274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1565 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1565  hypothetical protein  100 
 
 		 525 aa  1065    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2660  hypothetical protein  55.6 
 
 		 547 aa  565  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00947468  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2691  hypothetical protein  54.07 
 
 		 534 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0089028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2738  hypothetical protein  55.8 
 
 		 547 aa  560  1e-158  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00426784  normal  0.452389 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1725  hypothetical protein  55.6 
 
 		 547 aa  555  1e-157  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0132926  hitchhiker  0.00697252 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2301  hypothetical protein  52.51 
 
 		 533 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00186231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2371  hypothetical protein  52.7 
 
 		 533 aa  535  1e-151  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00101788  normal  0.189183 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2491  hypothetical protein  52.51 
 
 		 533 aa  538  1e-151  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.803199  normal  0.104159 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1928  hypothetical protein  51.95 
 
 		 508 aa  531  1e-149  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000792391  normal  0.162614 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2160  hypothetical protein  51.89 
 
 		 578 aa  523  1e-147  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000828835  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1363  hypothetical protein  44.6 
 
 		 504 aa  449  1e-125  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2623  dipeptidase, putative  59.05 
 
 		 237 aa  289  8e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4453  hypothetical protein  34.27 
 
 		 592 aa  246  6e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.850017  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2626  dipeptidase, putative  55 
 
 		 280 aa  244  3e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.357242  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1237  hypothetical protein  34.21 
 
 		 576 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.752635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4890  hypothetical protein  33.67 
 
 		 579 aa  230  6e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00623806  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1176  hypothetical protein  33.53 
 
 		 576 aa  228  1e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.533125 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1302  hypothetical protein  31.85 
 
 		 575 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1208  hypothetical protein  33.4 
 
 		 591 aa  202  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08190  Xaa-His dipeptidase  31.01 
 
 		 464 aa  179  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0273  hypothetical protein  30.44 
 
 		 576 aa  177  4e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.956314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4190  hypothetical protein  29.92 
 
 		 579 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1343  dipeptidase, putative  29.94 
 
 		 579 aa  170  5e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.539449  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1156  hypothetical protein  29.56 
 
 		 579 aa  168  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.606865 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0229  hypothetical protein  29.49 
 
 		 576 aa  167  5e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0203  hypothetical protein  28.33 
 
 		 576 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.791234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1291  dipeptidase PepV  29.58 
 
 		 467 aa  162  2e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.901763  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0226  hypothetical protein  30.1 
 
 		 585 aa  161  3e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.767872 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0677  dipeptidase  30.99 
 
 		 469 aa  158  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4846  dipeptidase PepV  31.77 
 
 		 468 aa  156  7e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2770  dipeptidase  30.39 
 
 		 467 aa  156  9e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0101755  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4839  dipeptidase PepV  32.27 
 
 		 468 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4436  dipeptidase PepV  32.35 
 
 		 468 aa  155  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0439  dipeptidase PepV  29.25 
 
 		 465 aa  155  2e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4454  dipeptidase PepV  32.35 
 
 		 468 aa  154  5e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4821  dipeptidase PepV  32.35 
 
 		 468 aa  154  5e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1231  dipeptidase PepV  30.59 
 
 		 465 aa  153  7e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00676632  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4816  dipeptidase PepV  32.35 
 
 		 468 aa  152  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.630994  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0420  dipeptidase PepV  32.03 
 
 		 468 aa  152  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.93198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4535  dipeptidase PepV  31.03 
 
 		 468 aa  150  7e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3367  dipeptidase PepV  30.15 
 
 		 467 aa  147  5e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1421  dipeptidase PepV  29.88 
 
 		 465 aa  146  7.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.220018  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0431  dipeptidase  28.47 
 
 		 463 aa  146  9e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1525  peptidase V  29.15 
 
 		 471 aa  146  1e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2070  dipeptidase PepV  30.47 
 
 		 464 aa  143  7e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000110945  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1219  dipeptidase PepV  28.99 
 
 		 468 aa  140  3.9999999999999997e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.274288  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1723  dipeptidase, putative  26.98 
 
 		 465 aa  139  8.999999999999999e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2756  dipeptidase  27.87 
 
 		 470 aa  139  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1806  dipeptidase PepV  27.79 
 
 		 469 aa  137  4e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1841  dipeptidase PepV  27.79 
 
 		 469 aa  137  4e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0908  dipeptidase PepV  28.88 
 
 		 472 aa  135  1.9999999999999998e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000716409  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0847  peptidase V  26.54 
 
