More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1598 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2903  Na+/solute symporter  77.22 
 
 		 488 aa  761    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.585746 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1598  Na+/solute symporter  100 
 
 		 487 aa  975    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.414751 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1047  sodium/solute symporter  57.2 
 
 		 488 aa  541  1e-153  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322443  normal  0.451489 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3029  Na+/solute symporter  54.23 
 
 		 492 aa  538  9.999999999999999e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934608 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4818  Na+/solute symporter  54.36 
 
 		 501 aa  516  1.0000000000000001e-145  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07575  putative transmembrane sodium-solute transporter  56.03 
 
 		 478 aa  486  1e-136  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1101  sodium:solute symporter family protein  48.56 
 
 		 486 aa  459  9.999999999999999e-129  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.465096 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6812  Na+/solute symporter  46.06 
 
 		 493 aa  435  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0641673  hitchhiker  0.00114247 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09590  Na+/proline symporter  32.46 
 
 		 501 aa  159  9e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0974546  normal  0.236374 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0171  SSS sodium solute transporter superfamily  27.09 
 
 		 520 aa  157  3e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0745729 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4170  Na+/solute symporter  26.93 
 
 		 526 aa  153  8e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0688566  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2763  Na+/solute symporter  28.98 
 
 		 472 aa  142  9.999999999999999e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1825  SSS sodium solute transporter superfamily  28.36 
 
 		 533 aa  141  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.915648  normal  0.529366 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3352  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.82 
 
 		 479 aa  140  4.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0195  sodium:solute symporter family protein  26.94 
 
 		 468 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2009  sodium:solute symporter family protein  26.89 
 
 		 473 aa  136  9.999999999999999e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0232  Na+/solute symporter  27.34 
 
 		 467 aa  135  1.9999999999999998e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0261  Na+/solute symporter  26.65 
 
 		 468 aa  133  6e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.728087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0255  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.18 
 
 		 542 aa  133  7.999999999999999e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2358  Na+/solute symporter  28.94 
 
 		 472 aa  126  8.000000000000001e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.552943  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0206  Na+/solute symporter  26.44 
 
 		 470 aa  123  7e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1869  Na+/solute symporter  26.71 
 
 		 502 aa  117  6e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.319535 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2070  Na+/solute symporter  26.94 
 
 		 489 aa  117  6.9999999999999995e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02564  hypothetical protein  24.83 
 
 		 581 aa  114  5e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2962  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.33 
 
 		 574 aa  107  6e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.324391  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5478  Na+/solute symporter  26.26 
 
 		 568 aa  106  8e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0650513 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0609  sodium/solute symporter  24.13 
 
 		 513 aa  105  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.952879  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04816  alkaline phosphatase synthesis sensor protein phoR  23.46 
 
 		 513 aa  104  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1518  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.09 
 
 		 892 aa  103  5e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2604  SSS sodium solute transporter superfamily  26.37 
 
 		 557 aa  102  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.916004  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2866  sodium-solute symporter  25.17 
 
 		 581 aa  100  7e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00297174 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0176  sodium:solute transporter  23.48 
 
 		 505 aa  99.4  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0471  SSS sodium solute transporter superfamily  25.93 
 
 		 557 aa  98.6  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0179  sodium/solute symporter family protein  23.48 
 
 		 505 aa  98.6  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1640  SSS sodium solute transporter superfamily  27.46 
 
 		 566 aa  96.7  8e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5947  Na+/solute symporter  26.22 
 
 		 509 aa  96.7  9e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1380  SSS sodium solute transporter superfamily  24.83 
 
 		 562 aa  95.5  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.366294 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0525  SSS sodium solute transporter superfamily  23.87 
 
 		 522 aa  95.1  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.692758  unclonable  0.0000000000137784 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12043  sodium iodide symporter  24.2 
 
 		 547 aa  94.4  4e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.48339  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2609  Na+/solute symporter  24.58 
 
 		 566 aa  92.8  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2384  SSS sodium solute transporter superfamily  23.34 
 
 		 530 aa  92.4  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3022  SSS sodium solute transporter superfamily  22.82 
 
 		 883 aa  92  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.61129  normal  0.844759 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1227  Na+/solute symporter  20.83 
 
 		 517 aa  91.7  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.212817  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03377  sodium:solute symporter family protein  22.17 
 
 		 523 aa  90.1  9e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2466  SSS sodium solute transporter superfamily  24.58 
 
 		 509 aa  89.7  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4963400000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0297  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.94 
 
 		 510 aa  88.2  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.977217  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0304  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.94 
 
 		 510 aa  88.2  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1223  sodium-glucose/galactose cotransporter  23.33 
 
