257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2713 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2713  intradiol ring-cleavage dioxygenase  100 
 
 
271 aa  555  1e-157  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.655559  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7854  Protocatechuate 3 4-dioxygenase beta subunit- like protein  59.55 
 
 
277 aa  295  5e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4070  intradiol ring-cleavage dioxygenase  43.88 
 
 
192 aa  152  4e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2592  intradiol ring-cleavage dioxygenase  43.15 
 
 
193 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1824  twin-arginine translocation pathway signal  31.25 
 
 
223 aa  90.5  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0820429  hitchhiker  0.00384928 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1587  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.1 
 
 
299 aa  77  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0037  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.02 
 
 
237 aa  76.3  0.0000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2317  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  60.78 
 
 
457 aa  75.5  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.702389  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3226  intradiol ring-cleavage dioxygenase  38.33 
 
 
248 aa  75.1  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.281874 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2095  intradiol ring-cleavage dioxygenase  35.25 
 
 
245 aa  72  0.000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.781627  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1294  catechol 1,2-dioxygenase  31.25 
 
 
283 aa  71.6  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5241  twin-arginine translocation pathway signal  38.02 
 
 
238 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1358  catechol 1,2-dioxygenase  36.3 
 
 
292 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.206234  normal  0.156449 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4154  catechol 1,2-dioxygenase  31.46 
 
 
290 aa  70.5  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.636765  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1942  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.02 
 
 
234 aa  70.1  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.842989  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0945  intradiol ring-cleavage dioxygenase  35.17 
 
 
288 aa  70.1  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3903  intradiol ring-cleavage dioxygenase  27.75 
 
 
327 aa  70.1  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0806083 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2416  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.1 
 
 
256 aa  68.2  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1376  catechol 1,2-dioxygenase  34.69 
 
 
287 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2843  intradiol ring-cleavage dioxygenase  36.8 
 
 
233 aa  68.6  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1933  catechol 1,2-dioxygenase  29.21 
 
 
297 aa  68.2  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1394  catechol 1,2-dioxygenase  34.69 
 
 
287 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.127485  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7908  hypothetical protein  61.7 
 
 
285 aa  68.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.921269  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1410  catechol 1,2-dioxygenase  34.69 
 
 
287 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4839  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.25 
 
 
282 aa  66.6  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19220  catechol 1,2-dioxygenase  29.55 
 
 
287 aa  66.2  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.184485  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0836  catechol 1,2-dioxygenase  32.73 
 
 
287 aa  66.2  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1483  chitin-binding domain-containing protein  63.64 
 
 
244 aa  65.9  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.815729  hitchhiker  0.000167974 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0120  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.86 
 
 
191 aa  65.9  0.0000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0339331 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1647  chitin-binding domain-containing protein  58.33 
 
 
356 aa  65.1  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0765002  normal  0.540301 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3523  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.94 
 
 
288 aa  65.1  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1799  glycoside hydrolase family protein  60.47 
 
 
551 aa  65.1  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000760023  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0474  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.72 
 
 
247 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3212  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.58 
 
 
250 aa  63.9  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.302097  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2786  intradiol ring-cleavage dioxygenase  35.71 
 
 
190 aa  64.7  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3458  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.79 
 
 
216 aa  63.9  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.898737  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3599  hypothetical protein  56.82 
 
 
245 aa  63.5  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.488922  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2193  carbohydrate-binding family V/XII protein  56.82 
 
 
790 aa  63.5  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00201516  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2243  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.29 
 
 
250 aa  62.8  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1632  chitin-binding domain-containing protein  57.78 
 
 
338 aa  62.4  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3769  intradiol ring-cleavage dioxygenase  40 
 
 
237 aa  61.2  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1128  protocatechuate 3 4-dioxygenase beta subunit like protein  31.75 
 
 
252 aa  61.6  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.608028  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1202  twin-arginine translocation pathway signal  34.56 
 
 
252 aa  60.8  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2254  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.56 
 
 
258 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.802404 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1486  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.77 
 
 
220 aa  60.5  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1849  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  29.25 
 
 
234 aa  60.5  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0804  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.77 
 
 
268 aa  60.5  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3895  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  60.53 
 
 
1077 aa  60.1  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5334  chitin-binding domain 3 protein  55.32 
 
 
262 aa  60.1  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509642  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1680  intradiol ring-cleavage dioxygenase  29.03 
 
 
236 aa  59.7  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3772  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.64 
 
 
281 aa  59.3  0.00000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2567  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.77 
 
