More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2675 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2675  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 667 aa  1303    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1607  outer membrane protein, TonB-dependent receptor  23.99 
 
 		 641 aa  179  1e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.497868  normal  0.881416 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3545  TonB-dependent receptor  31.67 
 
 		 666 aa  144  8e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0336  TonB-dependent receptor  30.74 
 
 		 649 aa  140  7e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3462  TonB-dependent receptor  32.04 
 
 		 668 aa  138  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4100  TonB-dependent receptor  25.2 
 
 		 630 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.975186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3613  TonB-dependent receptor plug  31.25 
 
 		 664 aa  135  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659898  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02166  TonB-dependent outer membrane Receptor  27.27 
 
 		 619 aa  130  6e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3941  TonB-dependent receptor  23.51 
 
 		 670 aa  124  7e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.783014  normal  0.35768 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0350  TonB-dependent receptor  31.74 
 
 		 651 aa  122  3e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.513607  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0363  TonB-dependent receptor plug  32.25 
 
 		 649 aa  121  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0834  vitamin B12 receptor BtuB, putative  27.35 
 
 		 680 aa  120  6e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.162621  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5793  TonB-dependent receptor plug  26.46 
 
 		 626 aa  117  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.128664 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3502  putative outer membrane cobalamin receptor, TonB dependent  27.22 
 
 		 623 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.86203  normal  0.929142 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2209  TonB-dependent receptor  26.55 
 
 		 624 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1918  TonB-dependent receptor  21.88 
 
 		 687 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.138807  normal  0.178557 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2815  TonB-dependent receptor  27.79 
 
 		 619 aa  114  4.0000000000000004e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.186668  normal  0.478128 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4773  TonB-dependent receptor  27.26 
 
 		 624 aa  113  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.386912  normal  0.53176 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1187  outer membrane receptor for transport of vitamin B  27.4 
 
 		 821 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.096047  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3735  TonB-dependent receptor plug  25.04 
 
 		 628 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000331916  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2400  outer membrane receptor protein  26.62 
 
 		 621 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.901841 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1639  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  27.19 
 
 		 685 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.18341  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0995  TonB-dependent receptor  27.02 
 
 		 629 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.864049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2327  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  27.19 
 
 		 685 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.52571  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2959  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  27.19 
 
 		 685 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1035  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  27.2 
 
 		 685 aa  112  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127064  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  27.27 
 
 		 628 aa  112  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1028  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  27.2 
 
 		 685 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1096  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 		 626 aa  111  4.0000000000000004e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0091  TonB-dependent receptor  23.05 
 
 		 607 aa  111  5e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1347  iron compound TonB-dependent receptor, putative  25.52 
 
 		 620 aa  109  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0685  vitamin B12 receptor BtuB, putative  26.98 
 
 		 685 aa  110  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.174842  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1875  TonB-dependent receptor  21.18 
 
 		 681 aa  109  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1012  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 626 aa  109  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0654  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 		 638 aa  108  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.561107  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3206  TonB-dependent receptor plug  24.03 
 
 		 617 aa  108  5e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00965358  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2667  TonB-dependent receptor  25.57 
 
 		 627 aa  107  6e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0986558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1065  TonB-dependent receptor  28.31 
 
 		 611 aa  107  9e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.362217 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1537  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 		 593 aa  106  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00891985  normal  0.735799 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3572  TonB-dependent receptor plug  29.7 
 
 		 653 aa  106  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.102808  normal  0.0129675 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2213  TonB-dependent receptor plug  26.04 
 
 		 621 aa  105  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.604823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1306  putative iron compound TonB-dependent receptor  25.36 
 
 		 697 aa  106  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  27.44 
 
 		 613 aa  104  4e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  26.83 
 
 		 639 aa  103  1e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0273  TonB-dependent receptor  26.27 
 
 		 602 aa  102  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0292443  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  26.53 
 
 		 617 aa  102  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2402  putative TonB dependent vitamin B12 outer membrane receptor  27.71 
 
 		 611 aa  101  5e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002156  outer membrane vitamin B12 receptor BtuB  24.32 
 
 		 611 aa  100  9e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000122091  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 		 634 aa  100  9e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5008  TonB-dependent receptor  24.2 
 
 		 627 aa  100  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.877838 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4173  TonB-dependent receptor  25.72 
 
