86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_3796 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_3796  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 283 aa  583  1e-166  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.814508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1802  extracellular solute-binding protein  67.97 
 
 		 261 aa  339  2e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.202097  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3409  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.27 
 
 		 2654 aa  205  6e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0117  amino acid ABC transporter periplasmic protein  39.55 
 
 		 254 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1924  hypothetical protein  29.33 
 
 		 248 aa  100  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2960  extracellular solute-binding protein  29.44 
 
 		 262 aa  93.6  4e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.374689  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0325  extracellular solute-binding protein  34.69 
 
 		 256 aa  85.9  7e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2131  extracellular solute-binding protein  29.5 
 
 		 265 aa  82.4  0.000000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1508  extracellular solute-binding protein  27.5 
 
 		 257 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.118262  normal  0.888378 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3858  hypothetical protein  23.23 
 
 		 257 aa  79  0.00000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0260  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  23.17 
 
 		 243 aa  77  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.906193  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0537  hypothetical protein  23.25 
 
 		 263 aa  75.9  0.0000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0461  hypothetical protein  22.44 
 
 		 257 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0485  hypothetical protein  22.44 
 
 		 257 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0482  hypothetical protein  22.05 
 
 		 258 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2202  amino acid ABC transporter periplasmic protein  28.43 
 
 		 265 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3734  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 247 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2540  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 265 aa  63.9  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0477  extracellular solute-binding protein  31.15 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0823  extracellular solute-binding protein  29.17 
 
 		 270 aa  53.9  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.457883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0776  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  22.96 
 
 		 270 aa  53.5  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.616971 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0716  extracellular solute-binding protein  26.58 
 
 		 272 aa  52.8  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3293  amino acid ABC transporter periplasmic protein  23.86 
 
 		 263 aa  52  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000280664 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0387  extracellular solute-binding protein family 3  29.13 
 
 		 259 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0965219 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2369  extracellular solute-binding protein  21.76 
 
 		 256 aa  50.8  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1602  extracellular solute-binding protein  26.83 
 
 		 258 aa  50.4  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.986261 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3807  extracellular solute-binding protein  25.7 
 
 		 255 aa  50.4  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0339434  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6445  extracellular solute-binding protein family 3  24.04 
 
 		 275 aa  50.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0216332 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5967  ABC-type amino acid transport/signal transduction periplasmic protein  23.19 
 
 		 275 aa  50.1  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.594037  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0232  extracellular solute-binding protein  22.94 
 
 		 248 aa  49.7  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0247  extracellular solute-binding protein  30.53 
 
 		 258 aa  49.7  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000342463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0486  extracellular solute-binding protein  24 
 
 		 262 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1461  extracellular solute-binding protein  26.4 
 
 		 251 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.617285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1148  extracellular solute-binding protein  24.53 
 
 		 283 aa  48.5  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11740  hypothetical protein  27.94 
 
 		 297 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.22588  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4955  hypothetical protein  23.74 
 
 		 245 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3453  hypothetical protein  26.16 
 
 		 281 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1047  hypothetical protein  26.62 
 
 		 258 aa  48.1  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4828  extracellular solute-binding protein  23.62 
 
 		 232 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.425372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0513  extracellular solute-binding protein  23.18 
 
 		 251 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6014  extracellular solute-binding protein  21.05 
 
 		 258 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.794278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4027  extracellular solute-binding protein  21.05 
 
 		 258 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0596  hypothetical protein  25.65 
 
 		 282 aa  47.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5028  extracellular solute-binding protein  25.76 
 
 		 262 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4339  extracellular solute-binding protein  21.05 
 
 		 258 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2062  glutamine-binding periplasmic protein of glutamine ABC transporter  26 
 
 		 502 aa  47  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2350  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter amino acid-binding protein/permease  26 
 
 		 502 aa  47  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.140877  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0131  glutamine transport system substrate-binding protein  21.67 
 
 		 285 aa  47.4  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.210199  normal  0.0525108 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1094  hypothetical protein  31.37 
 
 		 244 aa  47  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.396494 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2470  solute-binding family 1 protein  24 
 
 		 245 aa  47  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.162983  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3629  hypothetical protein  26.32 
 
 		 281 aa  47.4  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1011  hypothetical protein  22.11 
 
 		 248 aa  47  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0510  extracellular solute-binding protein  26.19 
 
 		 245 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3410  amino acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  22.32 
 
 		 255 aa  46.6  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3985  hypothetical protein  22.9 
 
 		 262 aa  47  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.817581 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5010  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  22.44 
 
 		 251 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0497  hypothetical protein  26.32 
 
 		 281 aa  46.6  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.664537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0187  extracellular solute-binding protein  23.5 
 
 		 253 aa  47  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.056665 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2053  extracellular solute-binding protein family 3  22.35 
 
 		 271 aa  46.2  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1500  ABC polar amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  22.37 
 
 		 270 aa  45.8  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.238692  normal  0.502241 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1085  hypothetical protein  24.12 
 
 		 264 aa  45.8  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0391886  normal  0.830979 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1151  hypothetical protein  24.12 
 
 		 264 aa  45.8  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000453875  normal  0.246745 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4637  extracellular solute-binding protein family 3  23.29 
 
 		 275 aa  45.8  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350827  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4979  periplasmic binding protein, putative  24.24 
 
 		 262 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5578  extracellular solute-binding protein family 3  25.44 
 
 		 294 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2745  extracellular solute-binding protein family 3  21.92 
 
 		 254 aa  45.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2352  extracellular solute-binding protein family 3  23 
 
 		 275 aa  44.3  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.9341599999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3508  amino acid ABC transporter  21.46 
 
 		 250 aa  44.3  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3312  hypothetical protein  22.5 
 
 		 264 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000132852  normal  0.0735869 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3169  hypothetical protein  22.5 
 
 		 264 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000178583  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3442  extracellular solute-binding protein  22.17 
 
 		 285 aa  43.9  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1566  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  22.34 
 
 		 1047 aa  43.9  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1202  extracellular solute-binding protein family 3  22.5 
 
 		 264 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000133475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.25 
 
 		 1165 aa  43.9  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3168  hypothetical protein  22.5 
 
 		 264 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000679304  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4985  cystine transporter subunit  21.46 
 
 		 264 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.916643 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3547  extracellular solute-binding protein  26.47 
 
 		 263 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.171423  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1848  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  24.06 
 
 		 513 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1028  extracellular solute-binding protein  22.37 
 
 		 250 aa  43.1  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.729894 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0127  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.22 
 
 		 272 aa  43.1  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1440  extracellular solute-binding protein  22.37 
 
 		 273 aa  43.1  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.506156  normal  0.1259 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3545  solute-binding family 3 protein  26.96 
 
 		 263 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5004  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.4 
 
 		 245 aa  42.7  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.828614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5282  extracellular solute-binding protein  25.19 
 
 		 270 aa  42.7  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4852  extracellular solute-binding protein  22.73 
 
 		 262 aa  42.7  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157097  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2096  ABC transporter substrate-binding protein  24.15 
 
 		 273 aa  42  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>