More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_0011 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2573  amidohydrolase family protein  61.65 
 
 		 1071 aa  1362    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.186395  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0017  amidohydrolase  90.27 
 
 		 1049 aa  1994    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03499  amidohydrolase  49.95 
 
 		 1111 aa  1077    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0018  amidohydrolase  79.15 
 
 		 1081 aa  1790    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000272228 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0458  amidohydrolase  51.9 
 
 		 1138 aa  1144    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.455594 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0015  amidohydrolase  98.49 
 
 		 598 aa  1223    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0011  amidohydrolase  81.15 
 
 		 1065 aa  1822    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000114616  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0013  amidohydrolase  80.81 
 
 		 1067 aa  1812    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0015  amidohydrolase  98.78 
 
 		 1062 aa  2164    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000711997 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0015  amidohydrolase  78.22 
 
 		 1069 aa  1784    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000661642 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1098  amidohydrolase  46.27 
 
 		 1078 aa  1006    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0010  amidohydrolase  79.46 
 
 		 1066 aa  1790    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0016  WD40 domain-containing protein  98.18 
 
 		 445 aa  893    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0466  amidohydrolase  48.77 
 
 		 1113 aa  1045    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.83396  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1901  amidohydrolase  46.62 
 
 		 1084 aa  989    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0011  amidohydrolase  91.71 
 
 		 1062 aa  2044    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000193716 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0011  amidohydrolase  91.53 
 
 		 1062 aa  2041    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0957331 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0015  amidohydrolase  98.68 
 
 		 1062 aa  2167    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0180602 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0009  amidohydrolase  94.63 
 
 		 1062 aa  2095    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0009  amidohydrolase  80.6 
 
 		 1060 aa  1815    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0028  amidohydrolase  78.56 
 
 		 1062 aa  1769    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.847177  hitchhiker  0.00656795 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1680  amidohydrolase  46.03 
 
 		 1062 aa  1007    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.345185  normal  0.0835555 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0019  amidohydrolase  91.34 
 
 		 1062 aa  2039    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000934915 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0011  amidohydrolase  100 
 
 		 1062 aa  2193    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1803  amidohydrolase  28.68 
 
 		 1052 aa  379  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000234818 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  26.11 
 
 		 1005 aa  257  7e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19660  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  24.76 
 
 		 1059 aa  234  7.000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26793  hitchhiker  0.00572239 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2230  hypothetical protein  25.4 
 
 		 1042 aa  222  3e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.752909  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1774  amidohydrolase  25.82 
 
 		 1014 aa  219  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0234293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1717  amidohydrolase  25.05 
 
 		 1040 aa  219  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.654125  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1644  amidohydrolase  24.79 
 
 		 1042 aa  214  5.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0718903  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1775  amidohydrolase  23.82 
 
 		 1010 aa  181  9e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0563559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5049  amidohydrolase  23.8 
 
 		 1031 aa  171  8e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.424824  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5713  peptidase S41  27.55 
 
 		 1097 aa  105  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0183414 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3153  peptidase S41  25.36 
 
 		 1090 aa  102  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4155  transcriptional regulatory protein-like  23.23 
 
 		 717 aa  102  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.297616 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5176  amidohydrolase  25.23 
 
 		 686 aa  98.6  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.167618  normal  0.830849 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2310  peptidase S41  25.98 
 
 		 1067 aa  98.6  6e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2312  peptidase S41  24.7 
 
 		 1082 aa  96.7  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.481981  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0535  amidohydrolase family protein  22.84 
 
 		 672 aa  93.6  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  24.11 
 
 		 430 aa  90.9  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  25.85 
 
 		 433 aa  89  5e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0618  amidohydrolase  23.06 
 
 		 496 aa  87.8  9e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210154 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0926  peptidase S41  22.8 
 
 		 1075 aa  86.7  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2354  amidohydrolase  24.72 
 
 		 420 aa  85.9  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5294  peptidase S41  21.62 
 
 		 1167 aa  85.9  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2365  amidohydrolase  26.72 
 
 		 470 aa  85.1  0.000000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2750  peptidase S41  24.49 
 
