More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1487 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1487  Beta-glucosidase  100 
 
 		 893 aa  1845    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00296047  normal  0.272235 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3246  Beta-glucosidase  41.69 
 
 		 881 aa  643    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.190497  normal  0.145992 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03856  glucan 1,4-beta-glucosidase  44.61 
 
 		 904 aa  701    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3883  glycoside hydrolase family 3 protein  43.01 
 
 		 875 aa  650    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.128454  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1929  Beta-glucosidase  42.79 
 
 		 882 aa  611  1e-173  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01638  glucan 1,4-beta-glucosidase  41.89 
 
 		 889 aa  609  1e-173  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2005  Beta-glucosidase  42.36 
 
 		 882 aa  608  9.999999999999999e-173  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.346494  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3874  Beta-glucosidase  39.68 
 
 		 864 aa  579  1e-164  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.20174  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2404  Beta-glucosidase  40.85 
 
 		 898 aa  570  1e-161  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.27509 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2419  Beta-glucosidase  42.13 
 
 		 849 aa  568  1e-160  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.326586  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2378  Beta-glucosidase  46.02 
 
 		 902 aa  440  9.999999999999999e-123  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0896649  normal  0.197642 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0203  glycoside hydrolase family 3 domain protein  52.96 
 
 		 712 aa  430  1e-119  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3009  glycoside hydrolase family 3 protein  49.65 
 
 		 717 aa  404  1e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.414212  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0825  Beta-glucosidase  50 
 
 		 733 aa  405  1e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000149252  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3219  Beta-glucosidase  48.1 
 
 		 905 aa  391  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.181827  normal  0.334225 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2042  glycoside hydrolase family 3 protein  32.82 
 
 		 886 aa  382  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.198368  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1217  glycoside hydrolase family 3 protein  33 
 
 		 966 aa  382  1e-104  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000342609  normal  0.287325 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0321  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.09 
 
 		 927 aa  363  8e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4152  glycoside hydrolase family protein  29.21 
 
 		 831 aa  310  6.999999999999999e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.198899  normal  0.318604 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0919  glycoside hydrolase family 3 protein  29.19 
 
 		 914 aa  284  4.0000000000000003e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3480  glycoside hydrolase family 3 protein  29.33 
 
 		 915 aa  284  5.000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409586 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2674  ribosome-binding factor A  28.12 
 
 		 866 aa  278  3e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3035  glycoside hydrolase family protein  29.24 
 
 		 913 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115679  normal  0.109477 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08401  beta-1,4-xylosidase (Eurofung)  38.85 
 
 		 763 aa  267  5e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1691  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.46 
 
 		 814 aa  267  5.999999999999999e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1770  Beta-glucosidase  28.81 
 
 		 949 aa  266  1e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.611938 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3170  glycosyl hydrolase, family 3  28.27 
 
 		 897 aa  260  7e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.541746  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2185  Beta-glucosidase  28.08 
 
 		 884 aa  257  7e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41452  beta-glucosidase  28.12 
 
 		 851 aa  255  3e-66  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00712  Beta-glucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BFG8]  27.14 
 
 		 845 aa  254  4.0000000000000004e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.480043  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2379  glycosy hydrolase family protein  28.12 
 
 		 870 aa  254  5.000000000000001e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2412  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  40.09 
 
 		 988 aa  253  1e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4883  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.06 
 
 		 1212 aa  253  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0885799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6257  hypothetical protein  28.06 
 
 		 823 aa  253  1e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.234906  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4325  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.05 
 
 		 1343 aa  253  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.107286 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1781  Beta-glucosidase  28.16 
 
 		 906 aa  248  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.104106 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1307  Beta-glucosidase  27.21 
 
 		 887 aa  247  8e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51227  beta-glucosidase  27.66 
 
 		 843 aa  246  9.999999999999999e-64  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4651  Beta-glucosidase  32.86 
 
 		 1548 aa  246  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  unclonable  0.00279613  normal  0.760952 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1195  Beta-glucosidase  37.56 
 
 		 874 aa  244  6e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02359  Beta-xylosidase (EC 3.2.1.37) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O42810]  36.03 
 
 		 803 aa  241  2.9999999999999997e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3058  Beta-glucosidase  28.03 
 
 		 857 aa  242  2.9999999999999997e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.44664  normal  0.0198614 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3692  glycosy hydrolase family protein  27.55 
 
 		 832 aa  241  6.999999999999999e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1607  exo-1,4-beta-glucosidase  39.47 
 
 		 928 aa  239  1e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.124023  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1295  glucan 1,4-beta-glucosidase  39.95 
 
 		 923 aa  240  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3318  beta-glucosidase  29.03 
 
 		 913 aa  238  3e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00176622  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3694  glycosyl hydrolase, family 3  28.66 
 