 		 498 aa  84  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.532882 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1203  sodium-glucose/galactose cotransporter  23.33 
 
 		 498 aa  84  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.410205 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1238  sodium-glucose/galactose cotransporter  23.33 
 
 		 498 aa  84  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.425742 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1193  sodium-glucose/galactose cotransporter  23.33 
 
 		 498 aa  83.6  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0641857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00679  sodium/glucose cotransport protein  24.16 
 
 		 592 aa  82.8  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0305497  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  21.97 
 
 		 526 aa  82  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.495731  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0491  SSS sodium solute transporter superfamily  23.71 
 
 		 509 aa  80.1  0.00000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0375697  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2388  SSS sodium solute transporter superfamily  23.95 
 
 		 551 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3985  SSS sodium solute transporter superfamily  24.94 
 
 		 527 aa  78.2  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000567258  normal  0.756619 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2815  SSS sodium solute transporter superfamily  23.74 
 
 		 527 aa  77.8  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  23.9 
 
 		 523 aa  77.8  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3840  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.18 
 
 		 523 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.455986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1387  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  21.71 
 
 		 565 aa  75.5  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.108494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0043  Na+/solute symporter  24.82 
 
 		 565 aa  75.5  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6588  SSS sodium solute transporter superfamily  25.86 
 
 		 529 aa  73.2  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3906  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.93 
 
 		 533 aa  72  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2774  SSS sodium solute transporter superfamily  25.28 
 
 		 529 aa  70.9  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00224729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0416  sodium/solute symporter family protein  20.58 
 
 		 570 aa  70.1  0.00000000008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.951118  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3347  putative osmoregulated proline transporter  22.72 
 
 		 486 aa  69.3  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00234  putative sodium/hexose cotransport protein  22.08 
 
 		 520 aa  69.7  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.398389  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04060  SSS sodium solute transporter  26.89 
 
 		 565 aa  68.2  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2731  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.62 
 
 		 548 aa  66.6  0.0000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.8061 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0436  SSS sodium solute transporter superfamily  22.65 
 
 		 598 aa  66.6  0.0000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.153082 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0993  SSS sodium solute transporter superfamily  26.9 
 
 		 569 aa  66.2  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0554078  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.37 
 
 		 526 aa  65.1  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0990  SSS sodium solute transporter superfamily  27.73 
 
 		 560 aa  65.1  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4407  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.51 
 
 		 613 aa  65.1  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0343463  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0835  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.54 
 
 		 522 aa  64.3  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.172463  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2086  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.92 
 
 		 520 aa  64.3  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.275016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2286  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.77 
 
 		 519 aa  64.3  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1090  sodium/glucose cotransport protein  21.96 
 
 		 520 aa  63.9  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.133382 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0324  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.62 
 
 		 567 aa  63.9  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1285  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  20.49 
 
 		 522 aa  61.6  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1490  sodium/solute symporter family protein; sodium/proline symporter  23.52 
 
 		 516 aa  61.2  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0960795  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0871  Na+/solute symporter  22.04 
 
 		 482 aa  60.5  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.857902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3672  sodium/solute symporter family protein  23.11 
 
 		 516 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0653794  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1726  sodium/solute symporter family protein  22.74 
 
 		 516 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1518  sodium/solute symporter family protein  23.29 
 
 		 516 aa  59.3  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.782594  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1480  sodium/solute symporter family protein; sodium/proline symporter  23.29 
 
 		 516 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1777  sodium/solute symporter family protein  23.29 
 
 		 516 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.165855  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1635  sodium/solute symporter family protein  23.29 
 
 		 516 aa  59.3  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1672  sodium/solute symporter family protein  23.11 
 
 		 516 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.206426  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1330  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.14 
 
 		 516 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.892115  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.53 
 
 		 522 aa  59.3  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135189  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1703  sodium/solute symporter family protein  23.29 
 
 		 516 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2416  Na+/solute symporter  22.71 
 
 		 575 aa  59.3  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.664159  normal  0.731257 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0800  Na+/solute symporter  22.04 
 
 		 483 aa  59.7  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1074  SSS sodium solute transporter superfamily  23.33 
 
 		 520 aa  58.2  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.729495  normal  0.0148232 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.33 
 
 		 520 aa  57.8  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.736166  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1859  SSS sodium solute transporter superfamily  21.41 
 
 		 551 aa  58.2  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1523  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.88 
 
 		 516 aa  57.4  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.292925  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5240  Na+/solute symporter  21.7 
 
 		 460 aa  57.4  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1850  SSS sodium solute transporter superfamily  23.6 
 
 		 513 aa  57  0.0000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>