118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A4656 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  28.61 
 
 		 4106 aa  740    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1051  hypothetical protein  31.16 
 
 		 4430 aa  959    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4606  large repetitive protein  99.66 
 
 		 5559 aa  11030    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4605  putative Ig domain family protein  98.42 
 
 		 5561 aa  10810    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4512  large repetitive protein  98.4 
 
 		 5561 aa  10810    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4520  putative Ig domain protein  97.5 
 
 		 5561 aa  10710    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4656  hypothetical protein  100 
 
 		 5559 aa  11070    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  28.78 
 
 		 6779 aa  614  1e-173  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  29.45 
 
 		 6662 aa  610  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.07 
 
 		 6683 aa  602  1e-170  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  28.23 
 
 		 7149 aa  561  1e-157  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6371  hypothetical protein  27.59 
 
 		 3736 aa  546  1e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6074  hypothetical protein  26.99 
 
 		 3734 aa  521  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4113  hypothetical protein  29.05 
 
 		 3562 aa  463  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0537133 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3017  VCBS repeat-containing protein  28.23 
 
 		 3739 aa  454  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1001  C-type lectin domain-containing protein  27.51 
 
 		 3325 aa  446  1e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2903  large repetitive protein  26.49 
 
 		 3721 aa  429  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2886  large repetitive protein  27.1 
 
 		 3824 aa  423  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.659132 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2835  VCBS repeat-containing protein  27.12 
 
 		 3824 aa  424  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  27.91 
 
 		 2704 aa  412  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2905  large repetitive protein  27 
 
 		 3824 aa  415  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2658  hypothetical protein  25.85 
 
 		 4689 aa  412  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3119  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.72 
 
 		 3552 aa  404  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0912825 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2063  type I secretion target repeat-containing protein  28.29 
 
 		 3204 aa  354  3e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0994  hypothetical protein  24.91 
 
 		 4874 aa  337  5e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1026  hypothetical protein  26.44 
 
 		 3516 aa  337  5e-90  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301497 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2201  cable pili-associated 22 kDa adhesin protein  28.7 
 
 		 2911 aa  335  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.266239  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  32.17 
 
 		 2927 aa  269  1e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3412  hypothetical protein  26.74 
 
 		 2625 aa  254  3e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40260  hypothetical protein  26.75 
 
 		 2456 aa  246  1e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.702086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0055  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  27.04 
 
 		 3314 aa  220  5.9999999999999996e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  26.77 
 
 		 4678 aa  209  1e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.63 
 
 		 5839 aa  196  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0899  large repetitive protein  25.57 
 
 		 5080 aa  185  2e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  27.32 
 
 		 5171 aa  169  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  27.68 
 
 		 5442 aa  159  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3642  putative outer membrane adhesin like protein  30.75 
 
 		 4791 aa  140  5e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0581  PKD domain protein  26 
 
 		 1461 aa  140  8e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0845  hypothetical protein  23.8 
 
 		 5451 aa  138  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0927  phosphoesterase, PA-phosphatase related  27.54 
 
 		 5216 aa  136  1.0000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3027  hypothetical protein  31.89 
 
 		 1278 aa  130  6e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  26.27 
 
 		 2552 aa  130  9e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4380  hypothetical protein  24.84 
 
 		 3923 aa  127  7e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0806  surface adhesion protein, putative  25.19 
 
 		 6310 aa  117  6e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0783  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.34 
 
 		 3323 aa  115  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0830  glycoprotein  24.71 
 
 		 8064 aa  114  6e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.51381 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  34 
 
 		 2768 aa  96.7  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2848  hemagglutinin/hemolysin-related protein  25.03 
 
 		 4480 aa  94  8e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1696  amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  32.54 
 
 		 1586 aa  87.8  0.000000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4515  APHP domain-containing protein  24.13 
 
 		 5743 aa  88.2  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33430  Ig-like domain-containing protein  25.73 
 
 		 3230 aa  85.9  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3383  conserved repeat domain protein  24.59 
 
 		 888 aa  85.5  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.466034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3420  cellulase  28.83 
 
 		 635 aa  84.3  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.342079 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2451  Fibronectin type III domain protein  25.04 
 
 		 1219 aa  83.2  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1066  hypothetical protein  29.04 
 