 
258 aa  58.9  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001576  protocatechuate 3,4-dioxygenase beta chain  30.82 
 
 
190 aa  57.8  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1918  hypothetical protein  52.38 
 
 
561 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2988  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.22 
 
 
228 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2494  glycoside hydrolase family protein  57.14 
 
 
904 aa  57  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7609  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  31.67 
 
 
225 aa  57  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0205  intradiol ring-cleavage dioxygenase  29.87 
 
 
275 aa  56.6  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.571878  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4270  protocatechuate 3,4-dioxygenase subunit beta  31.45 
 
 
277 aa  56.2  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.760341  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6846  Chitinase  47.73 
 
 
855 aa  56.2  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.403057  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6466  chlorocatechol 1,2-dioxygenase  30.22 
 
 
255 aa  55.8  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4013  protocatechuate (dihdydroxy benzoate) 3,4-dioxygenase subunit beta  30 
 
 
237 aa  55.8  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1800  glycoside hydrolase family protein  56.82 
 
 
652 aa  55.5  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0348048  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1270  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  30 
 
 
234 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0789  intradiol ring-cleavage dioxygenase  26.79 
 
 
277 aa  55.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0716  dioxygenase family protein  26.79 
 
 
277 aa  55.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0187  hypothetical protein  26.79 
 
 
277 aa  55.1  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00856526  hitchhiker  0.0000433457 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1022  Fibronectin type III domain-containing protein  54.76 
 
 
492 aa  54.7  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.871792  normal  0.307006 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0160  intradiol ring-cleavage dioxygenase  29.3 
 
 
307 aa  55.1  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07161  extracellular dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03070)  33.93 
 
 
377 aa  54.3  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0585073  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5025  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  29.17 
 
 
233 aa  54.3  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.32623  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13020  protocatechuate 3,4-dioxygenase, alpha subunit  30.22 
 
 
184 aa  54.3  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1895  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.63 
 
 
176 aa  54.7  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.949343 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4028  catechol 1,2-dioxygenase  29.86 
 
 
300 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.62462  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1223  glycoside hydrolase family protein  48.28 
 
 
484 aa  53.9  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0824686  normal  0.0476273 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1176  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.83 
 
 
244 aa  53.5  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3378  intradiol ring-cleavage dioxygenase  26.78 
 
 
290 aa  53.1  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49834  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4772  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.82 
 
 
309 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5216  intradiol ring-cleavage dioxygenase  26.23 
 
 
290 aa  53.5  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763537  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05532  protocatechuate 3,4-dioxygenase beta chain protein  28.99 
 
 
190 aa  53.5  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0283  chitin-binding protein  61.7 
 
 
251 aa  53.5  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0142  intradiol ring-cleavage dioxygenase  28.66 
 
 
307 aa  53.1  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.38162  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1818  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  50 
 
 
477 aa  53.1  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000535261  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1176  catechol 1,2-dioxygenase  27.17 
 
 
312 aa  52.8  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.598074  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1073  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  30 
 
 
237 aa  53.1  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.804087  normal  0.121939 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0977  catechol 1,2-dioxygenase  29.61 
 
 
310 aa  53.1  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.705538  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1538  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  29.66 
 
 
235 aa  52.8  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0431142  normal  0.14512 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2123  protocatechuate 3,4-dioxygenase  29.17 
 
 
200 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.21056 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2386  protocatechuate 3,4-dioxygenase, alpha subunit  34.59 
 
 
205 aa  52.4  0.000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.798645  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4858  chitin-binding domain-containing protein  49.09 
 
 
266 aa  52.4  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.667508  normal  0.0771656 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2326  protocatechuate 3,4-dioxygenase subunit beta  27.12 
 
 
235 aa  52.4  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.886605 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32240  catechol 1,2-dioxygenase  32.17 
 
 
310 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2339  protocatechuate 3,4-dioxygenase, alpha subunit  27.87 
 
 
200 aa  52  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.259589  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4340  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.01 
 
 
287 aa  52  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.362809 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03340  conserved hypothetical protein  26.49 
 
 
318 aa  51.6  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0104433  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2502  protocatechuate 3,4-dioxygenase, alpha subunit  29.52 
 
 
208 aa  52  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2456  chitin-binding domain-containing protein  47.27 
 
 
266 aa  51.6  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.361389  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1133  catechol 1,2-dioxygenase  28.82 
 
 
308 aa  50.8  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02906  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  28.21 
 
 
242 aa  51.2  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2186  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  28.46 
 
 
248 aa  51.6  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>