3e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04601  30S ribosomal protein S4  77.23 
 
 		 202 aa  316  1e-85  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04291  30S ribosomal protein S4  77.23 
 
 		 202 aa  316  1e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1004  30S ribosomal protein S4  77.94 
 
 		 204 aa  315  3e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000000950762  normal  0.0219645 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04711  30S ribosomal protein S4  76.24 
 
 		 202 aa  313  9e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.22255  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1394  SSU ribosomal protein S4P  53.17 
 
 		 262 aa  186  3e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00631065  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0894  30S ribosomal protein S4  50.48 
 
 		 206 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000013906  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4485  30S ribosomal protein S4  49.01 
 
 		 200 aa  182  3e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.644744  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0437  ribosomal protein S4  50.74 
 
 		 203 aa  181  8.000000000000001e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000069036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0500  30S ribosomal protein S4  46.8 
 
 		 201 aa  179  2e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000917743  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4764  30S ribosomal protein S4  48.51 
 
 		 200 aa  180  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0013865  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4790  30S ribosomal protein S4  48.02 
 
 		 200 aa  179  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000781758  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0874  30S ribosomal protein S4  48.06 
 
 		 205 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000157973  normal  0.0803992 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1018  30S ribosomal protein S4  48.06 
 
 		 205 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000010559  normal  0.0144942 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3327  30S ribosomal protein S4  47.52 
 
 		 200 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000248743  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4793  30S ribosomal protein S4  48.02 
 
 		 200 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00592592  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4554  30S ribosomal protein S4  48.02 
 
 		 200 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000221474  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4389  30S ribosomal protein S4  48.02 
 
 		 200 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000645812  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4399  30S ribosomal protein S4  48.02 
 
 		 200 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000278276  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4773  30S ribosomal protein S4  48.02 
 
 		 200 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4908  30S ribosomal protein S4  48.02 
 
 		 200 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0786166  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0202  ribosomal protein S4  50 
 
 		 203 aa  178  4.999999999999999e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2724  30S ribosomal protein S4  48.51 
 
 		 200 aa  177  8e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000198678  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0471  30S ribosomal protein S4  48.02 
 
 		 200 aa  177  9e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000100944  hitchhiker  4.8786299999999993e-20 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1825  30S ribosomal protein S4  46.8 
 
 		 203 aa  176  2e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1842  SSU ribosomal protein S4P  48.02 
 
 		 203 aa  175  5e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1172  30S ribosomal protein S4  44.83 
 
 		 201 aa  174  7e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1912  30S ribosomal protein S4  44.55 
 
 		 201 aa  173  9.999999999999999e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0715  30S ribosomal protein S4  47.06 
 
 		 200 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0315  30S ribosomal protein S4  47.29 
 
 		 203 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000187386  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2038  30S ribosomal protein S4  45.81 
 
 		 203 aa  169  2e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000016478  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1973  30S ribosomal protein S4  47.78 
 
 		 203 aa  169  3e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000312348  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2137  30S ribosomal protein S4  46.8 
 
 		 203 aa  169  4e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000101892  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4369  ribosomal protein S4  44.55 
 
 		 201 aa  167  7e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.663068  normal  0.672175 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05845  30S ribosomal protein S4  43.84 
 
 		 201 aa  167  9e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.16626  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0264  30S ribosomal protein S4  46.8 
 
 		 204 aa  166  2e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2432  30S ribosomal protein S4  47.12 
 
 		 208 aa  166  2e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3137  30S ribosomal protein S4  44.06 
 
 		 201 aa  166  2e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0424686  normal  0.56438 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0868  ribosomal protein S4  46.04 
 
 		 200 aa  166  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.392716  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0300  30S ribosomal protein S4  46.57 
 
 		 203 aa  166  2e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00214384  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2270  30S ribosomal protein S4  44.33 
 
 		 203 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0573155  hitchhiker  0.0031746 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0705  30S ribosomal protein S4  48.1 
 
 		 208 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000946412  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0171  RNA-binding S4 domain-containing protein  42.79 
 
 		 200 aa  165  4e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.295675 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0326  30S ribosomal protein S4  44.71 
 
 		 208 aa  165  4e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2880  ribosomal protein S4  46.34 
 
