More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1818 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1818  D-amino-acid dehydrogenase  100 
 
 		 419 aa  815    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3470  D-amino-acid dehydrogenase  61.79 
 
 		 458 aa  486  1e-136  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.721107 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0647  D-amino-acid dehydrogenase  59.03 
 
 		 452 aa  476  1e-133  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.685795  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1275  FAD dependent oxidoreductase  61.41 
 
 		 482 aa  476  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.189046  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2797  d-amino-acid dehydrogenase  56.69 
 
 		 419 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.337327  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0955  D-amino-acid dehydrogenase  59.14 
 
 		 416 aa  448  1e-125  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.249989 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1087  FAD dependent oxidoreductase  62.74 
 
 		 425 aa  449  1e-125  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23290  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  56.69 
 
 		 420 aa  436  1e-121  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2431  D-amino-acid dehydrogenase  52.55 
 
 		 416 aa  419  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0276149 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2597  FAD dependent oxidoreductase  52.55 
 
 		 415 aa  410  1e-113  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0827  D-amino-acid dehydrogenase  53.4 
 
 		 419 aa  384  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.365024  normal  0.0750347 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5615  D-amino-acid dehydrogenase  52.31 
 
 		 417 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.133637  normal  0.925695 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3596  FAD dependent oxidoreductase  52.55 
 
 		 424 aa  379  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.307288  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5323  D-amino-acid dehydrogenase  52.07 
 
 		 417 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.161486 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5235  D-amino-acid dehydrogenase  52.07 
 
 		 417 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.288943  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4780  D-amino-acid dehydrogenase  52.54 
 
 		 432 aa  374  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.778742 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0198  FAD dependent oxidoreductase  45.37 
 
 		 408 aa  312  5.999999999999999e-84  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.777626  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0813  FAD dependent oxidoreductase  30.66 
 
 		 441 aa  189  1e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2256  D-amino acid dehydrogenase small subunit  34.02 
 
 		 428 aa  184  3e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000681381  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1477  FAD dependent oxidoreductase  31.03 
 
 		 420 aa  183  5.0000000000000004e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.699089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3545  D-amino acid dehydrogenase  27.78 
 
 		 462 aa  182  1e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01910  D-amino acid dehydrogenase subunit  33.57 
 
 		 416 aa  181  2e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.492063  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4274  FAD dependent oxidoreductase  29.08 
 
 		 418 aa  180  4.999999999999999e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6265  FAD dependent oxidoreductase  31.98 
 
 		 413 aa  173  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00674063  normal  0.363363 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0499  FAD dependent oxidoreductase  35.31 
 
 		 415 aa  173  5.999999999999999e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3970  FAD dependent oxidoreductase  33.9 
 
 		 411 aa  169  7e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5199  FAD dependent oxidoreductase  31.74 
 
 		 440 aa  163  6e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.494361 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1533  D-amino-acid dehydrogenase  32.54 
 
 		 428 aa  161  3e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000097225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0804  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.95 
 
 		 433 aa  160  4e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.452249  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2712  FAD dependent oxidoreductase  31.03 
 
 		 415 aa  160  4e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0355  D-amino-acid dehydrogenase  30.66 
 
 		 415 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2360  D-amino-acid dehydrogenase  28.14 
 
 		 446 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0223413  normal  0.51106 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5571  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 415 aa  152  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000397488  normal  0.22054 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3117  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.14 
 
 		 432 aa  150  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.459659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3955  FAD dependent oxidoreductase  30.05 
 
 		 411 aa  150  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1843  FAD dependent oxidoreductase  33.66 
 
 		 420 aa  151  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1764  D-amino-acid dehydrogenase  29.04 
 
 		 422 aa  150  4e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.124563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2820  FAD dependent oxidoreductase  28.47 
 
 		 432 aa  150  4e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00368627  normal  0.483121 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1410  D-amino-acid dehydrogenase  28.71 
 
 		 415 aa  150  5e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.320893  normal  0.0817919 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2304  D-amino-acid dehydrogenase  30.92 
 
 		 421 aa  149  7e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.018021 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1318  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.52 
 
 		 419 aa  149  7e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1706  FAD dependent oxidoreductase  28.92 
 
 		 420 aa  149  7e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.612598  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3032  FAD dependent oxidoreductase  27.18 
 
 		 437 aa  149  1.0000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.451614  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2547  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.93 
 
