More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_4027 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_6014  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
258 aa  523  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.794278  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4027  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
258 aa  523  1e-148  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4339  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
258 aa  523  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2369  extracellular solute-binding protein  84.05 
 
 
256 aa  431  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2745  extracellular solute-binding protein family 3  72.48 
 
 
254 aa  381  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1500  ABC polar amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  72.87 
 
 
270 aa  382  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.238692  normal  0.502241 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5575  extracellular solute-binding protein  72.09 
 
 
254 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.141446  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3410  amino acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  66.67 
 
 
255 aa  325  5e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0232  extracellular solute-binding protein  51.85 
 
 
248 aa  259  2e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0360  extracellular solute-binding protein  55.84 
 
 
276 aa  256  4e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.974296  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2392  extracellular solute-binding protein family 3  51.25 
 
 
255 aa  255  6e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3587  extracellular solute-binding protein  54.26 
 
 
255 aa  244  8e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.100685 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0187  extracellular solute-binding protein  48.51 
 
 
253 aa  235  5.0000000000000005e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.056665 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1028  extracellular solute-binding protein  45.42 
 
 
250 aa  229  2e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.729894 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1440  extracellular solute-binding protein  45.02 
 
 
273 aa  225  5.0000000000000005e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.506156  normal  0.1259 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4839  extracellular solute-binding protein  40.91 
 
 
250 aa  201  8e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000733894  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0776  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  43.31 
 
 
270 aa  198  7e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.616971 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0854  extracellular solute-binding protein family 3  31.03 
 
 
251 aa  133  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0178983  normal  0.218059 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0589  extracellular solute-binding protein family 3  32.07 
 
 
247 aa  125  7e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0251025  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0588  extracellular solute-binding protein family 3  27.38 
 
 
247 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00341778  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3298  extracellular solute-binding protein  31.15 
 
 
254 aa  105  5e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0727  extracellular solute-binding protein  34.65 
 
 
264 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114827  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1070  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  30.74 
 
 
263 aa  101  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.623597  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  30.97 
 
 
257 aa  100  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2357  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.63 
 
 
253 aa  98.2  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1495  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30.71 
 
 
247 aa  96.7  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000566563  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1487  glutamine ABC transporter periplasmic protein  29.63 
 
 
250 aa  96.7  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3158  glutamine ABC transporter periplasmic protein  29.63 
 
 
250 aa  96.7  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0137955  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1126  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 
284 aa  96.7  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2878  glutamine ABC transporter periplasmic protein  29.44 
 
 
248 aa  96.7  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0116852  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0959  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtJ  31.82 
 
 
243 aa  95.9  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0991  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtJ  31.82 
 
 
243 aa  95.9  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1022  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtJ  31.82 
 
 
243 aa  95.9  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.186752  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0924  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  31.82 
 
 
243 aa  95.9  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0338236  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1041  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtJ  31.82 
 
 
243 aa  95.9  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.385191  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0771  extracellular solute-binding protein  29.15 
 
 
264 aa  95.9  6e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000484393  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3045  extracellular solute-binding protein  30.95 
 
 
252 aa  95.5  7e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.29813  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0925  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30.29 
 
 
248 aa  95.5  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0376492  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1584  glutamine ABC transporter periplasmic protein  29 
 
 
248 aa  95.5  8e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.118123  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0957  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30.29 
 
 
248 aa  95.1  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0849319  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0866  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30.29 
 
 
248 aa  95.1  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.717155  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0978  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30.29 
 
 
248 aa  95.1  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0375425  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0894  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30.29 
 
 
248 aa  95.1  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.379869  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0434  arginine-binding periplasmic protein 1  32.56 
 
 
246 aa  95.1  1e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3272  glutamine ABC transporter periplasmic protein  29.22 
 
 
250 aa  95.1  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1466  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein/permease protein  32.05 
 
 
727 aa  94  2e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2391  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.4 
 
 
250 aa  94  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2098  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.4 
 
 
250 aa  94  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.230871  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1406  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.4 
 
 
250 aa  94  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.584446  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0433  extracellular solute-binding protein  29.52 
 
 
266 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0980273  hitchhiker  0.00000000179971 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2649  extracellular solute-binding protein  29.96 
 
 
266 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0458  extracellular solute-binding protein  29.96 
 
