220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3643 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_3643  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 169 aa  346  9e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5574  MarR family transcriptional regulator  85.06 
 
 		 151 aa  263  8e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.23947  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0006  MarR family transcriptional regulator  65.62 
 
 		 137 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.862573  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3929  MarR family transcriptional regulator  63.28 
 
 		 137 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000979996 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0160  MarR family transcriptional regulator  65.62 
 
 		 141 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0438  MarR family transcriptional regulator  65.62 
 
 		 141 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37846  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1402  MarR family transcriptional regulator  65.62 
 
 		 137 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420686  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1139  MarR family transcriptional regulator  65.62 
 
 		 141 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1198  hypothetical protein  65.62 
 
 		 137 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.240784  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4485  MarR family transcriptional regulator  62.6 
 
 		 160 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.187713  normal  0.500577 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1487  MarR family transcriptional regulator  65.62 
 
 		 151 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1396  hypothetical protein  64.84 
 
 		 160 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0838  transcriptional regulator, MarR family  63.28 
 
 		 137 aa  170  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1303  MarR family transcriptional regulator  63.28 
 
 		 137 aa  168  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.55267 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3966  MarR family transcriptional regulator  62.5 
 
 		 152 aa  168  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529361  normal  0.146935 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5762  MarR family transcriptional regulator  63.28 
 
 		 137 aa  168  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4118  MarR family transcriptional regulator  63.28 
 
 		 137 aa  168  4e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4428  MarR family transcriptional regulator  62.5 
 
 		 137 aa  167  5e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.400041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3826  MarR family transcriptional regulator  63.28 
 
 		 158 aa  167  6e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4542  MarR family transcriptional regulator  63.28 
 
 		 158 aa  167  6e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.660328  normal  0.070316 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6375  transcriptional regulator, MarR family  61.29 
 
 		 141 aa  160  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6376  transcriptional regulator, MarR family  57.35 
 
 		 138 aa  155  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.981115  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2430  putative transcription regulator protein  56.92 
 
 		 139 aa  155  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4133  MarR family transcriptional regulator  61.94 
 
 		 144 aa  150  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5023  MarR family transcriptional regulator  58.4 
 
 		 139 aa  150  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0800254  normal  0.152298 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2629  transcriptional regulator, MarR family  58.06 
 
 		 135 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2668  MarR family transcriptional regulator  58.68 
 
 		 139 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2698  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 		 145 aa  141  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2308  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 		 145 aa  141  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.511627  hitchhiker  0.000000675191 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3635  transcriptional regulator, MarR family  57.98 
 
 		 277 aa  138  4.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00150416  normal  0.0211816 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6567  MarR family transcriptional regulator  60.33 
 
 		 141 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2872  MarR family transcriptional regulator  51.69 
 
 		 156 aa  120  7e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.924604  normal  0.788134 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1083  transcriptional regulator, MarR family  47.9 
 
 		 149 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2951  MarR family transcriptional regulator  48.62 
 
 		 162 aa  108  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2084  MarR family transcriptional regulator  44 
 
 		 155 aa  95.9  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4535  transcriptional regulator, MarR family  42.24 
 
 		 145 aa  93.6  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0652033 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3156  MarR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 141 aa  91.7  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.646258 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0314  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 153 aa  88.6  4e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6391  transcriptional regulator, MarR family  40.34 
 
 		 144 aa  88.2  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.666517 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3938  MarR family transcriptional regulator  42.02 
 
 		 145 aa  85.9  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.556639  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0771  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 138 aa  84.3  7e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.15812  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2093  transcriptional regulator, MarR family  39.5 
 
 		 148 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5811  MarR family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 155 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283873 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5413  transcriptional regulator, MarR family  40.5 
 
 		 146 aa  76.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.173086 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0720  MarR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 139 aa  75.5  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5348  MarR family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 142 aa  75.1  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5962  transcriptional regulator, MarR family  39.83 
 
 		 155 aa  73.6  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0061  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 171 aa  53.5  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5315  transcriptional regulator, MarR family  32.28 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.342614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  30.85 
 
 		 169 aa  51.2  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2472  MarR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 147 aa  50.8  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161606  normal  0.735248 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1381  transcriptional regulator, MarR family  33.62 
 
 		 167 aa  50.8  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15300  transcriptional regulator, MarR family  34.21 
 
 		 162 aa  50.4  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408936  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3178  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 154 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.137994  normal  0.81725 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2500  MarR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 178 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.129036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2306  putative transcriptional regulator  31.48 
 
 		 151 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2956  MarR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 153 aa  49.7  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.119179 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0515  MarR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 140 aa  48.5  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 156 aa  48.5  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1790  transcriptional regulator, MarR family  32.22 
 
 		 174 aa  47.8  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5714  MarR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 153 aa  47.8  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966957 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3111  MarR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 142 aa  47.8  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 145 aa  47.8  0.00008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  35.44 
 
 		 147 aa  47.4  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0705  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 156 aa  47.4  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.186956  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0818  transcriptional regulator, MarR family  34.12 
 
 		 147 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0498  transcriptional regulator, MarR family  34.88 
 
 		 160 aa  47.4  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000167628  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0830  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 161 aa  47  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.170998  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02614  putative transcription regulator protein  30.09 
 
 		 153 aa  46.6  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532202  normal  0.750512 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  40 
 
 		 162 aa  46.2  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6009  transcriptional regulator, MarR family  34.91 
 
 		 190 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  27.12 
 
 		 156 aa  46.6  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3996  MarR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000674162  normal  0.401287 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2185  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 172 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5446  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 219 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.668367 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5843  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 200 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 172 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 172 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1524  MarR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 145 aa  46.6  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 172 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  38.38 
 
 		 168 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 172 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1843  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0987  MarR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 167 aa  46.6  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  34.69 
 
 		 159 aa  45.8  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1435  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209441 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  26.73 
 
 		 142 aa  45.8  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3272  MarR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 154 aa  45.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1068  MarR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5904  transcriptional regulator, MarR family  29.46 
 
 		 172 aa  45.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3371  regulatory protein, MarR  35.35 
 
 		 160 aa  45.8  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3597  MarR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 153 aa  45.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 186 aa  45.4  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  36.99 
 
 		 162 aa  45.4  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06220  transcriptional regulator, MarR family  39.44 
 
 		 169 aa  45.4  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0410  transcriptional regulator, MarR family  27.88 
 
 		 152 aa  45.1  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3738  transcriptional regulator, MarR family  38.03 
 
 		 153 aa  45.1  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000310515  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2629  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 160 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8863  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>