145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2675 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_1015  von Willebrand (VWA) domain-containing protein  98.62 
 
 
651 aa  1267    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0841  von Willebrand factor, type A  54.61 
 
 
686 aa  642    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.306061 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2675  von Willebrand factor, type A  100 
 
 
651 aa  1280    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.260015 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6419  von Willebrand factor type A  46 
 
 
706 aa  531  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.803942 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4506  von Willebrand factor type A  54.15 
 
 
698 aa  526  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.407878  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3424  von Willebrand factor type A  54.91 
 
 
592 aa  505  9.999999999999999e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0824  arginine biosynthesis bifunctional glutamate N-acetyltransferase/amino-acid acetyltransferase  54.16 
 
 
708 aa  490  1e-137  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0582843  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2700  von Willebrand factor, type A  47.72 
 
 
566 aa  456  1e-127  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.557808  normal  0.158328 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0158  von Willebrand factor type A  49.05 
 
 
625 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1139  von Willebrand factor type A  46.83 
 
 
642 aa  450  1e-125  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3252  von Willebrand factor type A  46.83 
 
 
627 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00246065 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1049  von Willebrand factor, type A  54.16 
 
 
555 aa  448  1.0000000000000001e-124  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.691019  normal  0.362005 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1105  von Willebrand factor type A  46.64 
 
 
642 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3319  von Willebrand factor type A  45.37 
 
 
640 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.041713  hitchhiker  0.00219291 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0183  von Willebrand factor, type A  46.39 
 
 
563 aa  445  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.174598  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1038  von Willebrand factor type A  46.26 
 
 
642 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1196  von Willebrand factor type A  48 
 
 
639 aa  443  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3055  von Willebrand factor, type A  48.19 
 
 
625 aa  437  1e-121  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.548122 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1077  von Willebrand factor, type A  43.01 
 
 
612 aa  437  1e-121  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0195033  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3075  von Willebrand factor, type A  49.04 
 
 
536 aa  438  1e-121  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5984  von Willebrand factor type A  50 
 
 
654 aa  436  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.045393  normal  0.108716 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2973  von Willebrand factor, type A  47.97 
 
 
624 aa  435  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00160061  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3153  von Willebrand factor, type A  43.13 
 
 
613 aa  433  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.573485  normal  0.703806 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3552  von Willebrand factor type A domain-containing protein  45.1 
 
 
621 aa  426  1e-118  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1986  von Willebrand factor type A  47.86 
 
 
792 aa  426  1e-118  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1043  von Willebrand factor, type A  45.07 
 
 
633 aa  424  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.359154  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0477  von Willebrand factor, type A  42.22 
 
 
571 aa  422  1e-117  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2451  von Willebrand factor type A domain protein  44.36 
 
 
598 aa  411  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0187  von Willebrand factor type A  44.92 
 
 
613 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.592381 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2659  von Willebrand factor, type A  46.12 
 
 
593 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.101316  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5035  von Willebrand factor, type A  46.07 
 
 
709 aa  403  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.668602  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2426  von Willebrand factor type A domain-containing protein  44.4 
 
 
588 aa  388  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1387  von Willebrand factor type A  40.94 
 
 
575 aa  384  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.336718  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2419  von Willebrand factor type A domain-containing protein  40.94 
 
 
575 aa  384  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.433183  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0263  von Willebrand factor type A  43.99 
 
 
551 aa  375  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17360  uncharacterized protein containing a von Willebrand factor type A (vWA) domain  42.05 
 
 
629 aa  315  1.9999999999999998e-84  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.390594  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6907  von Willebrand factor type A  39.01 
 
 
588 aa  291  3e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.131426 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1063  von Willebrand factor type A  44.74 
 
 
555 aa  289  1e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000708626 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2141  von Willebrand factor type A  36.62 
 
 
610 aa  284  3.0000000000000004e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01616  von Willebrand factor type A domain protein  47.4 
 
 
350 aa  280  7e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0155  von Willebrand factor type A  38.79 
 
 
500 aa  225  2e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0565906 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7212  von Willebrand factor type A domain protein  35.8 
 
 
490 aa  215  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548543  normal  0.0992669 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0325  von Willebrand factor type A  31.57 
 
 
859 aa  189  1e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.313972 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5407  von Willebrand factor type A  38.86 
 
 
935 aa  122  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.462507 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7173  von Willebrand factor type A  30.89 
 
 
462 aa  87.4  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2244  von Willebrand factor, type A  28.18 
 
 
416 aa  85.5  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0785649  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3616  von Willebrand factor, type A  29.41 
 
 
479 aa  83.2  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304653  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1234  von Willebrand factor type A  32.72 
 
 
412 aa  81.6  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.723207  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0166  von Willebrand factor type A  23.53 
 
