More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5915 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5915  protein serine/threonine phosphatase  100 
 
 
372 aa  721    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0085  protein serine/threonine phosphatase  58.6 
 
 
375 aa  359  4e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.611394  normal  0.0411446 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0088  stage II sporulation E family protein  57.54 
 
 
375 aa  346  4e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2409  Stage II sporulation E family protein  41.94 
 
 
400 aa  239  8e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2103  Stage II sporulation E family protein  40.18 
 
 
350 aa  221  9.999999999999999e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5480  protein serine/threonine phosphatase  41 
 
 
455 aa  211  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00189535  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1556  serine phosphatase  40.23 
 
 
363 aa  209  5e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.79241  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0848  protein serine/threonine phosphatase  42.99 
 
 
369 aa  197  3e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.509752  normal  0.225073 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1873  protein serine/threonine phosphatase  39.22 
 
 
382 aa  183  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.755002  normal  0.205134 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2794  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  38.12 
 
 
376 aa  181  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242922  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0174  serine phosphatase  41.39 
 
 
390 aa  178  1e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.872629  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1695  stage II sporulation E family protein  42.8 
 
 
346 aa  176  4e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0870633  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3720  protein serine/threonine phosphatase  45.28 
 
 
315 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.124  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0249  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  38.08 
 
 
359 aa  166  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5452  protein serine/threonine phosphatase  36.13 
 
 
400 aa  159  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180738  normal  0.458665 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4609  protein serine/threonine phosphatase  42.28 
 
 
395 aa  157  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.919573  decreased coverage  0.0000074817 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6901  protein serine/threonine phosphatase  45.68 
 
 
400 aa  157  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.473487  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2796  protein phosphatase 2C-like  32.74 
 
 
397 aa  123  6e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3955  protein serine/threonine phosphatase  35.71 
 
 
391 aa  120  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0050262  normal  0.108854 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1132  protein serine/threonine phosphatase  34.54 
 
 
389 aa  114  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.815308  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1306  protein serine/threonine phosphatase  43.95 
 
 
406 aa  102  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1690  putative PAS/PAC sensor protein  32.54 
 
 
377 aa  99.8  7e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.074722  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2919  putative PAS/PAC sensor protein  35.1 
 
 
581 aa  93.2  6e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5158  serine phosphatase  29.75 
 
 
431 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5247  putative GAF sensor protein  29.75 
 
 
431 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2345  rsbU-related protein  33.6 
 
 
249 aa  88.2  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.442066  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5539  putative GAF sensor protein  30.17 
 
 
431 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.509272  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1606  putative PAS/PAC sensor protein  34.69 
 
 
693 aa  87  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.132491  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1626  protein serine/threonine phosphatase  35.92 
 
 
412 aa  86.3  7e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0844  stage II sporulation E family protein  30.77 
 
 
454 aa  85.5  0.000000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3436  protein serine/threonine phosphatase  32.92 
 
 
488 aa  84.7  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0107895  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2718  serine phosphatase  29.96 
 
 
533 aa  83.6  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.482348  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1632  putative PAS/PAC sensor protein  37.14 
 
 
583 aa  83.6  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.12 
 
 
549 aa  83.2  0.000000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00204881 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2796  cyclic nucleotide-binding protein  31.08 
 
 
453 aa  82.8  0.000000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.180681  normal  0.733886 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0541  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.61 
 
 
445 aa  82  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7544  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.61 
 
 
1051 aa  81.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2946  response regulator receiver modulated serine phosphatase  27.46 
 
 
384 aa  80.1  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  27.48 
 
 
708 aa  80.1  0.00000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0468  protein serine/threonine phosphatase  28.64 
 
 
445 aa  79.7  0.00000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0093  stage II sporulation E family protein  24.91 
 
 
464 aa  79.7  0.00000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13090  Stage II sporulation protein E (SpoIIE)  31.6 
 
 
576 aa  79.3  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2083  PAS/protein phosphatase 2C-like  34.27 
 
 
672 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2401  protein serine/threonine phosphatase  32.67 
 
 
376 aa  78.6  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.151226 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0453  stage II sporulation E family protein  28.16 
 
 
445 aa  78.6  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.315946  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0924  protein serine/threonine phosphatase  26.52 
 
 
705 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0206766 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4921  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.08 
 
 
549 aa  77.8  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.923256  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3313  putative PAS/PAC sensor protein  31.89 
 
 
692 aa  77.4  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2468  stage II sporulation E family protein  30.04 
 
 
455 aa  77  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4657  serine phosphatase  31.49 
 
