137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_33680 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_33680  Protein of unknown function (DUF861)  100 
 
 		 147 aa  295  1e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.741976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2392  cupin 2 domain-containing protein  68.03 
 
 		 140 aa  169  9e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.232938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4149  hypothetical protein  62.31 
 
 		 150 aa  164  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26535  decreased coverage  0.0023385 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2852  cupin 2  57.64 
 
 		 156 aa  155  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1085  Cupin 2 conserved barrel domain protein  58.62 
 
 		 168 aa  146  8e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2501  cupin 2 domain-containing protein  64.81 
 
 		 135 aa  142  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.342935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0147  Cupin 2 conserved barrel domain protein  58.47 
 
 		 141 aa  141  4e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2685  cupin 2 domain-containing protein  62.04 
 
 		 134 aa  135  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477579  hitchhiker  0.0004758 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3333  Cupin 2 conserved barrel domain protein  55.65 
 
 		 294 aa  130  3.9999999999999996e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0663795  normal  0.136427 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3638  cupin 2 domain-containing protein  37.23 
 
 		 152 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.588869  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1207  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.68 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.830198  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6281  hypothetical protein  42.03 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1043  cupin 2 domain-containing protein  32.67 
 
 		 181 aa  55.5  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3997  cupin 2 domain-containing protein  36.49 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.439431  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1491  cupin:protein of unknown function DUF861  48.33 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1816  cupin 2 domain-containing protein  30.28 
 
 		 123 aa  54.7  0.0000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.337557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5028  cupin 2 domain-containing protein  39.19 
 
 		 210 aa  54.7  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4136  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.73 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5786  cupin 2 conserved barrel domain protein  36.56 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242076  normal  0.0379764 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4399  polyketide synthesis domain protein  39.73 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4402  polyketide synthesis domain-containing protein  39.73 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.155389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4287  polyketide synthesis domain protein  39.73 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.640485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4317  polyketide synthesis domain protein  39.73 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4469  polyketide synthesis domain-containing protein  39.73 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2329  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.33 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0016638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3716  cupin 2, barrel  32.1 
 
 		 129 aa  53.5  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000701811  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4578  cupin 2 domain-containing protein  32.97 
 
 		 133 aa  52.8  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.753369 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2978  polyketide synthesis domain protein  34.18 
 
 		 120 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000628046 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3018  cupin domain-containing protein  34.18 
 
 		 120 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.117139  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2770  cupin domain-containing protein  34.18 
 
 		 120 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2719  hypothetical protein  34.18 
 
 		 120 aa  52.4  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2699  hypothetical protein  34.18 
 
 		 120 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.615203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2981  cupin domain-containing protein  34.18 
 
 		 120 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0320  cupin 2 domain-containing protein  34.33 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.864661  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2775  cupin 2 domain-containing protein  34.18 
 
 		 120 aa  52.4  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.108544  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2260  polyketide synthesis domain protein  34.18 
 
 		 120 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0666056 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2982  polyketide synthesis domain protein  34.18 
 
 		 120 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2444  hypothetical protein  45.9 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.406383  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2327  cupin 2 domain-containing protein  30.3 
 
 		 150 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000139899 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0773  cupin 2 protein  34.04 
 
 		 116 aa  50.8  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.707426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2685  hypothetical protein  36.36 
 
 		 152 aa  50.8  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.273941  normal  0.254874 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2654  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45 
 
 		 128 aa  50.4  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.810725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3020  polyketide synthesis domain protein  32.91 
 
 		 120 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.61 
 
 		 132 aa  50.4  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4993  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.48 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4126  cupin 2 domain-containing protein  38.98 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3140  conserved hypothetical phosphomannose protein  25.2 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1525  oxalate decarboxylase  31.87 
 
 		 408 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0264195 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.75 
 
 		 146 aa  47.8  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0884  cupin 2, barrel  34.29 
 
 		 191 aa  47.4  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0450  XRE family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 180 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3906  cupin 2 domain-containing protein  42.37 
 
 		 133 aa  47.4  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000227782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.3 
 
 		 126 aa  47  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.539282  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3304  signal peptide protein  34.18 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0282721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3023  cupin 2, barrel  44.9 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1009  cupin family protein  30.56 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1607  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.1 
 
 		 158 aa  45.8  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.978873  normal  0.178437 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0134  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.47 
 
 		 118 aa  45.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0402  bicupin, oxalate decarboxylase family  30.77 
 
 		 404 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.861289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1923  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.72 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0356258  normal  0.456316 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1456  xenobiotic response element family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 188 aa  45.1  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.01823e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5854  cupin 2 domain-containing protein  33.9 
 
 		 137 aa  45.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.154077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0028  double-stranded beta-helix-like protein  33.8 
 
 		 112 aa  44.7  0.0004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3175  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.23 
 
 		 161 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.20235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3499  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.23 
 
 		 161 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.163476 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2440  hypothetical protein  41.94 
 
 		 129 aa  44.7  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542121  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4841  cupin 2 domain-containing protein  30.11 
 
 		 202 aa  44.3  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0371  bicupin, oxalate decarboxylase family  29.67 
 
 		 404 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.571775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1579  TonB box-like  35.29 
 
 		 151 aa  44.3  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1329  mannose-6-phosphate isomerase  29.51 
 
 		 112 aa  43.9  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0501  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3543  cupin 2 domain-containing protein  30.43 
 
 		 121 aa  43.9  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.76307  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1032  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.23 
 
 		 121 aa  43.9  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0452  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.29 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0722  bicupin, oxalate decarboxylase family  29.89 
 
 		 234 aa  42.7  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2250  DNA-binding protein  34.43 
 
 		 186 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2209  MerR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000991087  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2170  MerR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 186 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.22299  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2414  DNA-binding protein  34.43 
 
 		 186 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0274  transcriptional regulator, XRE family  33.7 
 
 		 205 aa  42.4  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.64998  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0440  cupin 2, barrel  28.57 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.351298  normal  0.537185 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1644  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.4 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.522674  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0847  cupin 2 domain-containing protein  41.38 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2432  DNA-binding protein  34.43 
 
 		 186 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.164998 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2411  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.289698 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2951  DNA-binding protein  34.43 
 
 		 186 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000726653  hitchhiker  0.00000000446905 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2572  cupin 2 domain-containing protein  36.23 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.149975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0540  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.43 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0323  hypothetical protein  27.27 
 
 		 109 aa  42  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.814901 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5098  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.33 
 
 		 124 aa  42  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2388  oxalate decarboxylase  25.77 
 
 		 389 aa  42  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510235 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4006  cupin 2 domain-containing protein  37.04 
 
 		 137 aa  42  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.244405  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5284  hypothetical protein  33.87 
 
 		 164 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0735  cupin 2 domain-containing protein  43.64 
 
 		 178 aa  42  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1649  XRE family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 181 aa  41.6  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.176921  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3746  cupin 2 domain-containing protein  29.07 
 
 		 124 aa  42  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2380  DNA-binding protein  32.79 
 
 		 186 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.801132  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5302  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.25 
 
 		 153 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1259  cupin family protein  25.74 
 
 		 418 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0758699  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1413  oxalate decarboxylase  25.74 
 
 		 418 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00642683  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1331  oxalate decarboxylase  25.74 
 
 		 418 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.223306  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>