 		 744 aa  80.1  0.000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000592577  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0068  fibronectin, type III domain-containing protein  23.8 
 
 		 1695 aa  79.3  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3150  hypothetical protein  31.6 
 
 		 959 aa  79  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2392  cell wall associated biofilm protein  26.16 
 
 		 2402 aa  78.2  0.000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  26.63 
 
 		 1152 aa  77.4  0.000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3258  putative outer membrane adhesin like protein  25.88 
 
 		 4214 aa  76.6  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.523735 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01400  RTX toxin, putative  32.51 
 
 		 606 aa  75.5  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4208  autotransporter adhesin  28.29 
 
 		 3333 aa  74.7  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3066  hypothetical protein  25 
 
 		 3925 aa  74.3  0.00000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.455665 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2208  beta strand repeat-containing protein  33.97 
 
 		 1869 aa  72.8  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.848116  normal  0.0253068 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3132  hypothetical protein  26.19 
 
 		 739 aa  70.5  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.756366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3022  hypothetical protein  25.36 
 
 		 3586 aa  69.7  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0779  periplasmic copper-binding protein  23.58 
 
 		 1332 aa  68.2  0.000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195346  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0510  putative outer membrane adhesin like proteiin  23.43 
 
 		 2812 aa  65.9  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  28.44 
 
 		 2839 aa  65.9  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0379  VCBS  27.99 
 
 		 7284 aa  65.5  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.943155 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1029  hemolysin-type calcium-binding region  30.19 
 
 		 1529 aa  65.5  0.00000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.297534 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0553  hypothetical protein  25.98 
 
 		 500 aa  65.5  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1601  hypothetical protein  26.57 
 
 		 6715 aa  62  0.0000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4251  Ig family protein  27.56 
 
 		 2802 aa  62.4  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.676511 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0968  cell wall-associated serine proteinase, lactocepin precursor  22.96 
 
 		 1570 aa  61.2  0.0000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3430  hypothetical protein  24.59 
 
 		 913 aa  61.2  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.836468  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1945  fibronectin type III domain-containing protein  26.81 
 
 		 1047 aa  60.5  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.771273  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1123  cell wall-associated serine proteinase  23.23 
 
 		 1570 aa  60.1  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.677567  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0496  NHL repeat-containing protein  23.35 
 
 		 937 aa  59.3  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0531  hypothetical protein  25.68 
 
 		 850 aa  58.9  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.744468  normal  0.643161 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2849  RTX toxin-like protein  27.97 
 
 		 1092 aa  58.5  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  29.2 
 
 		 1919 aa  57.8  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0628  hypothetical protein  23.55 
 
 		 1457 aa  56.6  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.80698 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1242  hypothetical protein  27.45 
 
 		 549 aa  55.5  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.74975e-30 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  29.95 
 
 		 1597 aa  55.1  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2157  fibronectin, type III domain-containing protein  27.07 
 
 		 1141 aa  54.7  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.445714  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2987  Fibronectin type III domain protein  27.19 
 
 		 1301 aa  54.3  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0839301 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2325  YD repeat-containing protein  22.89 
 
 		 6109 aa  53.9  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0257646 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1799  Fibronectin type III domain protein  25.28 
 
 		 1096 aa  53.5  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0877  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  35 
 
 		 3822 aa  53.5  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0168834 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1672  beta strand repeat-containing protein  29.82 
 
 		 3391 aa  52.4  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848841 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1057  putative DNA methylase  27.32 
 
 		 1787 aa  53.1  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.574551  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2430  VBCS repeat-containing protein  28.8 
 
 		 3758 aa  52  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4328  cadherin domain-containing protein  24.04 
 
 		 2193 aa  52  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.859375  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0593  lipoprotein (VmcD)  29.12 
 
 		 309 aa  52  0.0003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0783  outer membrane adhesin like proteiin  29.58 
 
 		 4748 aa  52.4  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0292  fibronectin type III domain-containing protein  25.38 
 
 		 916 aa  51.6  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.525273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0642  hypothetical protein  23.08 
 
 		 653 aa  52  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000417022  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2328  fibronectin, type III domain-containing protein  27.7 
 
 		 675 aa  51.6  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000140812  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2688  peptidoglycan-binding LysM  27.56 
 
 		 361 aa  51.6  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00047104  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>