More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_03340 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_03340  predicted transcriptional regulator  100 
 
 		 190 aa  377  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0800  helix-turn-helix domain protein  74.6 
 
 		 192 aa  269  2e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.860069  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5814  transcriptional regulator, XRE family  69.89 
 
 		 193 aa  244  6.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0506  transcriptional regulator, XRE family  63.87 
 
 		 194 aa  227  7e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0504214  normal  0.112871 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1170  helix-turn-helix domain-containing protein  52.22 
 
 		 196 aa  176  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1889  transcriptional regulator, XRE family  52.22 
 
 		 198 aa  163  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal  0.734051 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2992  transcriptional regulator, XRE family  49.46 
 
 		 188 aa  155  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.537679  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3352  XRE family transcriptional regulator  42.7 
 
 		 193 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.236659 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3341  XRE family transcriptional regulator  42.7 
 
 		 193 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.272722  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3403  XRE family transcriptional regulator  42.7 
 
 		 193 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.234277 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04250  transcriptional regulator  47.73 
 
 		 186 aa  119  1.9999999999999998e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3652  XRE family transcriptional regulator  41.01 
 
 		 196 aa  118  6e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00533728 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3404  cupin 2 domain-containing protein  42.7 
 
 		 215 aa  118  6e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5086  putative transcriptional regulator, XRE family  43.72 
 
 		 192 aa  116  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4050  transcriptional regulator, XRE family  39.88 
 
 		 192 aa  116  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3617  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 195 aa  115  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5358  putative transcriptional regulator, XRE family  42.46 
 
 		 201 aa  113  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.406538  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0635  transcriptional regulator, XRE family  39.89 
 
 		 198 aa  112  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2893  XRE family transcriptional regulator  40.36 
 
 		 169 aa  112  5e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3407  transcriptional regulator, XRE family  40.11 
 
 		 192 aa  111  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8704  transcriptional regulator, XRE family  40.66 
 
 		 223 aa  110  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.264618 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1566  transcriptional regulator, XRE family  40.33 
 
 		 202 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0862847 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4623  putative transcriptional regulator, XRE family  42.78 
 
 		 197 aa  108  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155979 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2028  transcriptional regulator, XRE family  38.07 
 
 		 194 aa  107  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1719  transcriptional regulator, XRE family  42.07 
 
 		 204 aa  106  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.017651  normal  0.124941 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0428  transcriptional regulator, XRE family  39.55 
 
 		 197 aa  105  6e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1965  XRE family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 194 aa  105  6e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0249499  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02050  predicted transcriptional regulator  41.57 
 
 		 201 aa  104  8e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8701  transcriptional regulator, XRE family  40.22 
 
 		 200 aa  104  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7925  putative transcriptional regulator, XRE family  40.11 
 
 		 199 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2613  XRE family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 219 aa  102  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.629122 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4666  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 197 aa  102  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.223091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2365  transcriptional regulator, XRE family  41.4 
 
 		 193 aa  101  6e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.977725  normal  0.0272358 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1021  transcriptional regulator, XRE family  36 
 
 		 191 aa  100  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.438557  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2999  transcriptional regulator, XRE family  41.11 
 
 		 200 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290253  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4152  helix-turn-helix domain-containing protein  37.57 
 
 		 191 aa  98.2  6e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2429  XRE family transcriptional regulator  37.57 
 
 		 191 aa  97.4  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0848952 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3050  transcriptional regulator, XRE family  37.08 
 
 		 195 aa  96.7  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0215158  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3019  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 		 198 aa  95.5  4e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2592  transcriptional regulator, XRE family  41.9 
 
 		 210 aa  94  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1711  transcriptional regulator, XRE family  40.24 
 
 		 200 aa  93.2  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.63161  normal  0.919847 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5294  transcriptional regulator, XRE family  40.43 
 
 		 194 aa  91.7  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1667  XRE family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 214 aa  91.7  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2231  transcriptional regulator, XRE family  37.02 
 
 		 190 aa  87.4  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.268831  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3829  transcriptional regulator, XRE family  36.42 
 
 		 201 aa  86.7  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.440396  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1423  transcriptional regulator, XRE family  38.89 
 
 		 195 aa  82  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5722  putative transcriptional regulator  33.76 
 
 		 199 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2440  transcriptional regulator, XRE family  30.69 
 
 		 220 aa  65.5  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.086441  normal  0.12202 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2770  XRE family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 192 aa  65.1  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.169539 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3329  transcriptional regulator  34.64 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.855836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5414  XRE family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2913  XRE family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 199 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4867  XRE family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1558  cupin 2 domain-containing protein  26.28 
 
 		 180 aa  61.6  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3262  XRE family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 193 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0174683 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65950  putative transcriptional regulator  31.85 
 
 		 199 aa  61.2  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4506  XRE family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 189 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.690344  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2868  Cro/CI family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 199 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2821  XRE family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4931  transcriptional regulator, XRE family  30.98 
 
 		 187 aa  60.8  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1668  transcriptional regulator, XRE family  26.95 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1819  transcriptional regulator, XRE family  25.71 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0201582  normal  0.3413 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0114  XRE family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2995  transcriptional regulator  28.03 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0735878  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4357  transcriptional regulator, MerR family  29.55 
 
 		 269 aa  58.9  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00580847 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0888  transcriptional regulator, XRE family  27.04 
 
 		 179 aa  58.5  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118183  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4439  transcriptional regulator, XRE family  28.66 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0758  XRE family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1934  DNA-binding protein  29.19 
 
 		 179 aa  58.2  0.00000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4729  XRE family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  25.62 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5317  XRE family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221767  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5543  XRE family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.827143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0751  XRE family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 179 aa  57.8  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000101746  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1852  Cro/CI family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 642 aa  57.4  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1555  putative transcriptional regulator  30.86 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.602269  normal  0.341998 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1325  cupin 2 domain-containing protein  24.84 
 
 		 175 aa  57.8  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2505  XRE family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16550  predicted transcriptional regulator  30 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1446  transcriptional regulator, XRE family  27.39 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1457  transcriptional regulator  24.29 
 
 		 188 aa  57  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.96188e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0389  XRE family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.762812  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.12 
 
 		 189 aa  57  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2320  transcriptional regulator, XRE family  26.52 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2586  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.55 
 
 		 126 aa  57  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000628471  hitchhiker  0.000111842 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2904  DNA-binding protein  28.39 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0350  DNA-binding protein  28.39 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1723  DNA-binding protein  28.39 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0900931  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1254  DNA-binding protein  28.39 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0076  XRE family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 180 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.196991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1727  XRE family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170715  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1889  transcriptional regulator, XRE family  26.52 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6366  XRE family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0311191  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2222  DNA-binding protein  27.95 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4894  XRE family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 180 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0489002 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1712  XRE family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.526366  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3020  DNA-binding protein  28.39 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4613  XRE family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 180 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.101875  hitchhiker  0.00323798 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1533  DNA-binding protein  28.39 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>