More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0308 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0308  ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 237 aa  487  1e-137  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0332817 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2119  ABC transporter, ATP-binding protein  73.36 
 
 		 241 aa  350  8e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0080  ABC transporter related  65.49 
 
 		 235 aa  328  4e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.348241  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0095  ABC transporter related  64.73 
 
 		 235 aa  325  4.0000000000000003e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0367  ABC transporter, ATPase subunit  64 
 
 		 240 aa  317  7.999999999999999e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.810917 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1900  ABC transporter related  65.18 
 
 		 234 aa  306  2.0000000000000002e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0775  ABC transporter, ATP-binding protein  62.22 
 
 		 243 aa  276  3e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0685  ABC transporter, ATP-binding protein  55.71 
 
 		 219 aa  257  1e-67  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246956 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2864  ABC transporter related  53.88 
 
 		 230 aa  256  3e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4072  ABC transporter related  52.97 
 
 		 253 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0898  ABC transporter related  50.87 
 
 		 232 aa  252  4.0000000000000004e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4589  ABC transporter related protein  53.81 
 
 		 225 aa  251  5.000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00504379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1019  ABC transporter related  52.05 
 
 		 247 aa  251  6e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1031  ABC transporter related  52.05 
 
 		 246 aa  251  6e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0998  ABC transporter related  52.05 
 
 		 247 aa  251  6e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3341  ABC transporter related  52.05 
 
 		 247 aa  251  7e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4838  ABC transporter related  55.86 
 
 		 225 aa  251  8.000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4416  ABC transporter, ATP-binding protein  52.25 
 
 		 244 aa  250  1e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2991  ABC transporter related  52.05 
 
 		 246 aa  250  1e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3722  ABC transporter related  52.51 
 
 		 263 aa  249  2e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.323053 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0863  ABC transporter related  50 
 
 		 246 aa  249  2e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3159  ABC transporter related  50 
 
 		 246 aa  249  2e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3260  ABC transporter related  50 
 
 		 246 aa  249  2e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2350  ABC transporter related protein  54.84 
 
 		 220 aa  249  3e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575927  normal  0.731614 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2850  ABC transporter related  51.14 
 
 		 240 aa  248  6e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3501  ABC transporter related  49.09 
 
 		 241 aa  248  8e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.667044 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3506  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 238 aa  247  1e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.172031  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0956  ABC transporter related  52.02 
 
 		 229 aa  246  2e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0723  ABC transporter-related protein  52.05 
 
 		 240 aa  246  3e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3364  ABC transporter related  51.6 
 
 		 243 aa  245  4.9999999999999997e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3692  ABC transporter, ATP-binding protein  50.23 
 
 		 246 aa  244  8e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5611  ABC transporter related  52.07 
 
 		 220 aa  244  9e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1330  ABC transporter related  50.64 
 
 		 235 aa  241  6e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.514657  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4701  ABC transporter, ATP-binding protein  50.22 
 
 		 230 aa  241  1e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.91334  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2239  ABC transporter related  48.64 
 
 		 233 aa  240  1e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0573  ABC transporter, ATP-binding protein  46.93 
 
 		 253 aa  239  4e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0471  ABC transporter related  52.7 
 
 		 236 aa  238  4e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2406  ABC transporter related  48.18 
 
 		 247 aa  238  5.999999999999999e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2600  ABC transporter related  52.27 
 
 		 227 aa  236  2e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0329  putative ABC transport system, ATP-binding protein  49.78 
 
 		 226 aa  236  2e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.292409 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  49.78 
 
 		 225 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  49.33 
 
 		 237 aa  231  8.000000000000001e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  47.35 
 
 		 238 aa  229  2e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1360  ABC transporter, ATP-binding protein  51.12 
 
 		 236 aa  229  2e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00540247  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  47.11 
 
 		 237 aa  229  2e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4175  ABC transporter related  45.11 
 
 		 237 aa  229  4e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  49.78 
 
 		 225 aa  227  1e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  49.33 
 
 		 238 aa  227  1e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  47.37 
 
 		 246 aa  227  1e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10580  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  47.51 
 
 		 258 aa  226  2e-58  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  50.22 
 
 		 230 aa  226  3e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  49.55 
 
 		 242 aa  226  3e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  48.03 
 
 		 248 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0199  ABC transporter related  48.46 
 
 		 291 aa  223  2e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.500002  normal  0.26855 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6963  ABC transporter related  48.03 
 
 		 291 aa  222  4e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0488455  normal  0.63897 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0951  ABC transporter related  48.66 
 
 		 234 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0337  ATPase  48.23 
 
 		 657 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2025  ABC transporter related  47.98 
 
 		 241 aa  219  1.9999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000164483 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  48.44 
 
 		 232 aa  219  3e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1484  ABC transporter related  48.02 
 
 		 236 aa  219  3e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2850  hypothetical protein  48.46 
 
 		 229 aa  219  3.9999999999999997e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  48 
 
 		 653 aa  218  5e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0282  ABC transporter, ATP-binding protein  48.85 
 
 		 223 aa  218  6e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3865  hypothetical protein  46.67 
 
 		 233 aa  218  7e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255505  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  47.11 
 
 		 233 aa  218  7.999999999999999e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  48.21 
 
 		 239 aa  218  7.999999999999999e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2990  hypothetical protein  48.23 
 
 		 229 aa  217  1e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1296  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  47.37 
 
 		 647 aa  217  1e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  48.43 
 
 		 226 aa  216  2e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  46.88 
 
 		 228 aa  217  2e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  47.35 
 
 		 253 aa  216  2e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0988  ATPase  47.77 
 
 		 233 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1638  ABC transporter related  47.53 
 
 		 244 aa  216  2.9999999999999998e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  47.35 
 
 		 253 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1083  ABC transporter related  45.58 
 
 		 240 aa  215  4e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  46.26 
 
 		 230 aa  215  5e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0798  ABC transporter ATP-binding protein  49.1 
 
 		 224 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  47.46 
 
 		 247 aa  214  5.9999999999999996e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  48.65 
 
 		 224 aa  214  8e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  44.44 
 
 		 228 aa  214  8e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  48.65 
 
 		 224 aa  214  8e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1813  ABC transporter related  46.43 
 
 		 236 aa  214  8e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2202  ABC transporter related protein  46.64 
 
 		 241 aa  214  8e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.87291  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3020  ABC transporter related  47.09 
 
 		 233 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0897255  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0708  ABC transporter ATP-binding protein  48.65 
 
 		 224 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0694  ABC transporter ATP-binding protein  48.65 
 
 		 224 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0893  ABC transporter, ATP-binding protein  48.65 
 
 		 224 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.34457e-37 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  48.65 
 
 		 224 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  48.2 
 
 		 224 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4286  ABC transporter-related protein  45.81 
 
 		 241 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3710  ABC transporter foramino acid ATP-binding protein  47.35 
 
 		 229 aa  212  2.9999999999999995e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  48.66 
 
 		 226 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2478  ABC transporter ATP-binding protein  47.03 
 
 		 222 aa  212  2.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.866087  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  48.2 
 
 		 224 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0386  ABC transporter related  45.85 
 
 		 248 aa  213  2.9999999999999995e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1667  ABC transporter related  47.35 
 
 		 228 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  43.42 
 
 		 242 aa  212  3.9999999999999995e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3004  ABC transporter ATP-binding protein  47.03 
 
 		 222 aa  212  3.9999999999999995e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000190264  hitchhiker  0.00000432285 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2576  ABC transporter related  47.03 
 
 		 222 aa  212  3.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  48.21 
 
 		 226 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>