216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4676 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4676  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 220 aa  444  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1419  TPR repeat-containing protein  80.77 
 
 		 221 aa  334  7.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1399  tetratricopeptide TPR_2  80 
 
 		 226 aa  313  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.972416  normal  0.953611 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3988  tetratricopeptide TPR_2  77.04 
 
 		 219 aa  308  4e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.374893 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1657  hypothetical protein  78.74 
 
 		 192 aa  286  2e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.459184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0984  TPR repeat-containing protein  67.3 
 
 		 221 aa  283  1.0000000000000001e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.815768 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1215  tetratricopeptide TPR_2  68.72 
 
 		 224 aa  278  4e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2063  TPR repeat-containing protein  51.83 
 
 		 243 aa  155  4e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2028  TPR repeat-containing protein  51.28 
 
 		 205 aa  150  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.287446  normal  0.576518 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1787  TPR repeat-containing protein  44.38 
 
 		 290 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1561  TPR repeat-containing protein  43.95 
 
 		 190 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.707304  normal  0.548421 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0086  TPR repeat-containing protein  38.92 
 
 		 307 aa  125  4.0000000000000003e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5960  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.52 
 
 		 202 aa  123  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0718627  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2421  hypothetical protein  41.4 
 
 		 190 aa  122  3e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.416486  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1747  TPR domain-containing protein  35.38 
 
 		 229 aa  122  4e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1687  TPR domain-containing protein  35.38 
 
 		 209 aa  122  4e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2675  TPR repeat-containing protein  36.02 
 
 		 203 aa  122  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.679716  normal  0.152424 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1829  TPR repeat-containing protein  38.55 
 
 		 245 aa  122  5e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.320638  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1084  TPR repeat-containing protein  40.76 
 
 		 175 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1166  TPR repeat-containing protein  35.19 
 
 		 230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3277  TPR repeat-containing protein  41.18 
 
 		 204 aa  116  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.983749 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2969  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.5 
 
 		 202 aa  116  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233578  normal  0.742122 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3257  TPR repeat-containing protein  40 
 
 		 194 aa  115  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.841733  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2742  TPR repeat-containing protein  37.02 
 
 		 202 aa  115  5e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.911892  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3576  TPR repeat-containing protein  40.52 
 
 		 211 aa  115  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.316735  normal  0.110411 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5209  TPR repeat-containing protein  41.03 
 
 		 200 aa  112  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.221692  normal  0.106965 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2864  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.36 
 
 		 201 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3687  hypothetical protein  42.06 
 
 		 261 aa  104  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.145402  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0138  TPR repeat-containing protein  37.3 
 
 		 156 aa  102  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000611488 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0141  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.3 
 
 		 156 aa  102  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0130  TPR repeat-containing protein  40.49 
 
 		 203 aa  102  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.250306 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2056  tetratricopeptide TPR_2  35.82 
 
 		 233 aa  100  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.134429  normal  0.162736 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4966  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  41.23 
 
 		 155 aa  99  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0782  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.67 
 
 		 188 aa  98.2  9e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0782775  normal  0.104271 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0175  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.05 
 
 		 156 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.723088 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1201  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.17 
 
 		 183 aa  88.6  7e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.564024  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1025  TPR repeat-containing protein  37.72 
 
 		 156 aa  86.3  3e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4894  TPR repeat-containing protein  35.09 
 
 		 156 aa  86.3  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00964612 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3312  TPR protein  34.72 
 
 		 188 aa  83.2  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000995394  normal  0.0577925 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3022  TPR repeat-containing protein  28.8 
 
 		 161 aa  76.3  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246943 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0204  TPR repeat-containing protein  29.2 
 
 		 212 aa  74.7  0.0000000000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0572  tetratricopeptide TPR_2  34.11 
 
 		 194 aa  72.4  0.000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00850831  hitchhiker  0.0000040032 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2533  TPR repeat-containing protein  32.28 
 
 		 192 aa  71.6  0.000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_8734  predicted protein  32.26 
 
