251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0657 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0657  von Willebrand factor, type A  100 
 
 		 595 aa  1177    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.676457  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1623  TPR repeat-containing protein  27.29 
 
 		 644 aa  161  4e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000210321 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2816  TPR repeat-containing protein  27.36 
 
 		 657 aa  159  9e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0649  von Willebrand factor, type A  25.85 
 
 		 471 aa  158  2e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2682  TPR repeat-containing protein  25.38 
 
 		 701 aa  156  1e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1743  TPR domain-containing protein  26.79 
 
 		 658 aa  150  6e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3094  TPR domain-containing protein  26.27 
 
 		 679 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1658  TPR repeat-containing protein  25.13 
 
 		 647 aa  137  5e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.95456  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001268  TPR domain protein in aerotolerance operon  29.06 
 
 		 599 aa  137  6.0000000000000005e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1538  von Willebrand factor type A  32.99 
 
 		 347 aa  135  1.9999999999999998e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.634535  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2395  von Willebrand factor type A  31.8 
 
 		 611 aa  130  7.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850853  normal  0.642372 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05143  hypothetical protein  27.9 
 
 		 601 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2173  TPR domain-containing protein  25.66 
 
 		 701 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.081888 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1949  TPR repeat-containing protein  26.02 
 
 		 612 aa  126  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.931925  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1107  hypothetical protein  29.23 
 
 		 646 aa  125  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0072  TPR repeat-containing protein  23.91 
 
 		 664 aa  124  4e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1122  von Willebrand factor type A  29.31 
 
 		 335 aa  124  5e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.51147  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3163  TPR domain-containing protein  23.73 
 
 		 690 aa  124  7e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.185864  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2465  TPR repeat-containing protein  26.51 
 
 		 663 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3086  TPR domain-containing protein  24.56 
 
 		 579 aa  121  3e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.503806  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3032  TPR repeat-containing protein  25.31 
 
 		 650 aa  120  7e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.198571  normal  0.0885065 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02145  hypothetical protein  27.72 
 
 		 346 aa  120  7.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02344  tetratricopeptide repeat domain protein  23.54 
 
 		 607 aa  119  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1732  TPR repeat-containing protein  26.22 
 
 		 587 aa  117  6.9999999999999995e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.966886  normal  0.26357 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0099  von Willebrand factor, type A  26.02 
 
 		 651 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2066  hypothetical protein  25 
 
 		 585 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1524  TPR repeat-containing protein  27.6 
 
 		 691 aa  114  6e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1717  TPR repeat-containing von Willebrand factor, type A  23.9 
 
 		 572 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1455  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 690 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000112359 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2766  TPR repeat-containing protein  25.29 
 
 		 690 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0523  von Willebrand factor type A  29.56 
 
 		 344 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2431  TPR repeat-containing protein  26.35 
 
 		 693 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0167557 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5483  von Willebrand factor type A  30.43 
 
 		 320 aa  110  9.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2933  TPR repeat-containing protein  24.95 
 
 		 588 aa  108  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2291  von Willebrand factor type A  28.79 
 
 		 340 aa  108  3e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2861  TPR repeat-containing protein  23.99 
 
 		 692 aa  107  8e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0393834 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3802  TPR repeat-containing protein  23.13 
 
 		 522 aa  105  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2786  TPR repeat-containing protein  23.9 
 
 		 693 aa  105  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1592  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.55 
 
 		 692 aa  104  5e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000228279 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1402  TPR repeat-containing protein  25.84 
 
 		 681 aa  104  6e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000103328 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1467  TPR repeat-containing protein  25.84 
 
 		 687 aa  104  6e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.510289  hitchhiker  0.00291188 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0523  hypothetical protein  25.95 
 
 		 619 aa  103  9e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2455  von Willebrand factor type A  31.36 
 
 		 338 aa  102  1e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1482  von Willebrand factor type A  23.08 
 
 		 344 aa  101  5e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.428182  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2604  TPR repeat-containing protein  27.18 
 
 		 653 aa  100  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24390  TPR domain-containing protein  27.3 
 
 		 586 aa  99  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00557521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0719  von Willebrand factor, type A  28.65 
 
 		 334 aa  99  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4900  von Willebrand factor type A  33.02 
 
 		 337 aa  98.6  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0906  von Willebrand factor type A  32.93 
 
 		 345 aa  97.1  9e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519509  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3763  TPR domain protein  24.83 
 
 		 572 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.519367  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0441  von Willebrand factor type A  35.1 
 
