More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0858 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_0858  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  100 
 
 		 355 aa  699    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0956  sugar ABC transporter, permease protein, putative  69.94 
 
 		 353 aa  423  1e-117  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.281596  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1453  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  53.39 
 
 		 364 aa  353  2e-96  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0074  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  49.43 
 
 		 373 aa  334  2e-90  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1608  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  45.83 
 
 		 381 aa  311  1e-83  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.430201  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1178  inner-membrane translocator  44.83 
 
 		 356 aa  277  2e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2070  inner-membrane translocator  42.77 
 
 		 348 aa  276  5e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3560  inner-membrane translocator  43.91 
 
 		 352 aa  266  4e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.317487  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1411  sugar ABC transporter, permease protein  43.91 
 
 		 352 aa  259  7e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.222594  normal  0.0344411 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3888  sugar ABC transporter, permease protein  43.75 
 
 		 352 aa  258  9e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.253623  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2441  inner-membrane translocator  44.48 
 
 		 352 aa  256  4e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0141444  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3824  sugar ABC transporter, permease protein  45.04 
 
 		 352 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3531  ABC transporter, permease  45.04 
 
 		 352 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3549  ABC transporter permease  45.04 
 
 		 352 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.224274  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3837  sugar ABC transporter, permease protein  45.04 
 
 		 352 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000164763  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3802  sugar ABC transporter, permease protein  45.04 
 
 		 352 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000174596 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1830  ABC transporter, permease protein  39.22 
 
 		 365 aa  226  4e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.590478  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1550  ABC transporter permease  38.23 
 
 		 365 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.405583  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08790  inner-membrane translocator  38.64 
 
 		 365 aa  214  9.999999999999999e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000274602  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0422  inner-membrane translocator  38.53 
 
 		 391 aa  213  3.9999999999999995e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.975365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0403  inner-membrane translocator  36.03 
 
 		 352 aa  212  7e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00495406  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0018  inner-membrane translocator  35.33 
 
 		 344 aa  192  5e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1632  inner-membrane translocator  36.02 
 
 		 371 aa  192  6e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1780  inner-membrane translocator  34.71 
 
 		 357 aa  187  2e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1948  ABC transporter, permease protein  34.37 
 
 		 365 aa  186  4e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.476576  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1319  inner-membrane translocator  35.36 
 
 		 371 aa  186  5e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0031  inner-membrane translocator  35.67 
 
 		 357 aa  186  8e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3628  inner-membrane translocator  34.8 
 
 		 343 aa  183  3e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1580  inner-membrane translocator  32.48 
 
 		 372 aa  181  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0212662  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0006  inner-membrane translocator  37.43 
 
 		 344 aa  177  2e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0191826  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1154  inner-membrane translocator  33.81 
 
 		 367 aa  175  9.999999999999999e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.426445  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0843  inner-membrane translocator  31.99 
 
 		 344 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0820  inner-membrane translocator  31.99 
 
 		 344 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0698  ribose/galactose ABC transporter, permease protein  32.12 
 
 		 383 aa  171  1e-41  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3639  branched-chain amino acid transport system, permease, N-terminus  44.84 
 
 		 249 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2115  inner-membrane translocator  32.13 
 
 		 353 aa  170  4e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0438817  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4193  inner-membrane translocator  35.03 
 
 		 426 aa  168  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0750  inner-membrane translocator  34.12 
 
 		 362 aa  167  2e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00540188  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1787  inner-membrane translocator  32.96 
 
 		 354 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1148  inner-membrane translocator  32.96 
 
 		 354 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3052  inner-membrane translocator  32.31 
 
 		 442 aa  166  5.9999999999999996e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04910  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  37.25 
 
 		 471 aa  164  2.0000000000000002e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0297  inner-membrane translocator  35.94 
 
 		 388 aa  160  3e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000082551  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0562  inner-membrane translocator  31.99 
 
 		 340 aa  159  9e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2036  inner-membrane translocator  32.02 
 
 		 403 aa  158  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2175  inner-membrane translocator  32.86 
 
 		 364 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.630634  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1022  inner-membrane translocator  32.61 
 
 		 454 aa  157  3e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3177  inner-membrane translocator  33.43 
 
 		 358 aa  155  1e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.290387  normal  0.329303 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0144  inner-membrane translocator  33.24 
 
 		 400 aa  154  2e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1077  inner-membrane translocator  30.53 
 
 		 360 aa  150  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6737  inner-membrane translocator  37.88 
 