 		 434 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4821  D-amino-acid dehydrogenase  32.2 
 
 		 419 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052408 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0240  FAD dependent oxidoreductase  31.39 
 
 		 425 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03073  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.78 
 
 		 428 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3994  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.23 
 
 		 441 aa  147  5e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1924  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.68 
 
 		 435 aa  146  6e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.385338  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2864  D-amino-acid dehydrogenase  27.8 
 
 		 417 aa  146  9e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.30815  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2000  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.93 
 
 		 435 aa  145  1e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.881788  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70040  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.22 
 
 		 432 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0200  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.93 
 
 		 433 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229652 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6078  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.22 
 
 		 432 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1447  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  28.16 
 
 		 427 aa  144  3e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.272098  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47980  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.37 
 
 		 432 aa  142  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5270  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.86 
 
 		 434 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0829502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3847  FAD dependent oxidoreductase  28.36 
 
 		 411 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0245  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.71 
 
 		 432 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5322  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.86 
 
 		 434 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116126 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1981  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.19 
 
 		 416 aa  140  3e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.200719  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3630  D-amino-acid dehydrogenase  25.84 
 
 		 417 aa  140  3.9999999999999997e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000258766 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5180  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.61 
 
 		 434 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0763537 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3967  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.76 
 
 		 433 aa  140  6e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.194472  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0558  D-amino-acid dehydrogenase small subunit  26.47 
 
 		 419 aa  139  6e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4843  FAD dependent oxidoreductase  31.13 
 
 		 416 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.570392  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1957  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.92 
 
 		 417 aa  139  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0235  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.44 
 
 		 433 aa  139  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0369  D-amino-acid dehydrogenase  29.68 
 
 		 421 aa  139  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0313  D-amino acid dehydrogenase small subunit  26.17 
 
 		 421 aa  139  1e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1094  FAD dependent oxidoreductase  31.91 
 
 		 421 aa  138  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.293126  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3174  FAD dependent oxidoreductase  30.43 
 
 		 418 aa  138  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0444  D-amino-acid dehydrogenase  28.68 
 
 		 434 aa  138  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3589  D-amino-acid dehydrogenase  31.19 
 
 		 424 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0959455  hitchhiker  0.00000935542 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2122  D-amino-acid dehydrogenase  31.99 
 
 		 421 aa  137  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17481  normal  0.029766 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1444  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.43 
 
 		 416 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.492956  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2389  D-amino-acid dehydrogenase  27.18 
 
 		 439 aa  137  4e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0101  D-amino acid dehydrogenase, small subunit  28.89 
 
 		 433 aa  137  5e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0740  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.01 
 
 		 434 aa  137  5e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.968608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5526  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.15 
 
 		 434 aa  136  8e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0673  D-amino-acid dehydrogenase  28.61 
 
 		 417 aa  136  8e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180164  hitchhiker  0.00553067 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2001  D-amino-acid dehydrogenase  30.75 
 
 		 416 aa  135  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.930793 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1656  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.37 
 
 		 428 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4434  D-amino acid dehydrogenase small subunit  26.54 
 
 		 432 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.615719  hitchhiker  0.00000811455 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0408  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.12 
 
 		 428 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0222  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.12 
 
 		 428 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0927  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.12 
 
 		 428 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2864  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.12 
 
 		 428 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.367842  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2551  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.12 
 
 		 428 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0507  amino acid dehydrogenase transmembrane protein  33.73 
 
 		 423 aa  133  6e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.133123 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3842  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.03 
 
 		 436 aa  133  6e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.190955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1503  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.35 
 
 		 425 aa  133  6e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.839298  normal  0.265321 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0808  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.02 
 
 		 416 aa  133  6e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0069  D-amino-acid dehydrogenase  33.17 
 
 		 411 aa  133  6e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5338  FAD dependent oxidoreductase  30.14 
 
 		 409 aa  133  6e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.18927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1259  putative D-amino-acid dehydrogenase, FAD dependent  31 
 
 		 435 aa  133  6e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00889371 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2925  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.95 
 
 		 428 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1301  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.13 
 
 		 418 aa  133  6.999999999999999e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2974  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.95 
 
 		 428 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2082  D-amino-acid dehydrogenase  24.82 
 
 		 418 aa  133  6.999999999999999e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0152588  normal  0.581205 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>