 		 772 aa  238  3e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.923315  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3153  Beta-glucosidase  28.89 
 
 		 913 aa  238  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.139372  normal  0.15667 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4787  glycoside hydrolase family 3 domain protein  25.66 
 
 		 820 aa  237  7e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5221  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.09 
 
 		 1357 aa  237  9e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0332695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3329  glycoside hydrolase family 3 protein  37.26 
 
 		 972 aa  235  2.0000000000000002e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0852  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.78 
 
 		 762 aa  233  2e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0847818  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2406  beta-glucosidase  38.68 
 
 		 934 aa  231  6e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0871  glycoside hydrolase family 3 protein  34.47 
 
 		 778 aa  228  5.0000000000000005e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34123  beta-glucosidase  26.62 
 
 		 843 aa  226  2e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0475476 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3351  glycoside hydrolase family 3 protein  35.48 
 
 		 747 aa  223  9e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0596976  normal  0.962652 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0848  glycoside hydrolase family 3 protein  34.32 
 
 		 778 aa  223  9e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1723  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.83 
 
 		 756 aa  221  7e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000651092  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2069  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.54 
 
 		 839 aa  220  1e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1318  Beta-glucosidase  38.68 
 
 		 952 aa  219  1e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1080  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.23 
 
 		 792 aa  218  4e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.353054  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3730  glycoside hydrolase family protein  32.72 
 
 		 805 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414697  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_65767  beta-glucosidase  25.47 
 
 		 839 aa  214  3.9999999999999995e-54  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.893568 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2168  Beta-glucosidase  37.66 
 
 		 875 aa  213  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.917508  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0502  glycoside hydrolase family 3 protein  35.22 
 
 		 772 aa  211  6e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35668  beta-xylosidase  33.49 
 
 		 682 aa  210  8e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.12421  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0229  glycoside hydrolase family 3 protein  38.72 
 
 		 777 aa  209  1e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4330  glycoside hydrolase family 3 protein  26.98 
 
 		 836 aa  207  8e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.248566 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07865  beta-glucosidase (Eurofung)  26.75 
 
 		 850 aa  207  1e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.533103  normal  0.802716 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1081  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.48 
 
 		 784 aa  207  1e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000550104  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02227  Putative beta-glucosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFU7]  25.67 
 
 		 833 aa  205  3e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0629653 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5566  Beta-glucosidase  34.37 
 
 		 999 aa  204  5e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.441417 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.82 
 
 		 795 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10070  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  35.25 
 
 		 974 aa  201  3.9999999999999996e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_1541  beta-glucosidase  25.74 
 
 		 738 aa  196  1e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.36185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61725  beta-glucosidase  25.74 
 
 		 738 aa  196  1e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.614554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1659  Beta-glucosidase  26.65 
 
 		 897 aa  196  2e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.287347  normal  0.593766 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2630  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.62 
 
 		 782 aa  196  2e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03740  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  31.01 
 
 		 765 aa  196  2e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.653977 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1375  glycoside hydrolase family 3 protein  35.04 
 
 		 859 aa  195  3e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0866514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0260  Beta-glucosidase  26.15 
 
 		 832 aa  193  1e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0408  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.5 
 
 		 972 aa  192  2e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.840508  normal  0.121767 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0323  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.1 
 
 		 807 aa  191  5e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000125133  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2354  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.39 
 
 		 771 aa  191  5.999999999999999e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4940  Beta-glucosidase  37.3 
 
 		 811 aa  190  9e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0446999  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02612  Putative beta-glucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BA18]  24.22 
 
 		 838 aa  189  1e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.314197 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0447  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.24 
 
 		 734 aa  189  3e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1832  glycoside hydrolase family 3 protein  34.95 
 
 		 808 aa  188  5e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0261035 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2531  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.38 
 
 		 902 aa  188  5e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0942  glycoside hydrolase family 3 protein  30.89 
 
 		 802 aa  187  6e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1607  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.99 
 
 		 760 aa  186  1.0000000000000001e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0867  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.1 
 
 		 783 aa  186  2.0000000000000003e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1297  glycoside hydrolase family protein  33.88 
 
 		 763 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00926582  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3049  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.57 
 
 		 809 aa  185  4.0000000000000006e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.340429  normal  0.82066 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3292  glycoside hydrolase family 3 protein  33.61 
 
 		 1037 aa  184  9.000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3248  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  35.69 
 
 		 769 aa  183  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00760548  normal  0.0240048 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2280  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.42 
 
 		 799 aa  183  1e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208598 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4677  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.75 
 
 		 824 aa  182  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0104486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1089  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  25.95 
 
 		 818 aa  182  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.946532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0198  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.23 
 
 		 749 aa  181  4.999999999999999e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>