102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1629 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2983  hypothetical protein  99.73 
 
 		 375 aa  743    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1629  hypothetical protein  100 
 
 		 404 aa  806    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.91502 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1862  hypothetical protein  89.36 
 
 		 399 aa  695    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.66544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1821  hypothetical protein  55.61 
 
 		 406 aa  403  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0124025  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0861  hypothetical protein  50.37 
 
 		 405 aa  386  1e-106  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0100768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1934  hypothetical protein  44.61 
 
 		 491 aa  318  7e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1183  hypothetical protein  48.2 
 
 		 409 aa  298  1e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.297554 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1011  hypothetical protein  37.5 
 
 		 436 aa  58.9  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0754154  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1073  XRE family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 249 aa  55.8  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.98421 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1056  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 260 aa  55.5  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0545151  normal  0.0954786 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0955  hypothetical protein  37.84 
 
 		 357 aa  55.1  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0134  hypothetical protein  35.62 
 
 		 404 aa  55.5  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.244573 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1186  hypothetical protein  33.33 
 
 		 266 aa  54.7  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.613527  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1468  transcriptional regulator, XRE family  32.39 
 
 		 312 aa  53.9  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.520924  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2681  transcriptional regulator, putative  33.33 
 
 		 280 aa  52.8  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.11073  normal  0.597549 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1422  hypothetical protein  32.05 
 
 		 304 aa  52  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.542489  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1394  putative DNA-binding protein  24.1 
 
 		 210 aa  51.6  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1126  hypothetical protein  25.49 
 
 		 340 aa  50.8  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.869232  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1333  integral membrane protein  24.1 
 
 		 263 aa  50.8  0.00004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.380936  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1282  XRE family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 279 aa  50.4  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0746  hypothetical protein  31.51 
 
 		 510 aa  50.1  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.204692  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1708  hypothetical protein  30.77 
 
 		 252 aa  49.7  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02982  hypothetical protein  35.14 
 
 		 350 aa  49.7  0.00009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0033569  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0913  hypothetical protein  35.94 
 
 		 314 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.373536  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004350  hypothetical protein  32.31 
 
 		 323 aa  49.3  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1745  hypothetical protein  22.53 
 
 		 374 aa  48.5  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.934061 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0838  XRE family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 241 aa  48.5  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2019  hypothetical protein  30.43 
 
 		 311 aa  47.8  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1340  Xre-like DNA-binding protein  31.94 
 
 		 340 aa  48.1  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000360775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1228  hypothetical protein  31.51 
 
 		 375 aa  47.8  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193476  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1150  transcriptional regulator, XRE family  32.14 
 
 		 360 aa  48.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.771962 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07520  hypothetical protein  33.33 
 
 		 382 aa  48.1  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00214299  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2608  hypothetical protein  34.38 
 
 		 372 aa  47.4  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1433  hypothetical protein  32.14 
 
 		 331 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1227  hypothetical protein  31.51 
 
 		 380 aa  47.4  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0535781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1298  hypothetical protein  31.51 
 
 		 376 aa  47.4  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.445339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0529  helix-turn-helix domain-containing protein  24.82 
 
 		 265 aa  47.4  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.235438  normal  0.474385 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1903  hypothetical protein  30.61 
 
 		 281 aa  47.8  0.0004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3128  transcriptional regulator, XRE family  27.94 
 
 		 267 aa  47.8  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0824833  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0990  transcriptional regulator, XRE family  24.49 
 
 		 314 aa  47.8  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2356  hypothetical protein  43.48 
 
 		 360 aa  47  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1346  hypothetical protein  43.48 
 
 		 362 aa  47  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0061  hypothetical protein  43.48 
 
 		 387 aa  47  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0231937  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1108  hypothetical protein  43.48 
 
 		 387 aa  47  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148526  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1596  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 285 aa  46.6  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.778872  normal  0.350222 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2191  hypothetical protein  43.48 
 
 		 387 aa  47  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.452713  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0520  hypothetical protein  28 
 
 		 345 aa  46.6  0.0007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2554  transcriptional regulator, XRE family  30.67 
 
 		 273 aa  46.6  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35211e-22 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1663  hypothetical protein  37.93 
 
