More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2998 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2998  GntR domain-containing protein  100 
 
 		 240 aa  475  1e-133  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000296609 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2705  GntR domain protein  49.33 
 
 		 234 aa  218  8.999999999999998e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.642006 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4787  GntR domain protein  45 
 
 		 249 aa  164  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0496334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2500  GntR domain protein  41.59 
 
 		 248 aa  160  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3725  transcriptional regulator NanR  32.61 
 
 		 237 aa  108  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.235628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  31.51 
 
 		 241 aa  105  6e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  31.36 
 
 		 238 aa  99.4  5e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4648  transcriptional regulator NanR  29.65 
 
 		 234 aa  94  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.462339  normal  0.769273 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4763  transcriptional regulator NanR  30.21 
 
 		 235 aa  91.7  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436481  normal  0.284781 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  32.7 
 
 		 250 aa  88.2  9e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3068  transcriptional regulator NanR  28.63 
 
 		 235 aa  87  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6461  GntR domain protein  28.3 
 
 		 257 aa  85.9  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0712738  hitchhiker  0.00000516822 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3067  transcriptional regulator NanR  28.81 
 
 		 258 aa  84.7  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862108 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2815  GntR domain-containing protein  32 
 
 		 264 aa  83.6  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.311573 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 233 aa  83.6  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1217  GntR domain-containing protein  30.63 
 
 		 218 aa  84  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  32.31 
 
 		 227 aa  83.6  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1852  GntR family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 238 aa  83.2  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0156  GntR family regulatory protein  34.2 
 
 		 270 aa  82.8  0.000000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.000005482  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5489  putative transcriptional regulator  29.03 
 
 		 257 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0216  GntR domain-containing protein  31.44 
 
 		 235 aa  82.4  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.613582 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0480  regulatory protein GntR HTH  29.05 
 
 		 263 aa  82.4  0.000000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.143431  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0480  transcriptional regulator NanR  29.05 
 
 		 263 aa  82.4  0.000000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.426599  normal  0.544762 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0177  GntR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 270 aa  82.4  0.000000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.285008  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3550  transcriptional regulator NanR  29.05 
 
 		 260 aa  82  0.000000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0970448  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0095  transcriptional regulator NanR  27.88 
 
 		 237 aa  82  0.000000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3414  transcriptional regulator NanR  29.05 
 
 		 260 aa  82  0.000000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0111616  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3708  transcriptional regulator NanR  29.05 
 
 		 260 aa  82  0.000000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.012881  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03086  transcriptional regulator NanR  29.05 
 
 		 263 aa  82  0.000000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.264497  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03037  hypothetical protein  29.05 
 
 		 263 aa  82  0.000000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.359811  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3521  transcriptional regulator NanR  29.05 
 
 		 260 aa  82  0.000000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0118397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21660  transcriptional regulator, GntR family  33.19 
 
 		 235 aa  81.6  0.000000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4543  transcriptional regulator NanR  29.05 
 
 		 260 aa  81.6  0.000000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.136259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002549  transcriptional repressor for pyruvate dehydrogenase complex  32.11 
 
 		 255 aa  81.3  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5755  GntR domain protein  34.13 
 
 		 234 aa  81.6  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3662  transcriptional regulator NanR  28.63 
 
 		 260 aa  81.3  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.215207  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3384  transcriptional regulator PdhR  30.59 
 
 		 250 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0020  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 256 aa  80.9  0.00000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.321852  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3633  GntR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 257 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.744351 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  28.93 
 
 		 241 aa  80.1  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0374  transcriptional regulator PdhR  30.94 
 
 		 250 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.783921  hitchhiker  0.000643873 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1195  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 218 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187106  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3432  transcriptional regulator PdhR  30.14 
 
 		 250 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.517793  normal  0.595075 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63070  GntR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 257 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1023  GntR domain-containing protein  30.84 
 
 		 215 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1991  transcriptional regulator PdhR  31.53 
 