 		 473 aa  135  1.9999999999999998e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.150177  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1083  dipeptidase PepV  28.61 
 
 		 468 aa  134  6e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.30546  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1971  dipeptidase  25.99 
 
 		 476 aa  124  3e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1310  dipeptidase PepV  26.01 
 
 		 469 aa  124  6e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000129958  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0375  dipeptidase  27.51 
 
 		 481 aa  122  9.999999999999999e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1063  dipeptidase  25.35 
 
 		 470 aa  122  9.999999999999999e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0135  dipeptidase  32.02 
 
 		 473 aa  121  3e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.502281 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1046  dipeptidase, putative  26.59 
 
 		 464 aa  118  3e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0420  dipeptidase, putative  28.05 
 
 		 449 aa  116  1.0000000000000001e-24  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.808057  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4600  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  32.7 
 
 		 345 aa  113  9e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1434  dipeptidase  26.76 
 
 		 438 aa  113  9e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0146976  normal  0.693592 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf023  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.03 
 
 		 457 aa  111  4.0000000000000004e-23  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03630  dipeptidase, putative  26.89 
 
 		 481 aa  107  5e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00297419  normal  0.0181586 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1544  hypothetical protein  27.91 
 
 		 444 aa  104  5e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0234535  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl437  arginine catabolism aminotransferase  26.42 
 
 		 450 aa  102  2e-20  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000221366  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02210  dipeptidase, putative  27.09 
 
 		 484 aa  100  7e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0609  dipeptidase  24.16 
 
 		 456 aa  94  7e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.120564  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4100  hypothetical protein  30.3 
 
 		 462 aa  65.1  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2039  hypothetical protein  33.97 
 
 		 488 aa  63.9  0.000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0136  hypothetical protein  33.65 
 
 		 469 aa  63.5  0.000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0121  hypothetical protein  33.49 
 
 		 471 aa  61.6  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0118  hypothetical protein  33.49 
 
 		 471 aa  61.6  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4420  hypothetical protein  33.33 
 
 		 462 aa  61.6  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.33388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3315  hypothetical protein  29.77 
 
 		 468 aa  59.7  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2986  hypothetical protein  35.82 
 
 		 470 aa  57.8  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239395  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1632  hypothetical protein  37.82 
 
 		 457 aa  57.8  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0287575  normal  0.640121 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03459  glutamate carboxypeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05450)  32.35 
 
 		 535 aa  57.4  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00014033 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18404  predicted protein  32.59 
 
 		 512 aa  57.4  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.346695  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0429  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase  36.17 
 
 		 445 aa  57.4  0.0000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5407  acetylornithine deacetylase  33.33 
 
 		 387 aa  57.4  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532883  normal  0.0112485 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3983  hypothetical protein  33.49 
 
 		 462 aa  57.4  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1220  hypothetical protein  32.62 
 
 		 471 aa  57.4  0.0000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349749  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3383  hypothetical protein  37.84 
 
 		 463 aa  57  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6421  acetylornithine deacetylase  31.44 
 
 		 390 aa  56.2  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.501182  normal  0.657059 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0019  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  45.71 
 
 		 428 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.191094  hitchhiker  0.000354462 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5672  acetylornithine deacetylase  31.44 
 
 		 387 aa  56.2  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16138  normal  0.344042 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4522  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  47.14 
 
 		 428 aa  56.6  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5344  hypothetical protein  30.6 
 
 		 468 aa  56.6  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2321  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  42.25 
 
 		 424 aa  56.2  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.665958  normal  0.0430362 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0408  peptidase dimerization domain protein  37.04 
 
 		 455 aa  55.5  0.000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4122  hypothetical protein  39.34 
 
 		 460 aa  56.2  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637141  normal  0.498237 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01640  glutamate carboxypeptidase protein, putative  34.48 
 
 		 476 aa  54.7  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.182836  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1181  hypothetical protein  31.4 
 
 		 464 aa  54.7  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.415586  normal  0.738577 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1823  hypothetical protein  34.04 
 
 		 461 aa  54.7  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00111141  normal  0.415659 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1769  hypothetical protein  33.33 
 
 		 468 aa  54.3  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.547863  normal  0.297854 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1719  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase-like protein  35.14 
 
 		 448 aa  54.3  0.000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1074  peptidase M20  31.25 
 
 		 474 aa  54.3  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0808796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2697  peptidase M20  28.85 
 
 		 451 aa  54.3  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.922328 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6175  acetylornithine deacetylase  32.87 
 
 		 384 aa  53.9  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>