 
467 aa  76.3  0.0000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.767582  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2171  protein serine/threonine phosphatase  31.88 
 
 
389 aa  75.5  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.529271  hitchhiker  0.000569605 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1419  putative PAS/PAC sensor protein  37 
 
 
770 aa  75.9  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4712  protein serine/threonine phosphatase  29.72 
 
 
431 aa  75.9  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.883041  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2399  putative PAS/PAC sensor protein  32.47 
 
 
700 aa  75.5  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.249407  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7089  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  31.94 
 
 
697 aa  75.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0288523  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5396  protein serine/threonine phosphatase  31.23 
 
 
412 aa  75.5  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4080  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.04 
 
 
738 aa  75.1  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32388  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0864  putative PAS/PAC sensor protein  26.88 
 
 
633 aa  75.1  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4104  stage II sporulation E family protein  30.88 
 
 
694 aa  75.1  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2161  Stage II sporulation E family protein  28.11 
 
 
566 aa  74.3  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4524  protein serine/threonine phosphatase  31.3 
 
 
693 aa  73.9  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280283 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2329  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.77 
 
 
748 aa  73.6  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.681955  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2911  protein serine/threonine phosphatase  34.65 
 
 
658 aa  73.6  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0060  serine phosphatase  29.32 
 
 
706 aa  72.8  0.000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2179  sigma factor regulation protein  27.59 
 
 
404 aa  72.4  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.116997  normal  0.843172 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3110  putative PAS/PAC sensor protein  33.02 
 
 
697 aa  72.8  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.63551  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1652  stage II sporulation E family protein  27.96 
 
 
687 aa  72.4  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.0030302 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3121  protein serine/threonine phosphatase  29.64 
 
 
415 aa  72  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4210  protein serine/threonine phosphatase  31.53 
 
 
361 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.379426  normal  0.154823 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0186  protein serine/threonine phosphatase  33.89 
 
 
512 aa  71.2  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2818  putative PAS/PAC sensor protein  32.94 
 
 
649 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3495  serine phosphatase  32.87 
 
 
262 aa  72  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0288  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.93 
 
 
572 aa  70.9  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1993  stage II sporulation E family protein  31.1 
 
 
708 aa  70.9  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2798  response regulator receiver modulated serine phosphatase  30.42 
 
 
538 aa  70.9  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0947  putative PAS/PAC sensor protein  36.15 
 
 
956 aa  70.9  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.360212  normal  0.074138 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1752  protein phosphatase 2C-like  36.27 
 
 
591 aa  70.5  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3218  Stage II sporulation E family protein  27.94 
 
 
630 aa  70.9  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.717708  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0173  serine phosphatase  29.67 
 
 
451 aa  70.5  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.361934  normal  0.766765 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0619  putative PAS/PAC sensor protein  27.24 
 
 
391 aa  70.5  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.33 
 
 
1361 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.498632 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3234  serine phosphatase  28.11 
 
 
631 aa  70.1  0.00000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1931  protein serine/threonine phosphatase  29.64 
 
 
451 aa  70.1  0.00000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.307044 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0663  protein serine/threonine phosphatase  29.77 
 
 
846 aa  69.7  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0916  putative PAS/PAC sensor protein  28.17 
 
 
781 aa  69.7  0.00000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.557683 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1931  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.33 
 
 
1385 aa  69.7  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2204  serine phosphatase  29.18 
 
 
644 aa  69.7  0.00000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206885  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0086  putative PAS/PAC sensor protein  36.48 
 
 
685 aa  69.3  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.65346  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1417  protein serine/threonine phosphatase  32.31 
 
 
400 aa  69.3  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.291528  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2194  Stage II sporulation E family protein  30.32 
 
 
423 aa  69.3  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1241  putative PAS/PAC sensor protein  34.84 
 
 
1432 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402812 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4347  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.55 
 
 
576 aa  68.6  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0230944  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1571  putative PAS/PAC sensor protein  32.73 
 
 
562 aa  68.2  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2013  response regulator receiver modulated serine phosphatase  31.58 
 
 
411 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.155477  normal  0.0155604 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2239  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  35.03 
 
 
553 aa  68.2  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4481  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  31.56 
 
 
549 aa  68.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00461161  normal  0.901449 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4521  putative GAF sensor protein  31.29 
 
 
851 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1588  putative PAS/PAC sensor protein  34.98 
 
 
607 aa  67.8  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.127314 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0401  putative PAS/PAC sensor protein  30.55 
 
 
544 aa  67.8  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00113041  normal  0.0129071 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4365  protein serine/threonine phosphatase  37.67 
 
 
405 aa  67  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>