More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1132 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1132  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 930 aa  1866    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.746055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0680  TonB-dependent receptor  24.72 
 
 		 852 aa  187  8e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000204176  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3630  TonB-dependent receptor  23.92 
 
 		 861 aa  173  1e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3562  TonB-dependent receptor  24 
 
 		 861 aa  172  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000011652  normal  0.26922 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3753  TonB-dependent receptor  24 
 
 		 861 aa  172  2e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000402099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0837  TonB-dependent receptor  24.09 
 
 		 855 aa  170  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111272  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2338  TonB-dependent receptor  24.71 
 
 		 867 aa  167  9e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.094918  normal  0.111511 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2967  TonB-dependent receptor  23.61 
 
 		 857 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000174041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2049  TonB-dependent receptor  24.71 
 
 		 867 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115789  normal  0.0404089 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0782  TonB-dependent receptor  23.81 
 
 		 861 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.089219  normal  0.0917766 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1986  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 		 867 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.430479  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2001  TonB-dependent receptor  24.75 
 
 		 867 aa  164  7e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00988263  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0906  TonB-dependent receptor  25.44 
 
 		 875 aa  163  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3184  TonB-dependent receptor  23.32 
 
 		 861 aa  163  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162767  hitchhiker  0.00577733 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2393  TonB-dependent receptor  24.13 
 
 		 866 aa  163  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.228025  normal  0.562058 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3124  TonB-dependent receptor  25.67 
 
 		 973 aa  162  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308275 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0754  TonB-dependent receptor  23.16 
 
 		 861 aa  162  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.95641  normal  0.139424 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1754  putative outer membrane cobalamin receptor protein  25.44 
 
 		 834 aa  161  5e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.902091 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1883  TonB-dependent receptor  24.48 
 
 		 928 aa  159  2e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.320358  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2618  TonB-dependent receptor  23.54 
 
 		 849 aa  159  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000702632  normal  0.386313 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0739  TonB-dependent receptor  24.33 
 
 		 912 aa  159  3e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0580341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0738  TonB-dependent receptor  23.66 
 
 		 847 aa  158  5.0000000000000005e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0108325  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1806  TonB-dependent receptor  23.43 
 
 		 927 aa  156  2e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.248046  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  25.21 
 
 		 853 aa  151  5e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01107  TonB-dependent receptor  22.81 
 
 		 871 aa  151  6e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0244435  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1503  outer membrane receptor protein  22.13 
 
 		 899 aa  149  3e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  24.86 
 
 		 873 aa  147  7.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2416  TonB-dependent receptor  23.37 
 
 		 842 aa  145  2e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0477  TonB-dependent receptor  24.6 
 
 		 879 aa  145  3e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2045  TonB-dependent receptor plug  25.27 
 
 		 853 aa  145  5e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699598  hitchhiker  0.00000000333969 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  23.18 
 
 		 843 aa  144  6e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2302  TonB-dependent receptor plug  25.27 
 
 		 853 aa  144  7e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.780014  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2418  TonB-dependent receptor plug  25.27 
 
 		 853 aa  144  7e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641681  hitchhiker  0.00118555 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2385  TonB-dependent receptor, plug  25.13 
 
 		 895 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000246068  hitchhiker  0.00510046 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  22.15 
 
 		 855 aa  142  3e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  23.6 
 
 		 838 aa  142  3.9999999999999997e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  22.65 
 
 		 841 aa  141  4.999999999999999e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2875  TonB-dependent receptor plug  22 
 
 		 896 aa  138  4e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943225 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  24.21 
 
 		 853 aa  138  5e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001855  outer membrane receptor protein  23.54 
 
 		 866 aa  137  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0967  TonB-dependent receptor  23.3 
 
 		 869 aa  135  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133332  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2075  TonB-dependent receptor  22.15 
 
 		 855 aa  135  3e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00318528  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2467  TonB-dependent receptor  27.46 
 
 		 907 aa  134  6e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000162909  hitchhiker  0.00002571 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1252  TonB-dependent receptor  25.66 
 
 		 907 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000104446  unclonable  0.0000165135 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2243  TonB-dependent receptor  32.19 
 
 		 1000 aa  132  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.212076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1716  TonB-dependent receptor, plug  22.01 
 
 		 893 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.716976  hitchhiker  0.000145025 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0162  TonB-dependent receptor  25.34 
 
 		 817 aa  128  6e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00638  iron transport protein  24.53 
 
 		 827 aa  128  6e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3509  TonB-dependent receptor  24.96 
 