 
411 aa  81.3  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.345771 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4385  von Willebrand factor type A domain-containing protein  25.11 
 
 
451 aa  78.2  0.0000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6336  von Willebrand factor type A  25 
 
 
808 aa  77  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0254  von Willebrand factor, type A  28.43 
 
 
615 aa  75.1  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000406076  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2631  von Willebrand factor type A domain-containing protein  25.99 
 
 
442 aa  74.7  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.813188  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6385  von Willebrand factor type A  30.7 
 
 
523 aa  74.3  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3380  von Willebrand factor, type A  29.9 
 
 
459 aa  72.4  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178617  hitchhiker  0.00546751 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0264  von Willebrand factor type A  27.44 
 
 
418 aa  70.9  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0262  von Willebrand factor type A  27.44 
 
 
418 aa  70.9  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1463  von Willebrand factor, type A  26.18 
 
 
425 aa  70.9  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197313  normal  0.691375 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2951  von Willebrand factor type A  29.29 
 
 
418 aa  70.5  0.00000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5121  von Willebrand factor type A  31.09 
 
 
419 aa  70.1  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.104188  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6113  von Willebrand factor type A  28.82 
 
 
430 aa  67.4  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2950  von Willebrand factor type A  31.12 
 
 
426 aa  66.6  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0384  von Willebrand factor type A  28.24 
 
 
423 aa  66.2  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2162  von Willebrand factor type A  24.89 
 
 
425 aa  65.9  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.314741  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5207  von Willebrand factor type A  28.74 
 
 
412 aa  66.6  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146018 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0755  von Willebrand factor type A  30.67 
 
 
418 aa  65.5  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.802956 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4211  von Willebrand factor type A  27.92 
 
 
415 aa  65.1  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.290242  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4090  hypothetical protein  24.03 
 
 
602 aa  63.5  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0826588 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2768  von Willebrand factor, type A  31.14 
 
 
412 aa  62.8  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.271285  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3732  von Willebrand factor type A  27.32 
 
 
418 aa  61.6  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.285175  normal  0.068193 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1306  von Willebrand factor type A domain-containing protein  23.58 
 
 
460 aa  61.6  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.478577  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1252  von Willebrand factor type A  30.32 
 
 
914 aa  61.2  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1017  von Willebrand factor type A; type II secretion system protein  31.33 
 
 
643 aa  61.2  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1416  von Willebrand factor type A  23.58 
 
 
472 aa  60.8  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2761  von Willebrand factor type A domain-containing protein  23.58 
 
 
472 aa  60.5  0.00000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00899229  hitchhiker  0.00197042 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1244  von Willebrand factor, type A  27.87 
 
 
412 aa  60.5  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.427731  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1307  von Willebrand factor, type A  29.79 
 
 
418 aa  59.7  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3077  hypothetical protein  27.8 
 
 
816 aa  59.7  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.155814  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3203  von Willebrand factor type A  29.41 
 
 
421 aa  59.7  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.231871  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2394  von Willebrand factor type A  27.32 
 
 
412 aa  58.9  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0648  von Willebrand factor, type A  26.26 
 
 
307 aa  58.5  0.0000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4043  von Willebrand factor type A  23.47 
 
 
423 aa  58.2  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3690  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  28.48 
 
 
680 aa  57.8  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2206  BatA  26.26 
 
 
317 aa  56.6  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0553658  normal  0.0945164 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1308  von Willebrand factor, type A  25.77 
 
 
427 aa  56.6  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3969  von Willebrand factor type A  30.1 
 
 
480 aa  56.6  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3922  vault protein inter-alpha-trypsin  25.58 
 
 
701 aa  56.2  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01615  hypothetical protein  38.67 
 
 
86 aa  55.1  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3544  von Willebrand factor, type A  29.84 
 
 
966 aa  53.5  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_54892  predicted protein  31.25 
 
 
523 aa  53.5  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38488  predicted protein  31.77 
 
 
683 aa  52  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0603  von Willebrand factor, type A  29.21 
 
 
316 aa  51.2  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.623778  normal  0.0597521 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1641  von Willebrand factor type A  24.12 
 
 
316 aa  50.8  0.00007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2080  von Willebrand factor type A  25.62 
 
 
327 aa  51.2  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.829092  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1630  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  29.07 
 
 
619 aa  50.1  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0818  von Willebrand factor type A  29.19 
 
 
607 aa  49.7  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2191  von Willebrand factor type A  30.43 
 
 
546 aa  49.3  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1806  hypothetical protein  26.57 
 
 
316 aa  49.3  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.539334  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1830  von Willebrand factor type A  29.87 
 
 
573 aa  48.9  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2277  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  26.07 
 
 
755 aa  48.5  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0645539  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>