More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7096 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7096  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  100 
 
 		 578 aa  1181    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2402  extracellular solute-binding protein family 5  53.25 
 
 		 566 aa  637    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.951994 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3275  extracellular solute-binding protein family 5  47.53 
 
 		 570 aa  567  1e-160  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0712739  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1954  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  46.17 
 
 		 567 aa  536  1e-151  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.754029 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0818  peptide/nickel transport system substrate-binding protein  45.03 
 
 		 568 aa  505  1e-141  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5593  extracellular solute-binding protein family 5  42.78 
 
 		 567 aa  429  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.38037 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8314  extracellular solute-binding protein family 5  44.04 
 
 		 576 aa  407  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3931  extracellular solute-binding protein  41.38 
 
 		 555 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0539387  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4005  extracellular solute-binding protein  41.38 
 
 		 555 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.326685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2258  extracellular solute-binding protein  40.46 
 
 		 558 aa  392  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.152339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3946  extracellular solute-binding protein  41.55 
 
 		 554 aa  393  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.436412  normal  0.0739925 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4433  extracellular solute-binding protein  40.15 
 
 		 550 aa  382  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.766057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11306  periplasmic oligopeptide-binding lipoprotein oppA  40.14 
 
 		 591 aa  380  1e-104  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0536  extracellular solute-binding protein family 5  35.41 
 
 		 565 aa  362  7.0000000000000005e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08460  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  31.66 
 
 		 579 aa  299  8e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1251  extracellular solute-binding protein  31.35 
 
 		 580 aa  241  2.9999999999999997e-62  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00147859 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1116  extracellular solute-binding protein  31.31 
 
 		 581 aa  236  1.0000000000000001e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.749385  normal  0.0404913 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0619  extracellular solute-binding protein family 5  31.02 
 
 		 551 aa  234  2.0000000000000002e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0917  extracellular solute-binding protein family 5  28.57 
 
 		 592 aa  202  1.9999999999999998e-50  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.340529 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7779  extracellular solute-binding protein family 5  28.47 
 
 		 597 aa  184  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.354248 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3805  extracellular solute-binding protein family 5  27.92 
 
 		 590 aa  169  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4014  extracellular solute-binding protein  28.42 
 
 		 569 aa  167  5e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1835  extracellular solute-binding protein  27 
 
 		 563 aa  162  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00561184  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0760  extracellular solute-binding protein family 5  27.93 
 
 		 566 aa  133  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.010503  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31140  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  23.05 
 
 		 586 aa  129  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31150  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  24.88 
 
 		 622 aa  120  6e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3330  extracellular solute-binding protein family 5  25.19 
 
 		 614 aa  120  9e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.424693  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1633  putative solute-binding dependent transport lipoprotein  23.9 
 
 		 585 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0761  extracellular solute-binding protein family 5  23.65 
 
 		 604 aa  118  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.952848  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1145  extracellular solute-binding protein family 5  29.77 
 
 		 622 aa  114  4.0000000000000004e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0845067  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4535  extracellular solute-binding protein family 5  26.85 
 
 		 567 aa  114  7.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7203  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  24.7 
 
 		 581 aa  109  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.120174  normal  0.128293 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0872  extracellular solute-binding protein  22.92 
 
 		 541 aa  108  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00426332  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4315  extracellular solute-binding protein family 5  26.11 
 
 		 603 aa  105  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0499363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2261  extracellular solute-binding protein family 5  24.68 
 
 		 579 aa  102  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0252536  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4314  extracellular solute-binding protein family 5  23.39 
 
 		 606 aa  100  7e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.986199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  26.1 
 
 		 540 aa  100  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5299  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  24.26 
 
 		 556 aa  100  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2827  extracellular solute-binding protein  24.01 
 
 		 592 aa  98.6  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.320124  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0785  extracellular solute-binding protein family 5  23.35 
 
 		 600 aa  95.5  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1032  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  25.55 
 
 		 544 aa  95.5  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000591223  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11191  lipoprotein lpqW  25.58 
 
 		 635 aa  95.9  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1485  extracellular solute-binding protein family 5  25.63 
 
 		 579 aa  95.5  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4039  extracellular solute-binding protein  27.38 
 
 		 624 aa  95.5  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.668084  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4114  extracellular solute-binding protein  27.38 
 
 		 624 aa  95.5  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4268  extracellular solute-binding protein  27.38 
 
 		 624 aa  95.5  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0216  extracellular solute-binding protein  26.8 
 
 		 553 aa  94.7  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.923383 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2164  extracellular solute-binding protein  24.56 
 
 		 599 aa  94.4  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.10806 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26210  extracellular solute-binding protein, family 5  23 
 
