More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2666 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2666  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 446 aa  904    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.653198  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0825  signal transduction histidine kinase  51.14 
 
 		 455 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.111815  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0678  two-component sensor histidine kinase  39.31 
 
 		 460 aa  261  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.320332 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3662  alcohol dehydrogenase  37.2 
 
 		 733 aa  228  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.899908  normal  0.588935 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6450  signal transduction histidine kinase  32.07 
 
 		 635 aa  224  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3834  signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 		 728 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.284621 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3105  PAS sensor protein  33.03 
 
 		 728 aa  222  8e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2364  signal transduction histidine kinase  33.41 
 
 		 633 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.932865  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0218  signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 		 867 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269004 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0620  signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 		 725 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1984  signal transduction histidine kinase  36.47 
 
 		 713 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1267  signal transduction histidine kinase  34.45 
 
 		 500 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1117  PAS sensor protein  34.47 
 
 		 500 aa  184  3e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4235  signal transduction histidine kinase  30.61 
 
 		 496 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.942064  normal  0.0449527 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3000  signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 		 495 aa  180  4e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.262442 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2022  PAS sensor protein  35.58 
 
 		 717 aa  176  9e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2299  signal transduction histidine kinase  35.58 
 
 		 713 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.924903  normal  0.101705 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4215  signal transduction histidine kinase  37.91 
 
 		 582 aa  171  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0433147 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0798  PAS sensor protein  33.43 
 
 		 624 aa  171  3e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4932  signal transduction histidine kinase  32.27 
 
 		 907 aa  170  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.752686 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0965  signal transduction histidine kinase  36.89 
 
 		 850 aa  169  8e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1130  signal transduction histidine kinase  37.85 
 
 		 1002 aa  169  9e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.039296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3613  multi-sensor hybrid histidine kinase  54.55 
 
 		 1808 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.643019 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6264  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  31 
 
 		 1163 aa  168  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1677  signal transduction histidine kinase  37.54 
 
 		 840 aa  166  8e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4799  signal transduction histidine kinase  30.34 
 
 		 620 aa  166  9e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2833  signal transduction histidine kinase  36.78 
 
 		 738 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0108  PAS sensor protein  30.56 
 
 		 620 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1190  PAS sensor protein  37.05 
 
 		 1041 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314947 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1350  signal transduction histidine kinase  37.05 
 
 		 1016 aa  164  3e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.597121 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0851  signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 		 1124 aa  162  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.596817 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4605  MCP methyltransferase, CheR-type  39.11 
 
 		 1092 aa  161  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.315944  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0876  signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 		 1132 aa  160  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.61927  normal  0.464028 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2103  PAS sensor protein  33.64 
 
 		 655 aa  161  3e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365518 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2055  signal transduction histidine kinase  30.82 
 
 		 655 aa  161  3e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.429948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2379  signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 		 655 aa  160  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0915  PAS sensor protein  34.47 
 
 		 1132 aa  159  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.476466  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2607  signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 		 489 aa  159  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1213  signal transduction histidine kinase  31.69 
 
 		 603 aa  159  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5584  signal transduction histidine kinase  34.4 
 
 		 586 aa  159  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4217  PAS sensor protein  57.89 
 
 		 792 aa  154  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.423052  normal  0.639944 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3048  signal transduction histidine kinase  38.65 
 
 		 1001 aa  155  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.143163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4587  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  57.89 
 
 		 803 aa  154  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0699795  normal  0.0670662 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2159  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  54.4 
 
 		 796 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.758044 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2344  signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 		 500 aa  152  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00211814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5224  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  57.38 
 
 		 374 aa  152  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6177  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  56.56 
 
 		 422 aa  150  6e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.5027  normal  0.54606 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0741  Signal transduction histidine kinase  38.84 
 
 		 498 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2979  PAS sensor, serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit  34.2 
 
 		 754 aa  147  3e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1295  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.14 
 
 		 1223 aa  147  3e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0981526  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3111  sensory box histidine kinase  50.74 
 