 		 256 aa  79  0.00000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1175  GntR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 248 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621986  normal  0.19706 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1522  GntR domain-containing protein  29.26 
 
 		 245 aa  79  0.00000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0133617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0430  transcriptional regulator PdhR  30.14 
 
 		 250 aa  79  0.00000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00096101 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1215  GntR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 218 aa  78.6  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0659277  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1193  GntR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 218 aa  78.6  0.00000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1314  GntR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 218 aa  78.6  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  27.65 
 
 		 240 aa  78.6  0.00000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5153  GntR domain-containing protein  32.47 
 
 		 239 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.25689  normal  0.577182 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0929  GntR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 232 aa  78.6  0.00000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0628731  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1391  transcriptional regulator, GntR family  29.49 
 
 		 218 aa  78.6  0.00000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0418  transcriptional regulator PdhR  29.55 
 
 		 250 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1415  GntR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 218 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3007  GntR domain-containing protein  33.33 
 
 		 270 aa  77.8  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.012307  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3991  transcriptional regulator, GntR family  29.44 
 
 		 218 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.401302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3935  transcriptional regulator PdhR  30.59 
 
 		 250 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.470057  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1455  transcriptional regulator, GntR family  28.83 
 
 		 218 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2274  GntR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 232 aa  77  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000375173  decreased coverage  0.000000235359 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3534  GntR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 248 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0913049  normal  0.268016 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0156  GntR domain protein  29.78 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.108623 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4055  transcriptional regulator PdhR  30.59 
 
 		 250 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112662  normal  0.466854 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3552  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 236 aa  77  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.430063  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3857  transcriptional regulator PdhR  30.59 
 
 		 250 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000012948 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4809  transcriptional regulator PdhR  29.82 
 
 		 263 aa  76.6  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5432  GntR domain protein  30.83 
 
 		 248 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622945  normal  0.658298 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4037  GntR domain protein  33.17 
 
 		 226 aa  77  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1353  transcriptional regulator, GntR family  28.97 
 
 		 218 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1244  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 231 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2081  GntR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 366 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43060  GntR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 258 aa  76.3  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3778  transcriptional regulator PdhR  29.68 
 
 		 250 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1432  GntR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 239 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1631  GntR domain protein  31.2 
 
 		 267 aa  75.9  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0457  GntR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 239 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0554  GntR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 239 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0423  transcriptional regulator PdhR  31.14 
 
 		 250 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3914  transcriptional regulator PdhR  30.14 
 
 		 250 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.517213  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3872  GntR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 243 aa  75.9  0.0000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.405491 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0427  transcriptional regulator PdhR  31.14 
 
 		 250 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.988139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3600  transcriptional regulator PdhR  31.14 
 
 		 250 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.988331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0425  transcriptional regulator PdhR  31.14 
 
 		 250 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.113174  normal  0.0306695 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1542  GntR domain-containing protein  33.02 
 
 		 244 aa  75.1  0.0000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.408327  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3418  transcriptional regulator PdhR  30.45 
 
 		 250 aa  75.5  0.0000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.530869  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3193  GntR family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 248 aa  75.1  0.0000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03465  transcriptional regulator PdhR  30.87 
 
 		 255 aa  75.1  0.0000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1872  GntR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 318 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345922  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1157  GntR domain protein  30.56 
 
 		 255 aa  75.1  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4413  GntR domain protein  22.91 
 
 		 241 aa  74.3  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0921  regulatory protein GntR HTH  25.99 
 
 		 254 aa  74.3  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.228784  normal  0.888898 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0318  transcriptional regulator PdhR  28.94 
 
 		 250 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.405359 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3714  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 247 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421261  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 249 aa  73.9  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0527  GntR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 252 aa  74.3  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000211713  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3603  transcriptional regulator NanR  27.8 
 
 		 260 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.445383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6525  GntR domain-containing protein  29.24 
 
 		 253 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.0260964 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>