 		 606 aa  94  6e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.825095  normal  0.282654 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15570  extracellular solute-binding protein, family 5  23.24 
 
 		 619 aa  94  7e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0497629  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0645  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  24.76 
 
 		 524 aa  93.6  8e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  25.06 
 
 		 544 aa  94  8e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0044  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  27.07 
 
 		 530 aa  92.8  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4539  extracellular solute-binding protein  25.99 
 
 		 608 aa  93.2  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 559 aa  91.7  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1284  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  26.38 
 
 		 545 aa  90.9  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000669385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0255  extracellular solute-binding protein  26.8 
 
 		 554 aa  90.1  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.192685  hitchhiker  0.00254463 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3039  4-phytase  28.84 
 
 		 518 aa  89  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0205  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  21.8 
 
 		 575 aa  89.4  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0062  ABC nickel transporter, periplasmic ligand binding protein  27.08 
 
 		 511 aa  89.4  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0570  extracellular solute-binding protein  23.68 
 
 		 591 aa  88.2  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0351  nickel ABC transporter, periplasmic nickel- binding protein  26.92 
 
 		 532 aa  88.2  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0218  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  24.29 
 
 		 559 aa  87.8  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0231  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  24.29 
 
 		 555 aa  87.8  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0218  extracellular solute-binding protein  30.45 
 
 		 537 aa  87.4  6e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.219975  normal  0.837771 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  24.36 
 
 		 546 aa  87.4  6e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0241  putative oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.59 
 
 		 575 aa  87  7e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1660  extracellular solute-binding protein family 5  27.39 
 
 		 589 aa  87  8e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.299882  normal  0.183706 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0248  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein, putative  25.07 
 
 		 575 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0245  oligopeptide-binding protein OppA  22.55 
 
 		 575 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0551474  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  23.48 
 
 		 510 aa  85.9  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4820  extracellular solute-binding protein  28.09 
 
 		 556 aa  85.9  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.161411 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0209  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.32 
 
 		 575 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.019765  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19540  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.15 
 
 		 567 aa  85.5  0.000000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.394832  normal  0.058637 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1886  periplasmic dipeptide transport protein precursor  26.08 
 
 		 525 aa  84.7  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.105927  normal  0.91526 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5080  oligopeptide-binding protein OppA  24.8 
 
 		 575 aa  84.7  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2258  extracellular solute-binding protein family 5  26.12 
 
 		 591 aa  84.3  0.000000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000752385  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  23.45 
 
 		 539 aa  84.3  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2761  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 544 aa  84  0.000000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0510  extracellular solute-binding protein  23.91 
 
 		 510 aa  84  0.000000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0306064  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5619  extracellular solute-binding protein  24.94 
 
 		 526 aa  83.6  0.000000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4089  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2814  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.55 
 
 		 521 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.1277  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0785  extracellular solute-binding protein  25.08 
 
 		 512 aa  83.6  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0600833  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4682  extracellular solute-binding protein family 5  26.95 
 
 		 532 aa  82.8  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2542  extracellular solute-binding protein  25.11 
 
 		 521 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0150221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0208  extracellular solute-binding protein  24.8 
 
 		 575 aa  82.8  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4285  extracellular solute-binding protein  26.29 
 
 		 530 aa  82.4  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.261799  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5138  putative periplasmic peptide-binding protein ABC transporter  26.33 
 
 		 495 aa  82  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0462348 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2944  extracellular solute-binding protein family 5  24.37 
 
 		 587 aa  81.3  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0305195 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3501  extracellular solute-binding protein  25.43 
 
 		 639 aa  80.9  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000268642  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0140  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  22.74 
 
 		 534 aa  81.3  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259377  normal  0.633025 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3603  extracellular solute-binding protein family 5  27.69 
 
 		 542 aa  81.3  0.00000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2857  putative oligopeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  26.67 
 
 		 532 aa  80.9  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.207734 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0146  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.03 
 
 		 539 aa  80.9  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1764  extracellular solute-binding protein family 5  26.23 
 
 		 526 aa  80.9  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.295464 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4381  extracellular solute-binding protein  25.68 
 
 		 543 aa  80.5  0.00000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000255213 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2585  putative ABC transporter, substrate binding subunit  24.28 
 
 		 520 aa  80.5  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598963 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0266  extracellular solute-binding protein family 5  24.46 
 
 		 575 aa  80.5  0.00000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1518  peptide ABC transporter, peptide-binding protein  25.26 
 
 		 538 aa  80.1  0.0000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000374669  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2496  extracellular solute-binding protein  25.23 
 
 		 538 aa  79.7  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0292957  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>