More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2842 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2842  ABC transporter related  100 
 
 		 598 aa  1178    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.650439 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1493  ABC transporter related  45.36 
 
 		 606 aa  441  9.999999999999999e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.065388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0326  ABC transporter related  41.64 
 
 		 595 aa  414  1e-114  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1940  ABC transporter related  37.73 
 
 		 604 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00184105  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1602  ATPase  39.79 
 
 		 584 aa  403  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.504525  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4770  ABC transporter related  38.29 
 
 		 593 aa  402  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  39.32 
 
 		 589 aa  399  9.999999999999999e-111  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2455  ABC transporter related  32.99 
 
 		 587 aa  399  9.999999999999999e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2503  ABC transporter related  32.99 
 
 		 587 aa  399  9.999999999999999e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0868993  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0274  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.92 
 
 		 597 aa  395  1e-108  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000298465  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0879  ABC transporter related  36.61 
 
 		 592 aa  394  1e-108  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000788557  decreased coverage  0.000000000312557 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2127  ABC transporter related  35.65 
 
 		 597 aa  382  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000126664  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2309  ABC transporter related  39.82 
 
 		 609 aa  380  1e-104  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0189  ABC transporter, transmembrane region  40.6 
 
 		 593 aa  382  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00720  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.11 
 
 		 1091 aa  380  1e-104  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2656  ABC transporter related  36.77 
 
 		 611 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0207415  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2604  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  43.11 
 
 		 593 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.452791  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25690  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.2 
 
 		 576 aa  366  1e-100  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3268  ABC transporter related protein  33.95 
 
 		 599 aa  365  1e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.856994  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0333  ABC transporter related  36.52 
 
 		 602 aa  361  2e-98  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2315  ABC transporter related  39.5 
 
 		 608 aa  361  2e-98  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.29878  normal  0.596997 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0316  ABC transporter related  36.54 
 
 		 619 aa  360  3e-98  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4629  ABC transporter related  38.26 
 
 		 580 aa  360  6e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000094553  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1773  ABC transporter related  33.22 
 
 		 573 aa  359  7e-98  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2626  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.78 
 
 		 581 aa  359  9e-98  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0381591  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3971  ABC transporter related  36.5 
 
 		 596 aa  358  1.9999999999999998e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3017  ABC transporter related  42.12 
 
 		 600 aa  358  1.9999999999999998e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.881398  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2007  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.56 
 
 		 580 aa  357  3.9999999999999996e-97  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.261515  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0690  ABC transporter related  32.92 
 
 		 573 aa  356  6.999999999999999e-97  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1573  ABC transporter related protein  34.81 
 
 		 590 aa  350  4e-95  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0475894  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1042  ABC transporter related  36.63 
 
 		 599 aa  349  9e-95  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0338  ABC transporter related  37.94 
 
 		 1194 aa  348  1e-94  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03650  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  38.05 
 
 		 596 aa  347  3e-94  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000000696051  decreased coverage  0.00250447 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1808  ABC transporter ATP-binding protein  40.75 
 
 		 618 aa  345  1e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877755  normal  0.0567743 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0880  ABC transporter related  36.27 
 
 		 579 aa  341  2e-92  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000105658  decreased coverage  0.000000000323108 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3042  ABC transporter related  35.93 
 
 		 611 aa  340  4e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.915781 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0689  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.94 
 
 		 590 aa  340  5e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3269  ABC transporter related protein  39.23 
 
 		 588 aa  338  9.999999999999999e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0894885 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0757  ABC transporter related  32.77 
 
 		 590 aa  338  9.999999999999999e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2502  ABC transporter related  32.32 
 
 		 577 aa  338  1.9999999999999998e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.718734  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2454  ABC transporter related  32.32 
 
 		 577 aa  338  1.9999999999999998e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1486  ABC transporter related  38.28 
 
 		 1228 aa  332  1e-89  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0908  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.04 
 
 		 583 aa  330  6e-89  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1600  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.64 
 
 		 583 aa  328  1.0000000000000001e-88  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0896  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.47 
 
 		 595 aa  328  2.0000000000000001e-88  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3267  ABC transporter related protein  35.74 
 
 		 579 aa  327  4.0000000000000003e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000188194  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1440  ABC transporter related  39.06 
 
 		 608 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.279774  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1176  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.18 
 
 		 573 aa  326  9e-88  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3554  ABC transporter related  42.22 
 
 		 596 aa  326  9e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.32539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26110  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.25 
 
 		 618 aa  324  3e-87  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1941  ABC transporter related  34.98 
 
