128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_11710 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_11710  hypothetical protein  100 
 
 		 298 aa  599  1e-170  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.898295  normal  0.617645 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32160  tetratricopeptide repeat protein  99.31 
 
 		 702 aa  582  1.0000000000000001e-165  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.277202 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1729  TPR repeat-containing protein  40.69 
 
 		 837 aa  178  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0395  hypothetical protein  41.76 
 
 		 488 aa  162  9e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09426  conserved hypothetical protein  38.32 
 
 		 1262 aa  71.6  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  41.35 
 
 		 924 aa  69.3  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  40.38 
 
 		 284 aa  68.2  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  37.61 
 
 		 1105 aa  66.2  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  35.16 
 
 		 493 aa  65.5  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.46 
 
 		 1424 aa  64.7  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5289  TPR repeat-containing protein  35.35 
 
 		 857 aa  62.8  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.752131  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  30.63 
 
 		 1039 aa  62  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  35.78 
 
 		 949 aa  62.4  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0494  TPR repeat-containing protein  32.63 
 
 		 1088 aa  61.2  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  29.37 
 
 		 1475 aa  61.2  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.909134 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08541  conserved hypothetical protein  32.35 
 
 		 577 aa  60.5  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3272  hypothetical protein  36.97 
 
 		 801 aa  60.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10448  TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01710)  35.35 
 
 		 1488 aa  60.1  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.162575 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  34.34 
 
 		 751 aa  60.1  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  33.65 
 
 		 919 aa  60.5  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5157  hypothetical protein  37.21 
 
 		 178 aa  59.7  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.208303  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01071  conserved hypothetical protein  35.58 
 
 		 1185 aa  59.7  0.00000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0324435  normal  0.67029 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  33.65 
 
 		 1215 aa  59.7  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2257  tetratricopeptide TPR_4  36.17 
 
 		 828 aa  59.3  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  38 
 
 		 1068 aa  59.3  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  31.73 
 
 		 1328 aa  58.9  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.81 
 
 		 568 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0199548 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08322  conserved hypothetical protein  32.69 
 
 		 1050 aa  58.2  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  34.69 
 
 		 1131 aa  57.8  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  37.08 
 
 		 1056 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5267  TPR repeat-containing protein  36.52 
 
 		 640 aa  58.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.433566  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  29.13 
 
 		 1550 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  29.81 
 
 		 568 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3483  NB-ARC domain protein  39.13 
 
 		 793 aa  57.4  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0641  TPR repeat-containing protein  34.74 
 
 		 966 aa  57.4  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249187 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 911 aa  57.4  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3158  TPR repeat-containing protein  33.65 
 
 		 814 aa  57  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.385095  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2528  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.17 
 
 		 991 aa  57  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122653  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2707  kinesin light chain  31.31 
 
 		 311 aa  56.6  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  29.9 
 
 		 1288 aa  56.2  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  30.48 
 
 		 444 aa  56.2  0.0000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.32 
 
 		 787 aa  56.2  0.0000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44116  predicted protein  30.68 
 
 		 757 aa  56.2  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0416  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 481 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.80889 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  32.35 
 
 		 454 aa  56.2  0.0000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  30.61 
 
 		 785 aa  55.5  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01580  conserved hypothetical protein  36.08 
 
 		 1128 aa  54.7  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0427699 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0409  TPR repeat-containing protein  29.7 
 
 		 851 aa  55.1  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.613133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.57 
 
 		 767 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.07 
 
 		 1186 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5147  TPR repeat-containing protein  32.63 
 
 		 469 aa  54.3  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0779428  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  28.32 
 
 		 2145 aa  53.9  0.000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  31.19 
 
 		 825 aa  53.5  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49558  predicted protein  33.33 
 
 		 1106 aa  53.5  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.022156  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05237  conserved hypothetical protein  29.06 
 
 		 551 aa  53.5  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00419082  hitchhiker  0.0029586 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0136  TPR repeat-containing protein  31.52 
 
 		 776 aa  53.5  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.955072  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.7 
 
 		 771 aa  53.5  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4186  tetratricopeptide TPR_4  34.74 
 
 		 963 aa  53.1  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1995  TPR repeat-containing protein  34.41 
 
 		 443 aa  53.1  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.194004  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  28.44 
 
 		 732 aa  52.8  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  29.29 
 
 		 1040 aa  52.8  0.000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0515  putative ATP/GTP-binding protein  29.66 
 
 		 1314 aa  52.4  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.388399 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  21.48 
 
 		 1212 aa  52.8  0.000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  35.58 
 
 		 953 aa  52.4  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4641  hypothetical protein  46.88 
 
 		 457 aa  51.6  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  26.61 
 
 		 843 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1471  TPR repeat-containing protein  31.11 
 
 		 1283 aa  50.4  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.791072  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1583  tetratricopeptide TPR_4  34.94 
 
 		 362 aa  50.4  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1359  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 333 aa  50.4  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4762  putative ATP/GTP binding protein  38.14 
 
 		 675 aa  50.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  30.3 
 
 		 672 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2833  TPR repeat-containing protein  35.58 
 
 		 344 aa  50.1  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.922484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2455  tetratricopeptide TPR_4  36.96 
 
 		 829 aa  50.1  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262289  normal  0.779517 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  28.95 
 
 		 1404 aa  49.7  0.00006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.3 
 
 		 885 aa  49.3  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2501  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  32.67 
 
 		 1036 aa  48.9  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.120058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  28.28 
 
 		 1507 aa  48.9  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6335  hypothetical protein  32.77 
 
 		 144 aa  48.9  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49686  predicted protein  30.61 
 
 		 686 aa  49.3  0.00009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04908  eukaryotic translation initiation factor 3 subunit CLU1/TIF31, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G10800)  32.22 
 
 		 1130 aa  48.5  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.394438 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1902  hypothetical protein  33.93 
 
 		 310 aa  48.5  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0167  TPR repeat-containing protein  27.47 
 
 		 190 aa  48.5  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6844  Tetratricopeptide TPR_4  35.23 
 
 		 1468 aa  48.5  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0351351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7957  Tetratricopeptide TPR_4  31.87 
 
 		 1324 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5728  tetratricopeptide TPR_4  36.63 
 
 		 849 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1716  TPR repeat-containing protein  22.88 
 
 		 162 aa  47.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2650  tetratricopeptide TPR_4  32.43 
 
 		 1311 aa  47.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0589865  normal  0.0118034 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08545  conserved hypothetical protein  35.44 
 
 		 1136 aa  47.4  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03014  translation repressor/antiviral protein Ski3, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08810)  34.18 
 
 		 1410 aa  47.4  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.690097 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1262  Tetratricopeptide TPR_4  35.42 
 
 		 1429 aa  47.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.803703  normal  0.0826044 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  28.28 
 
 		 725 aa  47.4  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2118  TPR repeat-containing protein  34.23 
 
 		 1028 aa  47.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4168  TPR repeat-containing protein  33.65 
 
 		 326 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1600  hypothetical protein  31.87 
 
 		 1383 aa  47  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.726146  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2310  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.85 
 
 		 841 aa  46.6  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544847  normal  0.283617 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0434  putative ATP/GTP binding protein  34.58 
 
 		 713 aa  46.6  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.342423 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3245  tetratricopeptide TPR_2  30.68 
 
 		 212 aa  46.2  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2362  serine/threonine protein kinase  30.77 
 
 		 1435 aa  46.6  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0458945 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2793  tetratricopeptide TPR_4  33.94 
 
 		 1024 aa  46.6  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3866  NB-ARC domain protein  29.03 
 
 		 680 aa  46.6  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.641069 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>