127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1264 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1264  membrane protein-like protein  100 
 
 
311 aa  607  1e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0671  ribonuclease BN  61.43 
 
 
315 aa  280  2e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.157242 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4202  ribonuclease BN  41.76 
 
 
341 aa  223  3e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3957  ribonuclease BN  45.57 
 
 
374 aa  214  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.707734  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5966  ribonuclease BN  43.79 
 
 
390 aa  188  8e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.172061 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0663  ribonuclease BN  43.06 
 
 
411 aa  184  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.362248  normal  0.0877902 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0950  ribonuclease  30.34 
 
 
332 aa  143  4e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1769  ribonuclease BN  30.24 
 
 
377 aa  140  3e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6469  ribonuclease  33.22 
 
 
339 aa  136  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1213  hypothetical protein  31.51 
 
 
339 aa  135  9e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158916  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1230  putative ribonuclease  31.51 
 
 
339 aa  135  9e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05300  ribonuclease, putative  33.11 
 
 
366 aa  133  3.9999999999999996e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4870  putative ribonuclease  29.79 
 
 
346 aa  127  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0433032  normal  0.0967189 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1240  putative ribonuclease  30.61 
 
 
343 aa  122  7e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.35918 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4056  ribonuclease BN-like family protein  29.79 
 
 
361 aa  119  7.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0106  ribonuclease  29.79 
 
 
366 aa  118  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03370  conserved inner membrane protein  29.37 
 
 
337 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0762767  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0191  ribonuclease  29.37 
 
 
337 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.365161  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3725  putative ribonuclease  29.37 
 
 
337 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0195  ribonuclease  29.37 
 
 
337 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.119003  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03323  hypothetical protein  29.37 
 
 
337 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1002  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4010  putative ribonuclease  29.37 
 
 
337 aa  117  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3826  putative ribonuclease  29.37 
 
 
337 aa  117  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.135959 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3927  putative ribonuclease  29.37 
 
 
337 aa  117  3e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4885  putative ribonuclease  29.37 
 
 
337 aa  117  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1561  putative ribonuclease  30.58 
 
 
347 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.285533 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4075  hypothetical protein  29.79 
 
 
357 aa  115  6.9999999999999995e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.90745  normal  0.0226711 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3919  putative ribonuclease  28.57 
 
 
341 aa  113  4.0000000000000004e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.431008  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4744  putative ribonuclease  28.62 
 
 
339 aa  113  5e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3886  ribonuclease  30.32 
 
 
332 aa  112  6e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0083  ribonuclease  28.72 
 
 
338 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0087  ribonuclease  28.48 
 
 
338 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1295  ribonuclease  29.45 
 
 
361 aa  110  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.381565 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2955  ribonuclease BN  32.08 
 
 
389 aa  108  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00451533  decreased coverage  0.000148448 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13368  integral membrane protein  31.37 
 
 
289 aa  105  9e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3880  putative ribonuclease  29.55 
 
 
342 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3924  putative ribonuclease  29.55 
 
 
342 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3802  putative ribonuclease  29.55 
 
 
342 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3815  putative ribonuclease  29.55 
 
 
342 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3983  putative ribonuclease  29.55 
 
 
342 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.344715 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4073  ribonuclease  30.03 
 
 
328 aa  103  4e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14240  predicted membrane protein  30.36 
 
 
352 aa  101  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00629012  normal  0.0181744 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5550  membrane protein-like protein  34.59 
 
 
302 aa  92.4  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.989573  normal  0.0897553 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0898  ribonuclease BN  30.11 
 
 
307 aa  92  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0551761 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4405  ribonuclease BN  34.77 
 
 
343 aa  91.3  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25840  predicted membrane protein  28.87 
 
 
375 aa  90.9  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.200788  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0143  hypothetical protein  29.96 
 
 
266 aa  86.7  4e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.23892  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1012  ribonuclease BN  27.55 
 
 
344 aa  83.2  0.000000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1198  ribonuclease BN  26.59 
 
 
324 aa  79.7  0.00000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000216425 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0799  ribonuclease BN  30.71 
 
 
367 aa  79  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0743  ribonuclease BN  31.09 
 
