More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1538 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1538  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 232 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307485  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3686  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.64 
 
 		 709 aa  115  5e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.206553 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5414  signal transduction histidine kinase  36.46 
 
 		 348 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2784  signal transduction histidine kinase  35.94 
 
 		 354 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0664  Signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 		 344 aa  112  5e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4873  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  35.42 
 
 		 348 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5358  signal transduction histidine kinase  36.92 
 
 		 348 aa  110  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0515  signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 		 416 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.498763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2710  signal transduction histidine kinase  34.9 
 
 		 363 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.304131  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2444  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 721 aa  105  7e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0911916  normal  0.976086 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2192  signal transduction histidine kinase  34.9 
 
 		 362 aa  104  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0298  signal transduction histidine kinase  34.9 
 
 		 349 aa  101  9e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228007  hitchhiker  0.00285782 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3023  signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 		 361 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2872  signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 		 362 aa  99.8  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.401413  normal  0.23232 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2165  signal transduction histidine kinase  33.99 
 
 		 358 aa  99  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2428  signal transduction histidine kinase  32.12 
 
 		 360 aa  98.6  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.391955  decreased coverage  0.00462713 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0384  two component sensor kinase  33.69 
 
 		 344 aa  97.4  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1756  Signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 		 362 aa  97.1  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.38054  normal  0.143124 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0148  Signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 		 350 aa  97.1  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.332902  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2946  signal transduction histidine kinase  33.87 
 
 		 349 aa  97.1  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.341682  normal  0.680161 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3728  signal transduction histidine kinase  35.53 
 
 		 406 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.979777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4219  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 362 aa  97.4  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1781  signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 		 350 aa  97.1  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2424  signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 		 354 aa  94  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.790198 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5952  signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 		 355 aa  93.6  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.113414 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1343  signal transduction histidine kinase  31.61 
 
 		 350 aa  94  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.54395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1193  sensory transduction regulatory protein  30.65 
 
 		 391 aa  90.1  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3911  signal transduction histidine kinase  27.14 
 
 		 1093 aa  87.8  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25512  normal  0.0971599 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3525  signal transduction histidine kinase  30.14 
 
 		 603 aa  84.7  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6718  signal transduction histidine kinase  30.26 
 
 		 387 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0742813  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4308  signal transduction histidine kinase  28.43 
 
 		 739 aa  84  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.057717 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4408  signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 		 408 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.488817 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7100  signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 		 357 aa  82.8  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  29.23 
 
 		 526 aa  82  0.000000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2333  signal transduction histidine kinase  36.09 
 
 		 376 aa  81.6  0.000000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0772  signal transduction histidine kinase  29.69 
 
 		 371 aa  81.3  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2534  signal transduction histidine kinase  29 
 
 		 356 aa  81.3  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  29.27 
 
 		 815 aa  81.6  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0255  sensor histidine kinase  30.69 
 
 		 480 aa  81.3  0.00000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3762  signal transduction histidine kinase  29.03 
 
 		 353 aa  80.9  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1678  signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 		 348 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.293126  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5851  signal transduction histidine kinase  26.29 
 
 		 437 aa  80.1  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.883245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  28.29 
 
 		 783 aa  79.3  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1629  signal transduction histidine kinase  40.16 
 
 		 600 aa  79.3  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.373706 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4182  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  29.19 
 
 		 338 aa  79  0.00000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2279  signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 		 392 aa  79  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0130228 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4364  signal transduction histidine kinase  29.5 
 
 		 807 aa  79  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.217771 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4553  signal transduction histidine kinase  29.19 
 
 		 351 aa  79  0.00000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.486913 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1063  signal transduction histidine kinase  29.44 
 
 		 358 aa  78.2  0.00000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0212102 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  27.46 
 
 		 964 aa  78.2  0.00000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  31.11 
 
 		 439 aa  78.2  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4695  signal transduction histidine kinase  27.98 
 