 		 340 aa  150  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.520538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0996  inner-membrane translocator  30.65 
 
 		 451 aa  146  4.0000000000000006e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25740  nucleoside ABC transporter membrane protein  34.04 
 
 		 419 aa  146  6e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.718562  normal  0.424748 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1925  inner-membrane translocator  31.6 
 
 		 355 aa  145  8.000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.633833  normal  0.690286 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4172  inner-membrane translocator  33.15 
 
 		 367 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1951  inner-membrane translocator  31.49 
 
 		 373 aa  145  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563372 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0809  inner-membrane translocator  33.96 
 
 		 437 aa  144  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1139  inner-membrane translocator  34.2 
 
 		 417 aa  143  5e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1212  inner-membrane translocator  34.54 
 
 		 462 aa  143  5e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000448619 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1302  inner-membrane translocator  34.88 
 
 		 347 aa  142  8e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00194364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1417  inner-membrane translocator  29.63 
 
 		 364 aa  142  8e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.017685  normal  0.100323 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3096  inner-membrane translocator  31.78 
 
 		 364 aa  142  9.999999999999999e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1299  ABC transporter inner-membrane translocator  32.93 
 
 		 377 aa  142  9.999999999999999e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0680  inner-membrane translocator  29.03 
 
 		 368 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00660304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1678  inner-membrane translocator  35.36 
 
 		 365 aa  139  6e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3175  inner-membrane translocator  36.15 
 
 		 379 aa  139  7.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.390246  normal  0.626931 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0672  inner-membrane translocator  28.25 
 
 		 366 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0634  inner-membrane translocator  33.81 
 
 		 365 aa  139  8.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000284112 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0768  ABC transporter, permease protein, putative  28.53 
 
 		 366 aa  139  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3656  inner-membrane translocator  32.36 
 
 		 365 aa  138  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.106074 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07940  nucleoside ABC transporter membrane protein  33.68 
 
 		 427 aa  136  4e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0859  inner-membrane translocator  31.88 
 
 		 362 aa  136  6.0000000000000005e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464439 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3585  ABC transporter inner-membrane translocator  31.02 
 
 		 376 aa  135  8e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2167  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  29.62 
 
 		 367 aa  135  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203557  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2844  integral inner-membrane protein  30.64 
 
 		 372 aa  135  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.746022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1408  inner-membrane translocator  29.05 
 
 		 359 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0027167  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2767  inner-membrane translocator  31.59 
 
 		 365 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3691  inner-membrane translocator  31.14 
 
 		 338 aa  134  3.9999999999999996e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.83673 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0505  inner-membrane translocator  31.25 
 
 		 363 aa  133  3.9999999999999996e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1904  inner-membrane translocator  31.05 
 
 		 364 aa  130  3e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.246976  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1447  inner-membrane translocator  32.1 
 
 		 338 aa  130  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.375364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0826  inner-membrane translocator  32.43 
 
 		 414 aa  130  3e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.632593 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0727  inner-membrane translocator  33.87 
 
 		 376 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.1031  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1939  ABC transporter, inner membrane subunit  29.55 
 
 		 368 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2320  inner-membrane translocator  29.72 
 
 		 368 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.434306 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1290  inner-membrane translocator  30.35 
 
 		 350 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.79178  normal  0.901092 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1901  inner-membrane translocator  28.82 
 
 		 361 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.415582  normal  0.118111 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4460  inner-membrane translocator  29.78 
 
 		 367 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.628382  normal  0.531923 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3267  inner-membrane translocator  30.81 
 
 		 463 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.169557  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0753  inner-membrane translocator  34.44 
 
 		 441 aa  126  6e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0917  inner-membrane translocator  28.78 
 
 		 351 aa  126  7e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5273  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  31.06 
 
 		 349 aa  125  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1977  inner-membrane translocator  27.45 
 
 		 369 aa  125  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0766  inner-membrane translocator  30.03 
 
 		 366 aa  124  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.286695  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0957  inner-membrane translocator  39.3 
 
 		 371 aa  124  3e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3944  hypothetical protein  29.71 
 
 		 360 aa  124  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.121867  normal  0.592217 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0157  inner-membrane translocator  36.45 
 
 		 370 aa  123  5e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.700557  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2257  inner-membrane translocator  35.26 
 
 		 409 aa  122  6e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2602  inner-membrane translocator  30.56 
 
 		 350 aa  122  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.815607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3241  inner-membrane translocator  29.46 
 
 		 360 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.366513  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>