 		 205 aa  165  4e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0313  30S ribosomal protein S4  44.23 
 
 		 208 aa  165  5e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.977941  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2203  30S ribosomal protein S4  45.32 
 
 		 203 aa  165  5e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000224183  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3403  30S ribosomal protein S4  48.29 
 
 		 204 aa  165  5e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0173311  normal  0.29529 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2397  30S ribosomal protein S4  45.81 
 
 		 203 aa  165  5e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0284002  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2592  30S ribosomal protein S4  45.15 
 
 		 205 aa  164  9e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.907343 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0206  30S ribosomal protein S4  45.81 
 
 		 203 aa  163  1.0000000000000001e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000707941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1641  ribosomal protein S4  41.95 
 
 		 201 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.257359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2931  SSU ribosomal protein S4P  46.15 
 
 		 208 aa  162  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0070755  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3876  30S ribosomal protein S4  46.53 
 
 		 202 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0628  ribosomal protein S4  44.83 
 
 		 202 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4520  30S ribosomal protein S4  43.75 
 
 		 206 aa  162  3e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000540597  decreased coverage  0.000000609653 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4000  ribosomal protein S4  49.28 
 
 		 206 aa  162  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00226649  hitchhiker  0.000661916 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3530  30S ribosomal protein S4  48.76 
 
 		 203 aa  161  5.0000000000000005e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000000417771  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04260  30S ribosomal protein S4  47.03 
 
 		 202 aa  162  5.0000000000000005e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.342435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1159  ribosomal protein S4  47.12 
 
 		 206 aa  161  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000286157  normal  0.0899698 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3980  ribosomal protein S4  44.98 
 
 		 209 aa  160  9e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0454614  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1284  30S ribosomal protein S4  44.55 
 
 		 200 aa  160  1e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000240031  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3302  30S ribosomal protein S4  44.71 
 
 		 208 aa  160  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00160725 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1920  30S ribosomal protein S4  46.15 
 
 		 208 aa  160  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2044  30S ribosomal protein S4  46.15 
 
 		 208 aa  160  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0881453  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1959  30S ribosomal protein S4  46.15 
 
 		 208 aa  160  1e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3891  30S ribosomal protein S4  43.75 
 
 		 206 aa  160  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000651911  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1013  30S ribosomal protein S4  45.15 
 
 		 203 aa  159  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0175272  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0605  30S ribosomal protein S4  43.75 
 
 		 206 aa  160  2e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000812639  normal  0.600341 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0786  ribosomal protein S4  46.15 
 
 		 208 aa  160  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0220407  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0307  30S ribosomal protein S4  43.75 
 
 		 206 aa  160  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000246284  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2129  SSU ribosomal protein S4P  43.07 
 
 		 200 aa  159  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0414725  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2040  ribosomal protein S4  46.15 
 
 		 208 aa  159  2e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00652573  hitchhiker  0.00144976 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0347  30S ribosomal protein S4  44.23 
 
 		 206 aa  159  3e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0772249  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0372  30S ribosomal protein S4  40.89 
 
 		 201 aa  159  3e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0959  30S ribosomal protein S4  44.23 
 
 		 208 aa  159  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.317804  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0346  ribosomal protein S4  44.02 
 
 		 207 aa  159  3e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000340936  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00962  30S ribosomal protein S4  42.31 
 
 		 206 aa  158  4e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00755213  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4939  ribosomal protein S4  47.39 
 
 		 211 aa  158  5e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00864494  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0429  30S ribosomal protein S4  44.23 
 
 		 206 aa  158  5e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2750  ribosomal protein S4  43.75 
 
 		 208 aa  158  6e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.462639  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1810  30S ribosomal protein S4  43.56 
 
 		 200 aa  158  6e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000029578  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1775  30S ribosomal protein S4  43.56 
 
 		 200 aa  158  6e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000000344809  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0625  30S ribosomal protein S4  41.63 
 
 		 207 aa  157  7e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0206  30S ribosomal protein S4  44.71 
 
 		 208 aa  158  7e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3798  30S ribosomal protein S4  43.27 
 
 		 206 aa  158  7e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.108792  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3383  ribosomal protein S4  46.27 
 
 		 201 aa  157  7e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>