 		 638 aa  99.4  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.422037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0461  TonB-dependent vitamin B12 receptor  24.83 
 
 		 613 aa  99.8  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00224002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0578  TonB-dependent receptor plug  25.16 
 
 		 627 aa  98.6  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0571  TonB-dependent receptor plug  24.68 
 
 		 628 aa  97.8  6e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.487741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1926  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 627 aa  95.9  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.201933  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1162  tonB-dependent vitamin B12 receptor  24.41 
 
 		 622 aa  95.5  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  24.75 
 
 		 657 aa  95.1  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  25.33 
 
 		 648 aa  95.5  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1541  TonB-dependent receptor  22.5 
 
 		 665 aa  95.5  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000885863  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2342  TonB-dependent receptor  24.04 
 
 		 611 aa  95.1  4e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.499314  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2789  TonB-dependent receptor  26.02 
 
 		 698 aa  94.7  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.973502 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4119  TonB-dependent vitamin B12 receptor  27.02 
 
 		 616 aa  94.7  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4821  TonB-dependent receptor  21.76 
 
 		 621 aa  94.4  6e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4414  TonB-dependent receptor plug  25.61 
 
 		 639 aa  94  9e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3189  TonB-dependent receptor, plug  26.63 
 
 		 623 aa  93.2  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0525  B12 family TonB-dependent receptor  26.1 
 
 		 641 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6080  putative TonB-dependent receptor  27.16 
 
 		 690 aa  92.4  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  25.87 
 
 		 633 aa  92.8  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1142  TonB-dependent receptor-related protein  24.78 
 
 		 650 aa  92.4  3e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.22175  normal  0.0805488 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1262  TonB-dependent receptor  24.01 
 
 		 651 aa  91.7  4e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.612585  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2165  TonB-dependent vitamin B12 receptor  22.71 
 
 		 616 aa  91.3  5e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0521  TonB-dependent receptor  27.71 
 
 		 617 aa  91.3  5e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0123  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.54 
 
 		 631 aa  91.3  6e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000105264  normal  0.11479 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1519  TonB-dependent receptor  24.36 
 
 		 657 aa  89  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.148558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0111  TonB-dependent receptor  26.48 
 
 		 681 aa  88.6  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.643916  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1473  TonB-dependent receptor  25.47 
 
 		 669 aa  88.2  4e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220648 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0488  TonB-dependent receptor  27.53 
 
 		 682 aa  88.2  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1186  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 		 634 aa  88.2  5e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.874956  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1115  TonB-dependent receptor  23.07 
 
 		 649 aa  87.8  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.95294  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  24.42 
 
 		 656 aa  86.7  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0028  TonB-dependent receptor  25.34 
 
 		 641 aa  86.7  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  24.96 
 
 		 652 aa  87  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000507235  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1826  TonB-dependent receptor  22.44 
 
 		 621 aa  86.3  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.568285  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  24.15 
 
 		 634 aa  86.3  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1014  TonB-dependent receptor-related protein  23.26 
 
 		 647 aa  85.9  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  24.09 
 
 		 659 aa  86.3  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3767  TonB-dependent receptor  23.8 
 
 		 653 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1004  TonB-dependent receptor  26.82 
 
 		 618 aa  85.5  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0684927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3302  TonB-dependent siderophore receptor  24.43 
 
 		 653 aa  85.1  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00384842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2514  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 		 632 aa  85.5  0.000000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  25.05 
 
 		 640 aa  85.1  0.000000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3644  TonB-dependent receptor  23.95 
 
 		 653 aa  84.7  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.388894  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0815  TonB-dependent receptor domain-containing protein  25.32 
 
 		 653 aa  84  0.000000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0651  TonB-dependent siderophore receptor  24.11 
 
 		 653 aa  84.3  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.68611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5430  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.19 
 
 		 614 aa  84.3  0.000000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0043717  normal  0.0207602 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3472  TonB-dependent siderophore receptor  24.27 
 
 		 653 aa  84.3  0.000000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0503687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0560  TonB-dependent receptor, plug  25.05 
 
 		 623 aa  83.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1115  TonB-dependent receptor  32.55 
 
 		 705 aa  83.6  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4507  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  23.16 
 
 		 614 aa  82.4  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000315572  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4200  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  23.16 
 
 		 614 aa  82.8  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000101627  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>