 		 339 aa  96.3  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126065  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4531  hypothetical protein  22.86 
 
 		 531 aa  94.7  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.536979  normal  0.0526442 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0243  von Willebrand factor type A  25.91 
 
 		 343 aa  94.4  6e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0131225  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1481  von Willebrand factor type A  31.38 
 
 		 332 aa  94  7e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587986  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2319  von Willebrand factor type A  30.99 
 
 		 331 aa  93.6  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1582  batA protein  31.28 
 
 		 327 aa  92.4  2e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1777  von Willebrand factor type A  27.4 
 
 		 754 aa  92  2e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.264323 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0442  von Willebrand factor type A  26.19 
 
 		 329 aa  92  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.570722  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0720  von Willebrand factor, type A  29.46 
 
 		 344 aa  91.7  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.799777  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2887  tetratricopeptide TPR_4  22.5 
 
 		 544 aa  91.7  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0337019  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001269  protein BatA  28.62 
 
 		 334 aa  89.7  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.687935  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3031  von Willebrand factor type A  27.02 
 
 		 330 aa  89.7  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.239159  normal  0.0768499 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2439  von Willebrand factor type A  29.06 
 
 		 331 aa  89.7  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0524  hypothetical protein  27.36 
 
 		 320 aa  88.2  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2603  von Willebrand factor type A  30.11 
 
 		 336 aa  88.6  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2768  hypothetical protein  29.94 
 
 		 344 aa  88.6  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2932  von Willebrand factor, type A  28.33 
 
 		 334 aa  88.6  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.922939  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0796  von Willebrand factor type A  27.83 
 
 		 328 aa  89  3e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131986  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3093  von Willebrand factor type A domain-containing protein  29.07 
 
 		 338 aa  88.2  4e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05144  hypothetical protein  27.34 
 
 		 334 aa  88.2  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1624  von Willebrand factor, type A  28.9 
 
 		 330 aa  88.2  4e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000050495 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2914  hypothetical protein  29.94 
 
 		 344 aa  87.8  5e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2681  von Willebrand factor, type A  28.2 
 
 		 334 aa  87.8  5e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0852  von Willebrand factor type A  26.3 
 
 		 345 aa  87.4  6e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.591496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1560  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 571 aa  87  8e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535158 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2028  TPR domain-containing protein  26.7 
 
 		 572 aa  87  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1583  batB protein  26.72 
 
 		 339 aa  86.3  0.000000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3714  TPR repeat-containing protein  26.7 
 
 		 572 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.325605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1811  von Willebrand factor type A  27.78 
 
 		 331 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3231  TPR repeat-containing protein  23.41 
 
 		 612 aa  86.3  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2139  hypothetical protein  22.92 
 
 		 530 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.488109  decreased coverage  0.00345429 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0430  hypothetical protein  28.45 
 
 		 336 aa  85.9  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02150  aerotolerance-related membrane protein  28.62 
 
 		 334 aa  85.9  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5137  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.67 
 
 		 517 aa  85.5  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398593  normal  0.644601 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2086  von Willebrand factor type A  34.81 
 
 		 327 aa  85.1  0.000000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1588  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 572 aa  84.7  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107949 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1403  von Willebrand factor, type A  28.09 
 
 		 338 aa  84.3  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.520734  hitchhiker  0.0000232326 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2785  von Willebrand factor type A  28.16 
 
 		 340 aa  84  0.000000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2765  von Willebrand factor type A  28.36 
 
 		 339 aa  84  0.000000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.644793  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1468  von Willebrand factor, type A  28.09 
 
 		 338 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210714 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1456  von Willebrand factor, type A  28.09 
 
 		 338 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000144994 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1593  von Willebrand factor type A  27.8 
 
 		 340 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000650656 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2430  von Willebrand factor, type A  26.04 
 
 		 339 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0141267 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2860  von Willebrand factor type A  27.8 
 
 		 339 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.140424  normal  0.0110983 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2172  von Willebrand factor type A domain-containing protein  25.67 
 
 		 327 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0626942 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2464  von Willebrand factor, type A  28.16 
 
 		 339 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1744  BatB protein, putative  26.95 
 
 		 341 aa  81.6  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24400  von Willebrand factor type A domain-containing protein  27.97 
 
 		 340 aa  82  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0690216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1680  von Willebrand factor type A  30.49 
 
 		 333 aa  81.6  0.00000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.233991  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1106  hypothetical protein  26.98 
 
 		 318 aa  81.3  0.00000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>