 		 1076 aa  85.1  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.956539  normal  0.394913 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  24.76 
 
 		 407 aa  84.7  0.000000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0089  tricorn protease  23.8 
 
 		 1084 aa  84.7  0.000000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000582269  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4304  amidohydrolase  22.83 
 
 		 470 aa  83.6  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6483  peptidase S41  25.64 
 
 		 1125 aa  84  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  26.38 
 
 		 407 aa  83.2  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1790  amidohydrolase  25.12 
 
 		 440 aa  83.2  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  24.49 
 
 		 437 aa  82  0.00000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0136  WD40 domain protein beta Propeller  27.38 
 
 		 419 aa  81.6  0.00000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1105  amidohydrolase  22.48 
 
 		 478 aa  81.6  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.310318 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  25.3 
 
 		 413 aa  81.6  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  24.21 
 
 		 438 aa  80.9  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5623  WD40 domain protein beta Propeller  29.53 
 
 		 956 aa  80.1  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.101899 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3987  amidohydrolase  25.38 
 
 		 435 aa  80.5  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.589739 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2801  prolidase, putative  23.39 
 
 		 419 aa  79.7  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00617614  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  30.8 
 
 		 427 aa  79.7  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2416  amidohydrolase  24.1 
 
 		 702 aa  79.7  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0066037  normal  0.0385776 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  29.53 
 
 		 427 aa  79.3  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  31.69 
 
 		 432 aa  79.3  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4565  amidohydrolase  25.24 
 
 		 423 aa  79.3  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.244661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3741  amidohydrolase  25.06 
 
 		 413 aa  79  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2161  WD40 domain protein beta Propeller  26.37 
 
 		 440 aa  78.6  0.0000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000041437  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6416  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  28.51 
 
 		 362 aa  78.2  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1275  amidohydrolase  23.53 
 
 		 415 aa  78.2  0.0000000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00030  conserved hypothetical protein  24.39 
 
 		 443 aa  77.8  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.215737 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0303  translocation protein TolB  33.33 
 
 		 403 aa  77.4  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.307961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  25.3 
 
 		 413 aa  77.4  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1597  amidohydrolase  24.79 
 
 		 477 aa  77.8  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.080388  normal  0.526129 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4760  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  29.05 
 
 		 446 aa  77  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.577654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5302  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  29.52 
 
 		 446 aa  77  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.842711 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5227  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  29.05 
 
 		 446 aa  77  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.175544  normal  0.115662 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  31.79 
 
 		 426 aa  77  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1915  WD40 domain-containing protein  34.5 
 
 		 567 aa  76.6  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146751  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0857  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.83 
 
 		 670 aa  75.9  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  24.64 
 
 		 444 aa  75.9  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  24.04 
 
 		 459 aa  75.5  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0975  translocation protein TolB  30.9 
 
 		 445 aa  75.5  0.000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0670772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0144  translocation protein TolB  31.28 
 
 		 442 aa  74.7  0.000000000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1279  WD40 domain-containing protein  28.05 
 
 		 428 aa  74.7  0.000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2556  amidohydrolase  23.93 
 
 		 483 aa  74.7  0.000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3470  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  28.65 
 
 		 430 aa  74.7  0.000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0247936  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4129  WD40 domain-containing protein  28.77 
 
 		 572 aa  74.3  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000900599 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3323  WD40 domain-containing protein  33.71 
 
 		 435 aa  74.3  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000401957  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0275  translocation protein TolB  32.03 
 
 		 436 aa  73.6  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839364  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0590  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  23.13 
 
 		 590 aa  73.2  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2515  amidohydrolase  24.1 
 
 		 426 aa  73.6  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0859  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  25.81 
 
 		 296 aa  73.2  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4081  amidohydrolase  24.52 
 
 		 425 aa  72.8  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  24.37 
 
 		 433 aa  72.4  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2881  amidohydrolase  23.66 
 
 		 819 aa  72  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0566  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  27.01 
 
 		 428 aa  72  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.22163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  31.76 
 
 		 446 aa  72  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2932  amidohydrolase  22.41 
 
 		 431 aa  72  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>