 		 364 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.910371  normal  0.12529 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1099  signal transduction histidine kinase  29.08 
 
 		 335 aa  77.4  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6722  signal transduction histidine kinase  28.79 
 
 		 364 aa  77  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.16203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4851  signal transduction histidine kinase  27.7 
 
 		 752 aa  77.4  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0114486 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2705  signal transduction histidine kinase  27.1 
 
 		 856 aa  77  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1535  sensory transduction histidine kinase  26.43 
 
 		 682 aa  76.6  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0324  signal transduction histidine kinase  29.15 
 
 		 398 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.732156  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  27.32 
 
 		 744 aa  77  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  30.61 
 
 		 834 aa  76.3  0.0000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3723  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.79 
 
 		 871 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.086011 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5039  signal transduction histidine kinase  30.35 
 
 		 381 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1953  signal transduction histidine kinase  31.16 
 
 		 382 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 		 382 aa  75.9  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0623  signal transduction histidine kinase  30.1 
 
 		 334 aa  75.9  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.528714 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2752  Signal transduction histidine kinase  31.31 
 
 		 374 aa  75.5  0.0000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.25637  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0118  signal transduction histidine kinase  30.12 
 
 		 774 aa  75.5  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.844509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6649  signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 		 739 aa  75.5  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3670  signal transduction histidine kinase  26.9 
 
 		 832 aa  75.9  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4851  signal transduction histidine kinase  33.15 
 
 		 382 aa  75.1  0.0000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.141965  normal  0.0517417 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4236  signal transduction histidine kinase  26.53 
 
 		 771 aa  74.7  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4326  signal transduction histidine kinase  26.94 
 
 		 782 aa  74.7  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.173856 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  28.72 
 
 		 1239 aa  74.7  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6532  signal transduction histidine kinase  32.65 
 
 		 368 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0793858  normal  0.366363 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3192  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.41 
 
 		 864 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0309229 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4852  signal transduction histidine kinase  27.67 
 
 		 746 aa  73.9  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0325493 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 		 1676 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1628  Signal transduction histidine kinase  30.85 
 
 		 431 aa  73.9  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  25.89 
 
 		 681 aa  73.2  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_004310  BR1659  sensor histidine kinase  29.08 
 
 		 476 aa  72.8  0.000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3280  PAS sensor protein  33 
 
 		 354 aa  72.8  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3834  signal transduction histidine kinase  26.02 
 
 		 578 aa  73.2  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.391649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  27.55 
 
 		 1390 aa  73.2  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2024  signal transduction histidine kinase  29.61 
 
 		 497 aa  72.8  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.149212  normal  0.406004 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1483  sensory transduction histidine kinase  31.41 
 
 		 704 aa  72.4  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1607  sensor histidine kinase  29.08 
 
 		 437 aa  72.8  0.000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0765  signal transduction histidine kinase  24.54 
 
 		 495 aa  72.4  0.000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0891628  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11268  histidine kinase sensor protein  25.51 
 
 		 624 aa  72  0.000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2609  signal transduction histidine kinase  28.5 
 
 		 492 aa  71.6  0.000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.107933  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  29.59 
 
 		 941 aa  71.6  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  27.78 
 
 		 462 aa  71.6  0.000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1173  signal transduction histidine kinase  32.98 
 
 		 240 aa  71.6  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171534  normal  0.123801 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3478  putative signal transduction histidine kinase  30.35 
 
 		 354 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.293899 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1806  putative two-component sensor histidine kinase  29.35 
 
 		 341 aa  71.2  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  26.39 
 
 		 918 aa  70.5  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0119  signal transduction histidine kinase  25.74 
 
 		 757 aa  70.5  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 613 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1165  signal transduction histidine kinase  27.8 
 
 		 357 aa  70.9  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  34 
 
 		 2693 aa  70.1  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 1093 aa  69.7  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>