 		 581 aa  320  3.9999999999999996e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0169722  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2100  yersiniabactin ABC transporter ATP-binding/permease  37.7 
 
 		 600 aa  320  5e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2314  ABC transporter related  35.44 
 
 		 587 aa  319  9e-86  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0749379  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1809  ABC transporter ATP-binding protein  40.73 
 
 		 581 aa  319  1e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.915425  normal  0.261629 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4630  ABC transporter related  35.47 
 
 		 588 aa  318  1e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000420714  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1601  ATPase  32.92 
 
 		 583 aa  317  3e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.149683  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  35.16 
 
 		 575 aa  317  4e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2372  ABC transporter related protein  37.52 
 
 		 578 aa  314  2.9999999999999996e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.037527  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0188  ABC transporter, transmembrane region  36.54 
 
 		 576 aa  313  6.999999999999999e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.55543  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2655  ABC transporter related  36.51 
 
 		 581 aa  312  1e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.399774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3553  ABC transporter related  38.35 
 
 		 611 aa  311  2e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23130  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.27 
 
 		 577 aa  311  2e-83  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.880015 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2340  ABC transporter, transmembrane region  41.29 
 
 		 603 aa  311  2.9999999999999997e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.393444  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3268  ABC transporter related protein  40.08 
 
 		 581 aa  310  5e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0537303 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  40.59 
 
 		 580 aa  308  2.0000000000000002e-82  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1035  ABC transporter related protein  42.2 
 
 		 619 aa  306  5.0000000000000004e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00381243  normal  0.0281832 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25700  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.51 
 
 		 581 aa  306  8.000000000000001e-82  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3091  ABC transporter related  37.37 
 
 		 624 aa  305  1.0000000000000001e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0332  ABC transporter related  39.68 
 
 		 577 aa  305  2.0000000000000002e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1437  ABC transporter related  40.37 
 
 		 579 aa  305  2.0000000000000002e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0233072  normal  0.573322 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1041  ABC transporter related  36.27 
 
 		 577 aa  305  2.0000000000000002e-81  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2323  ABC transporter related  36.21 
 
 		 677 aa  304  3.0000000000000004e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35782  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0924  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.95 
 
 		 627 aa  304  4.0000000000000003e-81  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00295449  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1175  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.45 
 
 		 568 aa  303  6.000000000000001e-81  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03660  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.6 
 
 		 577 aa  303  8.000000000000001e-81  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.023661  hitchhiker  0.00816448 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0327  ABC transporter related  39.03 
 
 		 605 aa  300  4e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1436  ABC transporter related  37.38 
 
 		 609 aa  300  6e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0538238  normal  0.545859 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2324  ABC transporter related  38.38 
 
 		 593 aa  299  8e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0897  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.47 
 
 		 581 aa  298  2e-79  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2825  ABC transporter related protein  37.37 
 
 		 606 aa  297  4e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4445  ABC transporter related  38.82 
 
 		 598 aa  296  5e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.307141 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2128  ABC transporter related  37.13 
 
 		 578 aa  296  6e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.976048  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0863  ABC transporter, transmembrane region  38.22 
 
 		 565 aa  296  8e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.729362  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1331  ABC transporter related  33.45 
 
 		 596 aa  296  9e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3090  ABC transporter related  36.42 
 
 		 577 aa  295  2e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1425  ABC transporter related  35.95 
 
 		 1138 aa  293  5e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.886834 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00710  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.14 
 
 		 593 aa  293  6e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.22824  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2625  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.59 
 
 		 579 aa  293  8e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0842  ABC transporter, transmembrane region  37.62 
 
 		 672 aa  293  8e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0244  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.72 
 
 		 574 aa  292  1e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0317  ABC transporter related  35.7 
 
 		 581 aa  292  1e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0864  ABC transporter, transmembrane region  37.6 
 
 		 603 aa  291  2e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4511  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.2 
 
 		 612 aa  291  3e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204687  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2441  ABC transporter related  41.02 
 
 		 597 aa  290  5.0000000000000004e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00999176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2373  ABC transporter related protein  37.66 
 
 		 578 aa  289  1e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.267302  normal  0.0804864 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0737  ABC transporter related  36.02 
 
 		 652 aa  289  1e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0691  ABC transporter related  32.02 
 
 		 578 aa  288  2.9999999999999996e-76  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1774  ABC transporter related  32.02 
 
 		 578 aa  288  2.9999999999999996e-76  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.937186  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0273  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.69 
 
 		 588 aa  286  5.999999999999999e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.330655  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0806  ABC transporter related  35.54 
 
 		 666 aa  286  5.999999999999999e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>