 		 293 aa  46.6  0.0007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000864881  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1433  hypothetical protein  24.49 
 
 		 331 aa  46.6  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.575775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1593  XRE family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 370 aa  46.6  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.196289 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3592  hypothetical protein  30.77 
 
 		 566 aa  46.6  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1836  hypothetical protein  43.48 
 
 		 336 aa  46.6  0.0008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.172253  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2229  hypothetical protein  43.48 
 
 		 336 aa  46.6  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0169473  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2078  transcriptional regulator, XRE family  30.56 
 
 		 297 aa  46.6  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1214  hypothetical protein  30.68 
 
 		 367 aa  46.6  0.0009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.567151  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3313  hypothetical protein  27.55 
 
 		 374 aa  45.8  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6266  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 338 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0403  hypothetical protein  21.76 
 
 		 318 aa  46.2  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.902223  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1813  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 338 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4046  XRE family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 319 aa  45.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1837  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 334 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1058  transcriptional regulator, XRE family  32.14 
 
 		 360 aa  46.2  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0971616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1604  transcriptional regulator, XRE family  28 
 
 		 326 aa  45.8  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0722397 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1932  hypothetical protein  28 
 
 		 324 aa  45.8  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.240764  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2087  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  37.68 
 
 		 338 aa  45.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2107  XRE family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 351 aa  45.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.211788 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1263  hypothetical protein  33.82 
 
 		 245 aa  45.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1355  hypothetical protein  22.86 
 
 		 341 aa  45.1  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000155612 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01066  hypothetical protein  30.77 
 
 		 321 aa  45.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0955  hypothetical protein  27.54 
 
 		 191 aa  45.1  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000127894  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1466  hypothetical protein  23.45 
 
 		 307 aa  45.1  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3391  transcriptional regulator  40.82 
 
 		 322 aa  45.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1185  transcriptional regulator, XRE family  29.17 
 
 		 296 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000101006  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0785  transcriptional regulator, XRE family  30.95 
 
 		 501 aa  45.4  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0234796  normal  0.197603 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1943  transcriptional regulator, putative  31.75 
 
 		 246 aa  45.8  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2986  hypothetical protein  32.31 
 
 		 311 aa  44.7  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2233  hypothetical protein  42.03 
 
 		 360 aa  44.7  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.683193  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3660  hypothetical protein  27.34 
 
 		 288 aa  44.7  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2542  transcriptional regulator, XRE family  38.89 
 
 		 362 aa  44.3  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.150986  hitchhiker  0.00310963 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10680  hypothetical protein  27.1 
 
 		 469 aa  44.7  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0331666  unclonable  0.0000000019821 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0772  transcriptional regulator, XRE family  28.75 
 
 		 307 aa  44.7  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.83924 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0434  transcriptional regulator, putative  30.43 
 
 		 289 aa  44.3  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0121378  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2654  hypothetical protein  31.88 
 
 		 143 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5114  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 342 aa  43.9  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2036  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 328 aa  43.9  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0080217  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1302  hypothetical protein  31.88 
 
 		 142 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1255  hypothetical protein  32.79 
 
 		 364 aa  43.9  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0157671  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2558  hypothetical protein  30.53 
 
 		 142 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.072272  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0681  hypothetical protein  32.05 
 
 		 273 aa  43.5  0.006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000427065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3060  SH3 type 3 domain-containing protein  28.38 
 
 		 293 aa  43.5  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1659  helix-turn-helix domain protein  28 
 
 		 266 aa  43.5  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0651  hypothetical protein  35.48 
 
 		 271 aa  43.5  0.007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.294902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14860  hypothetical protein  30 
 
 		 347 aa  43.5  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1789  XRE family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 196 aa  43.5  0.007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0849  Cro/CI family transcriptional regulator  23.44 
 
 		 130 aa  43.1  0.008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0582  Xre-like DNA-binding protein  32.31 
 
 		 291 aa  43.1  0.008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0704393  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1310  hypothetical protein  30 
 
 		 348 aa  43.1  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.443382  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1304  hypothetical protein  29.76 
 
 		 321 aa  43.5  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.358392  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40300  hypothetical protein  32.14 
 
 		 342 aa  43.1  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>