 
307 aa  76.3  0.0000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.183226  hitchhiker  0.000468275 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3967  ribonuclease BN  28.95 
 
 
357 aa  74.7  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.565971 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1654  ribonuclease BN  32.04 
 
 
345 aa  64.7  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00658785  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0817  ribonuclease BN  28.1 
 
 
315 aa  63.5  0.000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0352  ribonuclease BN  27.84 
 
 
387 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.062974  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0362  ribonuclease BN  27.84 
 
 
387 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.888371 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0341  ribonuclease BN  27.84 
 
 
387 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1124  ribonuclease BN  24.91 
 
 
329 aa  61.6  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1876  ribonuclease BN  27.14 
 
 
306 aa  59.7  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0986  ribonuclease BN  25.86 
 
 
288 aa  58.9  0.00000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5288  ribonuclease BN  26.81 
 
 
316 aa  58.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.795849  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0014  putative ribonuclease BN  30.74 
 
 
450 aa  57.8  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0653  ribonuclease BN  25.27 
 
 
294 aa  58.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1997  ribonuclease BN  23.05 
 
 
350 aa  57.4  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  26.48 
 
 
328 aa  55.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2480  putative ribonuclease BN  27.17 
 
 
546 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.422158  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3429  ribonuclease BN  26.77 
 
 
320 aa  55.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2530  ribonuclease BN  24.35 
 
 
337 aa  54.3  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4548  ribonuclease BN  29.73 
 
 
349 aa  53.5  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.79228  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4026  ribonuclease BN  29.23 
 
 
302 aa  53.1  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.194003 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3922  ribonuclease BN  24.75 
 
 
370 aa  52.4  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644027  normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4230  ribonuclease BN  25.09 
 
 
330 aa  51.6  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375686  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2621  ribonuclease BN  24.6 
 
 
304 aa  51.2  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5324  ribonuclease BN  26.3 
 
 
301 aa  50.8  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5809  ribonuclease BN, putative  23.67 
 
 
321 aa  50.1  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3282  ribonuclease BN  22.34 
 
 
306 aa  50.1  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2372  ribonuclease BN  23.25 
 
 
321 aa  49.7  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483691  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3201  ribonuclease BN  24.56 
 
 
309 aa  49.3  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.248041 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0297  ribonuclease BN  23.15 
 
 
291 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.421979 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  28.36 
 
 
349 aa  47.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5884  ribonuclease BN  25.18 
 
 
499 aa  47.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2157  ribonuclease BN  22.35 
 
 
393 aa  48.1  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1422  putative ribonuclease BN transmembrane protein  24.23 
 
 
416 aa  48.5  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00924301 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0042  BrkB-like serum-resistance protein  24.31 
 
 
294 aa  47.8  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.363004  normal  0.262588 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0983  ribonuclease BN  23.65 
 
 
414 aa  47.4  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.460306 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2225  ribonuclease BN  24.73 
 
 
298 aa  46.6  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.681291  decreased coverage  0.00304933 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3909  ribonuclease BN  25.17 
 
 
340 aa  46.6  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5335  ribonuclease BN  24.32 
 
 
329 aa  46.2  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4092  ribonuclease BN  26.2 
 
 
290 aa  46.2  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1517  ribonuclease BN  28.08 
 
 
321 aa  46.2  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3548  ribonuclease  21.21 
 
 
299 aa  46.2  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0230388  normal  0.0399226 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4345  ribonuclease BN  23.39 
 
 
331 aa  45.8  0.0009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0371842  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4100  ribonuclease BN  25.87 
 
 
290 aa  45.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2316  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  21.27 
 
 
428 aa  45.8  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000260717  hitchhiker  0.000176219 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4111  ribonuclease BN  25.87 
 
 
290 aa  45.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.235548  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4409  ribonuclease BN  25.87 
 
 
290 aa  45.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4878  ribonuclease BN  25.77 
 
 
296 aa  45.4  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000922798 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6562  ribonuclease BN  22.18 
 
 
347 aa  45.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.357212  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4132  ribonuclease BN  25.87 
 
 
290 aa  45.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4271  ribonuclease BN  25.87 
 
 
290 aa  45.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>