 
266 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.357598  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1126  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.4 
 
 
250 aa  94  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1869  extracellular solute-binding protein family 3  30.04 
 
 
272 aa  93.6  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000802311  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00778  glutamine ABC transporter periplasmic protein  29.05 
 
 
248 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00795  hypothetical protein  29.05 
 
 
248 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2831  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  29.05 
 
 
248 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0546212  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0960  glutamine ABC transporter periplasmic protein  29.05 
 
 
248 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000163371  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0880  glutamine ABC transporter periplasmic protein  29.05 
 
 
248 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000245333  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3548  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  29.52 
 
 
266 aa  93.2  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.233102 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0835  glutamine ABC transporter periplasmic protein  29.05 
 
 
248 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000431676  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0867  glutamine ABC transporter periplasmic protein  29.05 
 
 
248 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000156347  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1232  arginine-binding periplasmic protein 1  31.3 
 
 
242 aa  92.8  4e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2832  glutamine ABC transporter periplasmic protein  29.05 
 
 
248 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.220182  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3547  extracellular solute-binding protein  31.4 
 
 
263 aa  92.8  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.171423  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0366  extracellular solute-binding protein  29.52 
 
 
266 aa  92.8  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0588118  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0382  extracellular solute-binding protein  29.52 
 
 
266 aa  92.8  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0351  extracellular solute-binding protein  29.52 
 
 
266 aa  92.4  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1298  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.75 
 
 
247 aa  92  7e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.219686  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1773  glutamine ABC transporter periplasmic protein  29.65 
 
 
247 aa  91.7  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000148695  normal  0.114873 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1729  extracellular solute-binding protein family 3  28.63 
 
 
264 aa  91.7  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1600  glutamine ABC transporter periplasmic protein  29.65 
 
 
247 aa  91.7  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3441  glutamine ABC transporter periplasmic protein  29.73 
 
 
250 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1961  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.83 
 
 
250 aa  91.3  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40948  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5481  extracellular solute-binding protein  30.27 
 
 
270 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0495  TcmP  31.97 
 
 
255 aa  90.9  2e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3233  extracellular solute-binding protein  30.99 
 
 
263 aa  90.5  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.228634  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0468  extracellular solute-binding protein  28.05 
 
 
260 aa  90.5  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000361301  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4712  arginine-binding periplasmic protein 2  30.61 
 
 
246 aa  90.1  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00168872  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0836  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  28.14 
 
 
266 aa  90.1  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0996489 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1549  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.92 
 
 
266 aa  90.1  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.356902  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2537  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.63 
 
 
248 aa  90.1  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000279663  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4769  arginine-binding periplasmic protein 2  30.61 
 
 
246 aa  90.1  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.129317  normal  0.0665997 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4748  arginine-binding periplasmic protein 2  30.61 
 
 
246 aa  90.1  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00354956  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4629  arginine-binding periplasmic protein 2  30.61 
 
 
246 aa  90.1  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000336124  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5815  putative ABC transporter binding protein subunit  28.63 
 
 
266 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.387818  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3545  solute-binding family 3 protein  30.99 
 
 
263 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2512  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.23 
 
 
264 aa  89.7  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.226859  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1959  extracellular solute-binding protein  30.26 
 
 
222 aa  89.4  5e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.553895 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0501  extracellular solute-binding protein  29.52 
 
 
281 aa  89.4  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4248  extracellular solute-binding protein  28.79 
 
 
266 aa  89.4  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0312845 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1376  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  31.56 
 
 
243 aa  89.4  5e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0441  extracellular solute-binding protein  26.95 
 
 
266 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775109  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4898  extracellular solute-binding protein  26.95 
 
 
266 aa  89  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.733781 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2588  extracellular solute-binding protein  30.89 
 
 
270 aa  89  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4284  glutamine ABC transporter periplasmic protein  29.28 
 
 
250 aa  89  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4082  glutamine ABC transporter periplasmic protein  29.28 
 
 
250 aa  89  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.314608  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5074  extracellular solute-binding protein  26.95 
 
 
266 aa  88.6  8e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.599311  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0413  homoserine kinase (HSK; HK)  29.88 
 
 
256 aa  88.2  1e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.862983  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3038  extracellular solute-binding protein  29.34 
 
 
250 aa  87.8  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>