 		 124 aa  71.2  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.662786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1693  tetratricopeptide TPR_2  28 
 
 		 203 aa  68.6  0.00000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.521297  normal  0.655187 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  28.18 
 
 		 361 aa  59.3  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  30.12 
 
 		 279 aa  58.5  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63917  Anaphase promoting complex subunit CDC27 (Cell division control protein 27) (Anaphase promoting complex subunit 3)  31.33 
 
 		 571 aa  57.8  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  30.39 
 
 		 1979 aa  56.6  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  30.11 
 
 		 1827 aa  56.2  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  29.03 
 
 		 820 aa  54.3  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  28.72 
 
 		 649 aa  53.9  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  30.34 
 
 		 732 aa  53.9  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2461  hypothetical protein  31.4 
 
 		 398 aa  53.1  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.125521  normal  0.0258605 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2801  TPR repeat-containing protein  33.75 
 
 		 291 aa  53.1  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.462521  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  28.87 
 
 		 1421 aa  53.5  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  29.17 
 
 		 576 aa  52.4  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0964  TPR domain-containing protein  28.92 
 
 		 295 aa  52  0.000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166963  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.07 
 
 		 738 aa  52  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0905  TPR domain-containing protein  28.92 
 
 		 295 aa  52  0.000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1009  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.2 
 
 		 528 aa  51.6  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.781757  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0774  TPR repeat-containing protein  27.66 
 
 		 1534 aa  51.6  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1722  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.66 
 
 		 354 aa  50.8  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2723  TPR repeat-containing protein  30.09 
 
 		 342 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.26129  normal  0.431849 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1309  TPR repeat-containing protein  25.88 
 
 		 515 aa  51.2  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11910  TPR repeat-containing protein  24.3 
 
 		 394 aa  50.8  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000944223  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  26.52 
 
 		 3560 aa  51.2  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  28.42 
 
 		 560 aa  50.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0032  TPR repeat-containing protein  27.66 
 
 		 1445 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3363  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.09 
 
 		 289 aa  49.7  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.040769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  29.37 
 
 		 662 aa  49.7  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0414  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.12 
 
 		 587 aa  50.1  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2754  TPR repeat-containing protein  28.75 
 
 		 295 aa  49.3  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.59 
 
 		 988 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  24.07 
 
 		 1276 aa  49.3  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.72 
 
 		 1056 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  27.88 
 
 		 718 aa  48.5  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3529  hypothetical protein  27.1 
 
 		 929 aa  48.5  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1678  TPR repeat-containing protein  27.07 
 
 		 240 aa  48.5  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  28.12 
 
 		 1085 aa  48.5  0.00008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0233  TPR repeat-containing protein  30.39 
 
 		 421 aa  47.8  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.683027 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  26.95 
 
 		 1013 aa  47.8  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3029  peptidase C14  25.14 
 
 		 527 aa  48.1  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.148896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1344  TPR repeat-containing protein  28.41 
 
 		 471 aa  47.8  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641665  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  23.26 
 
 		 1252 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1603  TPR repeat-containing protein  27.38 
 
 		 804 aa  48.1  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  24.73 
 
 		 1154 aa  48.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2812  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.26 
 
 		 1838 aa  47.8  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.4844  normal  0.543205 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2367  TPR repeat-containing protein  24.84 
 
 		 860 aa  48.1  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66638  glucose repression mediator protein  23.31 
 
 		 815 aa  48.1  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0062  TPR domain-containing protein  32.93 
 
 		 680 aa  47.4  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1384  TPR repeat-containing protein  22.73 
 
 		 870 aa  47  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000149301  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2379  hypothetical protein  31.03 
 
 		 283 aa  47.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.14303 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  26.53 
 
 		 747 aa  47  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3415  TPR repeat-containing protein  30.84 
 
 		 638 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.241751  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  23.26 
 
 		 1252 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0887  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.12 
 
 		 504 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.389457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  34.07 
 
 		 739 aa  47.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  24.21 
 
 		 582 aa  47  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.77 
 
 		 1022 aa  47  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>