 		 904 aa  127  9e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  21.95 
 
 		 839 aa  126  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3632  TonB-dependent receptor  24.96 
 
 		 904 aa  125  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0855  TonB-dependent receptor  24.08 
 
 		 904 aa  125  3e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  35.44 
 
 		 873 aa  124  6e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1988  TonB-dependent receptor  33.55 
 
 		 1020 aa  123  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3438  TonB-dependent receptor  24.24 
 
 		 904 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2353  TonB-dependent receptor  35.81 
 
 		 908 aa  122  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.880322  normal  0.439021 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1633  TonB-dependent receptor  35.68 
 
 		 938 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000109848  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2044  TonB-dependent receptor, plug  24.35 
 
 		 709 aa  119  3e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0644838  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  37.68 
 
 		 869 aa  119  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0138  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  23.16 
 
 		 904 aa  118  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.764609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1769  TonB-dependent receptor  37.5 
 
 		 985 aa  116  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.372996 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2298  TonB-dependent receptor  29.22 
 
 		 874 aa  116  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.867047  normal  0.236375 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1120  TonB-dependent receptor  36.73 
 
 		 942 aa  115  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00264761 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0819  TonB-dependent receptor plug  38.01 
 
 		 974 aa  115  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.712019 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37900  putative TonB-dependent receptor  38.62 
 
 		 846 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00691809  normal  0.333573 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3321  TonB-dependent receptor  38.74 
 
 		 987 aa  115  5e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0185531  normal  0.64896 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1100  outer membrane receptor protein  35.03 
 
 		 922 aa  114  6e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000948721  hitchhiker  0.00320832 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4698  TonB-dependent receptor  23.57 
 
 		 893 aa  113  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.644067 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2244  TonB-dependent receptor  35.25 
 
 		 892 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187564 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  31.1 
 
 		 836 aa  112  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2427  TonB-dependent receptor, plug  35.58 
 
 		 966 aa  111  5e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000018893  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3757  TonB-dependent receptor  33.51 
 
 		 924 aa  111  6e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19794  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03827  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 892 aa  110  8.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2263  TonB-dependent receptor  33.46 
 
 		 882 aa  110  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.594677  normal  0.894337 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2335  TonB-dependent receptor  33.46 
 
 		 882 aa  110  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0682535  normal  0.0458053 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0250  TonB-dependent receptor  37.14 
 
 		 952 aa  109  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3556  TonB-dependent receptor  33.57 
 
 		 944 aa  110  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3411  TonB-dependent receptor  34.75 
 
 		 953 aa  109  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.961049 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0991  TonB-dependent receptor  25.47 
 
 		 925 aa  109  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0120803  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5189  TonB-dependent receptor  27.56 
 
 		 981 aa  108  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7317  TonB-dependent receptor  24.66 
 
 		 903 aa  108  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.924215 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2531  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 		 843 aa  107  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0820  TonB-dependent receptor  37.93 
 
 		 975 aa  107  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3083  TonB-dependent receptor  31.67 
 
 		 912 aa  106  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000522801  decreased coverage  0.000005339 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3813  TonB-dependent receptor  32.02 
 
 		 991 aa  106  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.722498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2699  TonB-dependent receptor  29.29 
 
 		 886 aa  106  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.475317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2624  TonB-dependent receptor  29.29 
 
 		 886 aa  106  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0750923  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2904  TonB-dependent receptor  33.05 
 
 		 944 aa  105  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01457  TonB-dependent outer membrane receptor  39.64 
 
 		 914 aa  105  4e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.11221  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3061  TonB-dependent receptor plug  37.91 
 
 		 985 aa  105  4e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00588952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2404  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 872 aa  105  5e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1499  TonB-dependent receptor  32.1 
 
 		 894 aa  104  6e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02600  TonB-dependent receptor  34.95 
 
 		 981 aa  104  6e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1868  TonB-dependent receptor  24.88 
 
 		 935 aa  104  9e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31102  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6367  TonB-dependent receptor  22.76 
 
 		 941 aa  103  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0355327  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2871  TonB-dependent receptor  32.72 
 
 		 935 aa  103  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1859  TonB-dependent receptor  27.38 
 
 		 890 aa  103  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127168 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2119  TonB-dependent receptor  27.38 
 
 		 890 aa  104  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.817127  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1711  TonB-dependent receptor  22.76 
 
 		 941 aa  103  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1914  TonB-dependent receptor  35.75 
 
 		 890 aa  104  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073326 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>