 		 423 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.019274  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0827  signal transduction histidine kinase  28.21 
 
 		 512 aa  146  9e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2978  PAS  50.38 
 
 		 424 aa  145  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.317341  normal  0.6882 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4271  histidine kinase  28.18 
 
 		 692 aa  145  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305016  normal  0.0625064 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5290  signal transduction histidine kinase  30.85 
 
 		 662 aa  144  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2229  methylesterase CheB/methylase CheR  34.11 
 
 		 1170 aa  144  4e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.840236  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1881  PAS sensor protein  31.59 
 
 		 872 aa  144  4e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0358  signal transduction histidine kinase  57.6 
 
 		 602 aa  143  5e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0091  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.9 
 
 		 930 aa  143  5e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00954137  normal  0.993222 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4734  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  59.65 
 
 		 798 aa  143  5e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00660973 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  34.94 
 
 		 1676 aa  143  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2299  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.16 
 
 		 670 aa  142  8e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.465317  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0932  signal transduction histidine kinase  31.98 
 
 		 759 aa  143  8e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0905  putative PAS/PAC sensor protein  33.82 
 
 		 1170 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.968727 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5905  signal transduction histidine kinase  30.59 
 
 		 601 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.584764  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5794  signal transduction histidine kinase  33.43 
 
 		 717 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.63151  normal  0.343732 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0531  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.36 
 
 		 1193 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6552  signal transduction histidine kinase  28.7 
 
 		 489 aa  140  6e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.433672 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1700  signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 		 339 aa  139  7e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.193151  normal  0.0718068 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1811  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.8 
 
 		 1085 aa  139  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.565529  normal  0.532209 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1455  PAS sensor protein  52.76 
 
 		 1092 aa  138  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534076  normal  0.193101 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1730  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  52.76 
 
 		 1103 aa  138  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.747769  normal  0.0625523 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3819  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.18 
 
 		 1297 aa  137  4e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3331  signal transduction histidine kinase  29.22 
 
 		 503 aa  137  4e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2684  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.53 
 
 		 506 aa  137  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.546822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1297  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  28.51 
 
 		 1168 aa  137  4e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0588  sensory box protein  27.69 
 
 		 463 aa  136  7.000000000000001e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0079  signal transduction histidine kinase  31.69 
 
 		 639 aa  136  7.000000000000001e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.464916 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3652  signal transduction histidine kinase  26.93 
 
 		 491 aa  136  8e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1295  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  55.83 
 
 		 568 aa  135  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00252669 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5262  signal transduction histidine kinase  35.84 
 
 		 338 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3300  PAS sensor protein  29.53 
 
 		 583 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.928069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0471  signal transduction histidine kinase  35 
 
 		 349 aa  135  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0554  sensory box protein  27.69 
 
 		 463 aa  135  9.999999999999999e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2264  putative PAS/PAC sensor protein  34.48 
 
 		 1165 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.620072  normal  0.0600346 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3364  signal transduction histidine kinase  37.13 
 
 		 550 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.308249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3623  signal transduction histidine kinase  28.84 
 
 		 583 aa  134  3e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3037  hypothetical protein  31.34 
 
 		 1289 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203236  normal  0.672387 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.16 
 
 		 1559 aa  134  3.9999999999999996e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3666  signal transduction histidine kinase  37.13 
 
 		 550 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0123232  normal  0.85719 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6901  signal transduction histidine kinase  35.53 
 
 		 465 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  27.74 
 
 		 783 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0172  signal transduction histidine kinase  32.61 
 
 		 897 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6262  sensor histidine kinase  28.19 
 
 		 1202 aa  133  5e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0163021  normal  0.538502 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3529  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.33 
 
 		 1088 aa  133  6e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3739  MCP methyltransferase, CheR-type  35.9 
 
 		 1045 aa  133  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2090  signal transduction histidine kinase  32.09 
 
 		 372 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.893944 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3500  signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 583 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.319784  normal  0.0807687 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2121  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.89 
 
 		 1171 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.48946  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0149  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.02 
 
 		 957 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324886  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>